RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407684.1

GAREM2-202, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GAREM2, Length 5,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-202ENST00000407684 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.54■■□□□ 1.52
GAREM2-202ENST00000407684 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.5■■□□□ 1.51
GAREM2-202ENST00000407684 TOP2BQ02880 1626 aa24.49■■□□□ 1.51
GAREM2-202ENST00000407684 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.48■■□□□ 1.51
GAREM2-202ENST00000407684 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.47■■□□□ 1.51
GAREM2-202ENST00000407684 IGF1RP08069 1367 aa24.47■■□□□ 1.51
GAREM2-202ENST00000407684 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.46■■□□□ 1.51
GAREM2-202ENST00000407684 CUX1P39880 1505 aa24.44■■□□□ 1.5
GAREM2-202ENST00000407684 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.44■■□□□ 1.5
GAREM2-202ENST00000407684 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.42■■□□□ 1.5
GAREM2-202ENST00000407684 TOPBP1Q92547 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
GAREM2-202ENST00000407684 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.41■■□□□ 1.5
GAREM2-202ENST00000407684 FMN1Q68DA7 1419 aa24.38■■□□□ 1.49
GAREM2-202ENST00000407684 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.36■■□□□ 1.49
GAREM2-202ENST00000407684 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GAREM2-202ENST00000407684 TSPY4P0CV99 314 aa24.31■■□□□ 1.48
GAREM2-202ENST00000407684 TSPY10P0CW01 314 aa24.31■■□□□ 1.48
GAREM2-202ENST00000407684 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GAREM2-202ENST00000407684 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.3■■□□□ 1.48
GAREM2-202ENST00000407684 KIF21BO75037 1637 aa24.27■■□□□ 1.48
GAREM2-202ENST00000407684 IFT140Q96RY7 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 KCNH8Q96L42 1107 aa24.25■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.24■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.23■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 GRIN2BQ13224 1484 aa24.23■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 JPH4Q96JJ6 628 aa24.2■■□□□ 1.47
GAREM2-202ENST00000407684 ANP32CO43423 234 aa24.2■■□□□ 1.46
GAREM2-202ENST00000407684 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.18■■□□□ 1.46
GAREM2-202ENST00000407684 PRXQ9BXM0 1461 aa24.16■■□□□ 1.46
GAREM2-202ENST00000407684 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GAREM2-202ENST00000407684 BCANQ96GW7 911 aa24.13■■□□□ 1.45
GAREM2-202ENST00000407684 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.13■■□□□ 1.45
GAREM2-202ENST00000407684 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.12■■□□□ 1.45
GAREM2-202ENST00000407684 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.1■■□□□ 1.45
GAREM2-202ENST00000407684 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.09■■□□□ 1.45
GAREM2-202ENST00000407684 TONSLQ96HA7 1378 aa24.07■■□□□ 1.44
GAREM2-202ENST00000407684 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.05■■□□□ 1.44
GAREM2-202ENST00000407684 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GAREM2-202ENST00000407684 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
GAREM2-202ENST00000407684 PTPRGP23470 1445 aa23.94■■□□□ 1.42
GAREM2-202ENST00000407684 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GAREM2-202ENST00000407684 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.93■■□□□ 1.42
GAREM2-202ENST00000407684 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.92■■□□□ 1.42
GAREM2-202ENST00000407684 OSCARQ8IYS5 282 aa23.91■■□□□ 1.42
GAREM2-202ENST00000407684 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.88■■□□□ 1.41
GAREM2-202ENST00000407684 CUL7Q14999 1698 aa23.87■■□□□ 1.41
GAREM2-202ENST00000407684 ARAP1Q96P48 1450 aa23.83■■□□□ 1.41
GAREM2-202ENST00000407684 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.82■■□□□ 1.4
GAREM2-202ENST00000407684 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.82■■□□□ 1.4
GAREM2-202ENST00000407684 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.77■■□□□ 1.4
GAREM2-202ENST00000407684 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 BCL11AQ9H165 835 aa23.76■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.75■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.75■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.74■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 SYNJ2O15056 1496 aa23.72■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 PRDM2Q13029 1718 aa23.72■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.71■■□□□ 1.39
GAREM2-202ENST00000407684 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.68■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.68■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.65■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 IQGAP2Q13576 1575 aa23.65■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 GRIN2AQ12879 1464 aa23.65■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.65■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 NEFMP07197 916 aa23.64■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.64■■□□□ 1.38
GAREM2-202ENST00000407684 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GAREM2-202ENST00000407684 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.61■■□□□ 1.37
GAREM2-202ENST00000407684 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GAREM2-202ENST00000407684 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.58■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.57■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 MIER1Q8N108 512 aa23.57■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.56■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 KANK1Q14678 1352 aa23.55■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.55■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 FKBP8Q14318 412 aa23.54■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 WDR62O43379 1518 aa23.53■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.53■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 HECW1Q76N89 1606 aa23.52■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 NCOA2Q15596 1464 aa23.52■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
GAREM2-202ENST00000407684 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.51■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 TIAM1Q13009 1591 aa23.49■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 RGL3Q3MIN7 710 aa23.48■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.47■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GAREM2-202ENST00000407684 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.46■■□□□ 1.35
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