RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425112.1

TTC28-AS1-205, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.72■■□□□ 1.71
TTC28-AS1-205ENST00000425112 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCC9O60706 1549 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.89■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NACADO15069 1562 aa21.78■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.29■■□□□ 1
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.25■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-205ENST00000425112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.24■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.07■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SCRIBQ14160 1630 aa20.92■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NCAPD3P42695 1498 aa20.17■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SMARCA4P51532 1647 aa20■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SMARCA2P51531 1590 aa20■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-205ENST00000425112 HMGXB3Q12766 1538 aa19.97■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ERCC6Q03468 1493 aa19.85■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CUX2O14529 1486 aa19.84■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.82■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.79■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NESP48681 1621 aa19.75■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-205ENST00000425112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-205ENST00000425112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WIZO95785 1651 aa19.48■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-205ENST00000425112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CFTRP13569 1480 aa19.33■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WDR62O43379 1518 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-205ENST00000425112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-205ENST00000425112 OSCARQ8IYS5 282 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-205ENST00000425112 IFT140Q96RY7 1462 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PRDM2Q13029 1718 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TOPBP1Q92547 1522 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCC8Q09428 1581 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TRIM41Q8WV44 630 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FOXD1Q16676 465 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-205ENST00000425112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.82■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-205ENST00000425112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-205ENST00000425112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-205ENST00000425112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SOGA1O94964 1423 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARHGEF11O15085 1522 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CUX1P39880 1505 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FBLN2P98095 1184 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WDR97A6NE52 1622 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GRIN2BQ13224 1484 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CHD1O14646 1710 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SYNJ2O15056 1496 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ARAP1Q96P48 1450 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-205ENST00000425112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-205ENST00000425112 SYNJ1O43426 1573 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.34■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TOP2BQ02880 1626 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-205ENST00000425112 PBRM1Q86U86 1689 aa18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-205ENST00000425112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 GRIN2AQ12879 1464 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 NUP160Q12769 1436 aa18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ADAMTS12P58397 1594 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-205ENST00000425112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-205ENST00000425112 CEP170Q5SW79 1584 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms