RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425112.1

TTC28-AS1-205, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.08■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SHROOM2Q13796 1616 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-205ENST00000425112 JPH4Q96JJ6 628 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-205ENST00000425112 IGF1RP08069 1367 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KIF27Q86VH2 1401 aa17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADRA2BP18089 450 aa17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CUL7Q14999 1698 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MAPKBP1O60336 1514 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PTPRGP23470 1445 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.69■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-205ENST00000425112 IQGAP2Q13576 1575 aa17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DIP2BQ9P265 1576 aa17.66■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCC2Q92887 1545 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DISP1Q96F81 1524 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 UACAQ9BZF9 1416 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.58■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ASXL2Q76L83 1435 aa17.57■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MSH5O43196 834 aa17.56■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.54■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PRXQ9BXM0 1461 aa17.54■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KIAA0556O60303 1618 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GLI2P10070 1586 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GOLGA3Q08378 1498 aa17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KDM6BO15054 1643 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.39■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TSPOAP1O95153 1857 aa17.38■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCA8O94911 1581 aa17.38■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.37■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.36■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EEA1Q15075 1411 aa17.34■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CD109Q6YHK3 1445 aa17.3■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.3■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-205ENST00000425112 P3H3Q8IVL6 736 aa17.29■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KCNH8Q96L42 1107 aa17.29■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ATP10BO94823 1461 aa17.27■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SAMD9Q5K651 1589 aa17.25■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARID3CA6NKF2 412 aa17.22■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.21■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADGRL1O94910 1474 aa17.21■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.17■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.16■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.16■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.15■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KIF21BO75037 1637 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.13■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.11■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NEO1Q92859 1461 aa17.1■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.09■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RAPGEF3O95398 923 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-205ENST00000425112 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FMN1Q68DA7 1419 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 AKNAQ7Z591 1439 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FANCAO15360 1455 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PLCH2O75038 1416 aa16.92■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.91■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PTPRMP28827 1452 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HECW1Q76N89 1606 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms