RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
PMS1-205ENST00000409985 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.01■■■■□ 3.36
PMS1-205ENST00000409985 CUL7Q14999 1698 aa35.98■■■■□ 3.35
PMS1-205ENST00000409985 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.96■■■■□ 3.35
PMS1-205ENST00000409985 APLP2Q06481 763 aa35.96■■■■□ 3.35
PMS1-205ENST00000409985 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
PMS1-205ENST00000409985 SYNJ2O15056 1496 aa35.91■■■■□ 3.34
PMS1-205ENST00000409985 ARAP1Q96P48 1450 aa35.86■■■■□ 3.33
PMS1-205ENST00000409985 FBLN2P98095 1184 aa35.84■■■■□ 3.33
PMS1-205ENST00000409985 CHD1O14646 1710 aa35.84■■■■□ 3.33
PMS1-205ENST00000409985 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.33
PMS1-205ENST00000409985 GRIN2AQ12879 1464 aa35.81■■■■□ 3.32
PMS1-205ENST00000409985 CEP170Q5SW79 1584 aa35.67■■■■□ 3.3
PMS1-205ENST00000409985 NUP160Q12769 1436 aa35.63■■■■□ 3.29
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.6■■■■□ 3.29
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K1Q13233 1512 aa35.52■■■■□ 3.28
PMS1-205ENST00000409985 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
PMS1-205ENST00000409985 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.49■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.48■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 OSCARQ8IYS5 282 aa35.47■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.45■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.45■■■■□ 3.27
PMS1-205ENST00000409985 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PMS1-205ENST00000409985 IQGAP2Q13576 1575 aa35.38■■■■□ 3.25
PMS1-205ENST00000409985 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
PMS1-205ENST00000409985 JPH4Q96JJ6 628 aa35.28■■■■□ 3.24
PMS1-205ENST00000409985 TIAM1Q13009 1591 aa35.27■■■■□ 3.24
PMS1-205ENST00000409985 SHROOM2Q13796 1616 aa35.26■■■■□ 3.24
PMS1-205ENST00000409985 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.23■■■■□ 3.23
PMS1-205ENST00000409985 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.23■■■■□ 3.23
PMS1-205ENST00000409985 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.18■■■■□ 3.22
PMS1-205ENST00000409985 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.18■■■■□ 3.22
PMS1-205ENST00000409985 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PMS1-205ENST00000409985 DISP1Q96F81 1524 aa35.17■■■■□ 3.22
PMS1-205ENST00000409985 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
PMS1-205ENST00000409985 SAMD9Q5K651 1589 aa35.11■■■■□ 3.21
PMS1-205ENST00000409985 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.11■■■■□ 3.21
PMS1-205ENST00000409985 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.1■■■■□ 3.21
PMS1-205ENST00000409985 P3H3Q8IVL6 736 aa35.09■■■■□ 3.21
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0556O60303 1618 aa35.06■■■■□ 3.2
PMS1-205ENST00000409985 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PMS1-205ENST00000409985 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PMS1-205ENST00000409985 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.01■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF11O15085 1522 aa34.96■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.95■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.95■■■■□ 3.19
PMS1-205ENST00000409985 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
PMS1-205ENST00000409985 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
PMS1-205ENST00000409985 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
PMS1-205ENST00000409985 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.17
PMS1-205ENST00000409985 FMN1Q68DA7 1419 aa34.87■■■■□ 3.17
PMS1-205ENST00000409985 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.81■■■■□ 3.16
PMS1-205ENST00000409985 NEUROD1Q13562 356 aa34.81■■■■□ 3.16
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.79■■■■□ 3.16
PMS1-205ENST00000409985 PTPRGP23470 1445 aa34.78■■■■□ 3.16
PMS1-205ENST00000409985 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.77■■■■□ 3.16
PMS1-205ENST00000409985 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.76■■■■□ 3.15
PMS1-205ENST00000409985 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.72■■■■□ 3.15
PMS1-205ENST00000409985 ABCA8O94911 1581 aa34.64■■■■□ 3.14
PMS1-205ENST00000409985 MAPKBP1O60336 1514 aa34.63■■■■□ 3.13
PMS1-205ENST00000409985 MIER1Q8N108 512 aa34.62■■■■□ 3.13
PMS1-205ENST00000409985 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.61■■■■□ 3.13
PMS1-205ENST00000409985 UACAQ9BZF9 1416 aa34.58■■■■□ 3.13
PMS1-205ENST00000409985 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.58■■■■□ 3.13
PMS1-205ENST00000409985 ITGAEP38570 1179 aa34.58■■■■□ 3.13
PMS1-205ENST00000409985 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.54■■■■□ 3.12
PMS1-205ENST00000409985 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
PMS1-205ENST00000409985 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.53■■■■□ 3.12
PMS1-205ENST00000409985 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.52■■■■□ 3.12
PMS1-205ENST00000409985 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
PMS1-205ENST00000409985 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
PMS1-205ENST00000409985 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.51■■■■□ 3.11
PMS1-205ENST00000409985 ABCC2Q92887 1545 aa34.51■■■■□ 3.11
PMS1-205ENST00000409985 ARID3CA6NKF2 412 aa34.5■■■■□ 3.11
PMS1-205ENST00000409985 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
PMS1-205ENST00000409985 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.47■■■■□ 3.11
PMS1-205ENST00000409985 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.45■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.44■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 HECW1Q76N89 1606 aa34.43■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.43■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.42■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 ATP10BO94823 1461 aa34.39■■■■□ 3.1
PMS1-205ENST00000409985 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.36■■■■□ 3.09
PMS1-205ENST00000409985 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.36■■■■□ 3.09
PMS1-205ENST00000409985 NCOA2Q15596 1464 aa34.35■■■■□ 3.09
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
PMS1-205ENST00000409985 HFM1A2PYH4 1435 aa34.31■■■■□ 3.08
PMS1-205ENST00000409985 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.25■■■■□ 3.07
PMS1-205ENST00000409985 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.21■■■■□ 3.07
PMS1-205ENST00000409985 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
PMS1-205ENST00000409985 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
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