RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425112.1

TTC28-AS1-205, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.72■■□□□ 1.71
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.89■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NACADO15069 1562 aa21.78■■□□□ 1.08
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 SMARCA2P51531 1590 aa20■□□□□ 0.79
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 ERCC6Q03468 1493 aa19.85■□□□□ 0.77
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.28■□□□□ 0.68
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.65■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARHGEF11O15085 1522 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.6■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.6■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 WDR97A6NE52 1622 aa18.56■□□□□ 0.56
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 CHD1O14646 1710 aa18.49■□□□□ 0.55
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TTC28-AS1-205ENST00000425112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SYNJ2O15056 1496 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARAP1Q96P48 1450 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SYNJ1O43426 1573 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.34■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TOP2BQ02880 1626 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PBRM1Q86U86 1689 aa18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GRIN2AQ12879 1464 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NUP160Q12769 1436 aa18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADAMTS12P58397 1594 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CEP170Q5SW79 1584 aa18.13■□□□□ 0.49
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