RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
LRRTM1-202ENST00000409148 ERCC6Q03468 1493 aa25.99■■□□□ 1.75
LRRTM1-202ENST00000409148 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
LRRTM1-202ENST00000409148 TIAM1Q13009 1591 aa25.97■■□□□ 1.75
LRRTM1-202ENST00000409148 PBRM1Q86U86 1689 aa25.95■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 WDR62O43379 1518 aa25.91■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.89■■□□□ 1.74
LRRTM1-202ENST00000409148 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.89■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 IFT140Q96RY7 1462 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 P3H3Q8IVL6 736 aa25.85■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 SAMD9Q5K651 1589 aa25.84■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.83■■□□□ 1.73
LRRTM1-202ENST00000409148 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.82■■□□□ 1.72
LRRTM1-202ENST00000409148 FMN1Q68DA7 1419 aa25.82■■□□□ 1.72
LRRTM1-202ENST00000409148 ADAMTS12P58397 1594 aa25.82■■□□□ 1.72
LRRTM1-202ENST00000409148 GRIN2BQ13224 1484 aa25.81■■□□□ 1.72
LRRTM1-202ENST00000409148 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRTM1-202ENST00000409148 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.71■■□□□ 1.71
LRRTM1-202ENST00000409148 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
LRRTM1-202ENST00000409148 IQGAP2Q13576 1575 aa25.68■■□□□ 1.7
LRRTM1-202ENST00000409148 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
LRRTM1-202ENST00000409148 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.63■■□□□ 1.69
LRRTM1-202ENST00000409148 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRTM1-202ENST00000409148 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.56■■□□□ 1.68
LRRTM1-202ENST00000409148 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRTM1-202ENST00000409148 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LRRTM1-202ENST00000409148 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
LRRTM1-202ENST00000409148 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.51■■□□□ 1.68
LRRTM1-202ENST00000409148 GRIN2AQ12879 1464 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.5■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.5■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 ITGAEP38570 1179 aa25.5■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 HECW1Q76N89 1606 aa25.5■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.47■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
LRRTM1-202ENST00000409148 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LRRTM1-202ENST00000409148 SYNJ2O15056 1496 aa25.42■■□□□ 1.66
LRRTM1-202ENST00000409148 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRTM1-202ENST00000409148 KIAA0556O60303 1618 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRTM1-202ENST00000409148 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.4■■□□□ 1.66
LRRTM1-202ENST00000409148 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.4■■□□□ 1.66
LRRTM1-202ENST00000409148 NCOA2Q15596 1464 aa25.39■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 DISP1Q96F81 1524 aa25.36■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.34■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 CEP170Q5SW79 1584 aa25.33■■□□□ 1.65
LRRTM1-202ENST00000409148 ARHGEF11O15085 1522 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRTM1-202ENST00000409148 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRTM1-202ENST00000409148 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
LRRTM1-202ENST00000409148 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
LRRTM1-202ENST00000409148 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
LRRTM1-202ENST00000409148 NUP160Q12769 1436 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRTM1-202ENST00000409148 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.25■■□□□ 1.63
LRRTM1-202ENST00000409148 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.24■■□□□ 1.63
LRRTM1-202ENST00000409148 FBLN2P98095 1184 aa25.22■■□□□ 1.63
LRRTM1-202ENST00000409148 MAPKBP1O60336 1514 aa25.21■■□□□ 1.63
LRRTM1-202ENST00000409148 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRTM1-202ENST00000409148 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRTM1-202ENST00000409148 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRTM1-202ENST00000409148 HFM1A2PYH4 1435 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRTM1-202ENST00000409148 MIA2Q96PC5 1412 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRTM1-202ENST00000409148 PTPRKQ15262 1439 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRTM1-202ENST00000409148 JPH4Q96JJ6 628 aa25.12■■□□□ 1.61
LRRTM1-202ENST00000409148 ARID3CA6NKF2 412 aa25.1■■□□□ 1.61
LRRTM1-202ENST00000409148 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
LRRTM1-202ENST00000409148 NAIPQ13075 1403 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRTM1-202ENST00000409148 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRTM1-202ENST00000409148 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.01■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 AKNAQ7Z591 1439 aa25.01■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 UACAQ9BZF9 1416 aa25.01■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 CHD1O14646 1710 aa25■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 ABCA8O94911 1581 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.97■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.97■■□□□ 1.59
LRRTM1-202ENST00000409148 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRTM1-202ENST00000409148 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
LRRTM1-202ENST00000409148 MYT1Q01538 1121 aa24.92■■□□□ 1.58
LRRTM1-202ENST00000409148 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
LRRTM1-202ENST00000409148 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRTM1-202ENST00000409148 DAPK1P53355 1430 aa24.89■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 NEUROD1Q13562 356 aa24.89■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 KIF14Q15058 1648 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 ROCK1Q13464 1354 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 SHROOM2Q13796 1616 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 PTPRGP23470 1445 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 ATP10BO94823 1461 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRTM1-202ENST00000409148 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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