RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.48■■■■□ 3.59
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.4■■■□□ 2.78
LRRTM1-202ENST00000409148 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
LRRTM1-202ENST00000409148 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.07■■■□□ 2.56
LRRTM1-202ENST00000409148 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.96■■■□□ 2.55
LRRTM1-202ENST00000409148 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.83■■■□□ 2.53
LRRTM1-202ENST00000409148 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.36■■■□□ 2.45
LRRTM1-202ENST00000409148 ABCC9O60706 1549 aa30.27■■■□□ 2.44
LRRTM1-202ENST00000409148 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
LRRTM1-202ENST00000409148 NACADO15069 1562 aa30.02■■■□□ 2.4
LRRTM1-202ENST00000409148 SCRIBQ14160 1630 aa29.93■■■□□ 2.38
LRRTM1-202ENST00000409148 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.64■■■□□ 2.34
LRRTM1-202ENST00000409148 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
LRRTM1-202ENST00000409148 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.19■■■□□ 2.26
LRRTM1-202ENST00000409148 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.09■■■□□ 2.25
LRRTM1-202ENST00000409148 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.09■■■□□ 2.25
LRRTM1-202ENST00000409148 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.99■■■□□ 2.23
LRRTM1-202ENST00000409148 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
LRRTM1-202ENST00000409148 WIZO95785 1651 aa28.81■■■□□ 2.2
LRRTM1-202ENST00000409148 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.72■■■□□ 2.19
LRRTM1-202ENST00000409148 SMARCA4P51532 1647 aa28.7■■■□□ 2.18
LRRTM1-202ENST00000409148 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
LRRTM1-202ENST00000409148 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
LRRTM1-202ENST00000409148 TRIM41Q8WV44 630 aa28.33■■■□□ 2.13
LRRTM1-202ENST00000409148 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.29■■■□□ 2.12
LRRTM1-202ENST00000409148 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
LRRTM1-202ENST00000409148 SMARCA2P51531 1590 aa28.26■■■□□ 2.12
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.22■■■□□ 2.11
LRRTM1-202ENST00000409148 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.11■■■□□ 2.09
LRRTM1-202ENST00000409148 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.05■■■□□ 2.08
LRRTM1-202ENST00000409148 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ABCC8Q09428 1581 aa27.86■■■□□ 2.05
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
LRRTM1-202ENST00000409148 HMGXB3Q12766 1538 aa27.73■■■□□ 2.03
LRRTM1-202ENST00000409148 NCAPD3P42695 1498 aa27.7■■■□□ 2.02
LRRTM1-202ENST00000409148 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
LRRTM1-202ENST00000409148 EEA1Q15075 1411 aa27.52■■■□□ 2
LRRTM1-202ENST00000409148 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.5■■□□□ 1.99
LRRTM1-202ENST00000409148 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.47■■□□□ 1.99
LRRTM1-202ENST00000409148 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.46■■□□□ 1.99
LRRTM1-202ENST00000409148 SYNJ1O43426 1573 aa27.46■■□□□ 1.99
LRRTM1-202ENST00000409148 SOGA1O94964 1423 aa27.44■■□□□ 1.98
LRRTM1-202ENST00000409148 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
LRRTM1-202ENST00000409148 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.31■■□□□ 1.96
LRRTM1-202ENST00000409148 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.3■■□□□ 1.96
LRRTM1-202ENST00000409148 TOP2BQ02880 1626 aa27.29■■□□□ 1.96
LRRTM1-202ENST00000409148 CFTRP13569 1480 aa27.27■■□□□ 1.96
LRRTM1-202ENST00000409148 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.26■■□□□ 1.95
LRRTM1-202ENST00000409148 HRCP23327 699 aa27.2■■□□□ 1.95
LRRTM1-202ENST00000409148 PRDM2Q13029 1718 aa27.2■■□□□ 1.95
LRRTM1-202ENST00000409148 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.2■■□□□ 1.94
LRRTM1-202ENST00000409148 GOLGA3Q08378 1498 aa27.18■■□□□ 1.94
LRRTM1-202ENST00000409148 KIF21BO75037 1637 aa27.14■■□□□ 1.93
LRRTM1-202ENST00000409148 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.12■■□□□ 1.93
LRRTM1-202ENST00000409148 CEP162Q5TB80 1403 aa27.12■■□□□ 1.93
LRRTM1-202ENST00000409148 CUX1P39880 1505 aa27.07■■□□□ 1.92
LRRTM1-202ENST00000409148 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
LRRTM1-202ENST00000409148 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.04■■□□□ 1.92
LRRTM1-202ENST00000409148 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.91■■□□□ 1.9
LRRTM1-202ENST00000409148 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.87■■□□□ 1.89
LRRTM1-202ENST00000409148 KIF27Q86VH2 1401 aa26.84■■□□□ 1.89
LRRTM1-202ENST00000409148 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.83■■□□□ 1.89
LRRTM1-202ENST00000409148 PRXQ9BXM0 1461 aa26.79■■□□□ 1.88
LRRTM1-202ENST00000409148 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.77■■□□□ 1.88
LRRTM1-202ENST00000409148 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
LRRTM1-202ENST00000409148 CLIP1P30622 1438 aa26.77■■□□□ 1.88
LRRTM1-202ENST00000409148 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRTM1-202ENST00000409148 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRTM1-202ENST00000409148 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRTM1-202ENST00000409148 CUX2O14529 1486 aa26.64■■□□□ 1.85
LRRTM1-202ENST00000409148 NESP48681 1621 aa26.63■■□□□ 1.85
LRRTM1-202ENST00000409148 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.62■■□□□ 1.85
LRRTM1-202ENST00000409148 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LRRTM1-202ENST00000409148 TOPBP1Q92547 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
LRRTM1-202ENST00000409148 IGF1RP08069 1367 aa26.51■■□□□ 1.83
LRRTM1-202ENST00000409148 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
LRRTM1-202ENST00000409148 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
LRRTM1-202ENST00000409148 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.46■■□□□ 1.83
LRRTM1-202ENST00000409148 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.45■■□□□ 1.82
LRRTM1-202ENST00000409148 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
LRRTM1-202ENST00000409148 APLP2Q06481 763 aa26.41■■□□□ 1.82
LRRTM1-202ENST00000409148 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.41■■□□□ 1.82
LRRTM1-202ENST00000409148 ARAP1Q96P48 1450 aa26.41■■□□□ 1.82
LRRTM1-202ENST00000409148 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
LRRTM1-202ENST00000409148 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.39■■□□□ 1.81
LRRTM1-202ENST00000409148 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.33■■□□□ 1.81
LRRTM1-202ENST00000409148 WDR97A6NE52 1622 aa26.33■■□□□ 1.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.3■■□□□ 1.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CUL7Q14999 1698 aa26.29■■□□□ 1.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.2■■□□□ 1.78
LRRTM1-202ENST00000409148 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
LRRTM1-202ENST00000409148 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
LRRTM1-202ENST00000409148 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.11■■□□□ 1.77
LRRTM1-202ENST00000409148 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.11■■□□□ 1.77
LRRTM1-202ENST00000409148 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
LRRTM1-202ENST00000409148 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.08■■□□□ 1.77
LRRTM1-202ENST00000409148 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
LRRTM1-202ENST00000409148 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.05■■□□□ 1.76
LRRTM1-202ENST00000409148 MAP3K1Q13233 1512 aa26.03■■□□□ 1.76
LRRTM1-202ENST00000409148 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.02■■□□□ 1.76
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