RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TM2D2-201ENST00000397070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.21■■■□□ 2.11
TM2D2-201ENST00000397070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.11
TM2D2-201ENST00000397070 APLP2Q06481 763 aa28.2■■■□□ 2.1
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TM2D2-201ENST00000397070 SAMD9Q5K651 1589 aa28.16■■■□□ 2.1
TM2D2-201ENST00000397070 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.12■■■□□ 2.09
TM2D2-201ENST00000397070 MAP3K1Q13233 1512 aa28.12■■■□□ 2.09
TM2D2-201ENST00000397070 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TM2D2-201ENST00000397070 TIAM1Q13009 1591 aa28.06■■■□□ 2.08
TM2D2-201ENST00000397070 IQGAP2Q13576 1575 aa28.06■■■□□ 2.08
TM2D2-201ENST00000397070 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TM2D2-201ENST00000397070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.02■■■□□ 2.08
TM2D2-201ENST00000397070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TM2D2-201ENST00000397070 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28■■■□□ 2.07
TM2D2-201ENST00000397070 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.99■■■□□ 2.07
TM2D2-201ENST00000397070 FMN1Q68DA7 1419 aa27.95■■■□□ 2.06
TM2D2-201ENST00000397070 GRIN2AQ12879 1464 aa27.94■■■□□ 2.06
TM2D2-201ENST00000397070 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.93■■■□□ 2.06
TM2D2-201ENST00000397070 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.9■■■□□ 2.06
TM2D2-201ENST00000397070 SYNJ2O15056 1496 aa27.89■■■□□ 2.06
TM2D2-201ENST00000397070 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.88■■■□□ 2.05
TM2D2-201ENST00000397070 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.85■■■□□ 2.05
TM2D2-201ENST00000397070 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TM2D2-201ENST00000397070 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TM2D2-201ENST00000397070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.83■■■□□ 2.05
TM2D2-201ENST00000397070 P3H3Q8IVL6 736 aa27.83■■■□□ 2.05
TM2D2-201ENST00000397070 CEP170Q5SW79 1584 aa27.79■■■□□ 2.04
TM2D2-201ENST00000397070 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TM2D2-201ENST00000397070 KIAA0556O60303 1618 aa27.77■■■□□ 2.04
TM2D2-201ENST00000397070 HECW1Q76N89 1606 aa27.76■■■□□ 2.03
TM2D2-201ENST00000397070 NUP160Q12769 1436 aa27.7■■■□□ 2.03
TM2D2-201ENST00000397070 CHD1O14646 1710 aa27.68■■■□□ 2.02
TM2D2-201ENST00000397070 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.66■■■□□ 2.02
TM2D2-201ENST00000397070 DISP1Q96F81 1524 aa27.66■■■□□ 2.02
TM2D2-201ENST00000397070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TM2D2-201ENST00000397070 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.62■■■□□ 2.01
TM2D2-201ENST00000397070 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TM2D2-201ENST00000397070 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.61■■■□□ 2.01
TM2D2-201ENST00000397070 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
TM2D2-201ENST00000397070 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.57■■■□□ 2
TM2D2-201ENST00000397070 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TM2D2-201ENST00000397070 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TM2D2-201ENST00000397070 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
TM2D2-201ENST00000397070 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.52■■■□□ 2
TM2D2-201ENST00000397070 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TM2D2-201ENST00000397070 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.49■■□□□ 1.99
TM2D2-201ENST00000397070 FBLN2P98095 1184 aa27.48■■□□□ 1.99
TM2D2-201ENST00000397070 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.48■■□□□ 1.99
TM2D2-201ENST00000397070 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.45■■□□□ 1.98
TM2D2-201ENST00000397070 ARHGEF11O15085 1522 aa27.44■■□□□ 1.98
TM2D2-201ENST00000397070 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
TM2D2-201ENST00000397070 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TM2D2-201ENST00000397070 SHROOM2Q13796 1616 aa27.42■■□□□ 1.98
TM2D2-201ENST00000397070 NCOA2Q15596 1464 aa27.41■■□□□ 1.98
TM2D2-201ENST00000397070 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TM2D2-201ENST00000397070 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.37■■□□□ 1.97
TM2D2-201ENST00000397070 JPH4Q96JJ6 628 aa27.37■■□□□ 1.97
TM2D2-201ENST00000397070 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.34■■□□□ 1.97
TM2D2-201ENST00000397070 ABCA8O94911 1581 aa27.32■■□□□ 1.96
TM2D2-201ENST00000397070 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.32■■□□□ 1.96
TM2D2-201ENST00000397070 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.29■■□□□ 1.96
TM2D2-201ENST00000397070 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.25■■□□□ 1.95
TM2D2-201ENST00000397070 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.24■■□□□ 1.95
TM2D2-201ENST00000397070 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TM2D2-201ENST00000397070 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TM2D2-201ENST00000397070 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TM2D2-201ENST00000397070 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.22■■□□□ 1.95
TM2D2-201ENST00000397070 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.2■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 MIA2Q96PC5 1412 aa27.18■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.17■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 ITGAEP38570 1179 aa27.16■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TM2D2-201ENST00000397070 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.12■■□□□ 1.93
TM2D2-201ENST00000397070 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.11■■□□□ 1.93
TM2D2-201ENST00000397070 KIF14Q15058 1648 aa27.09■■□□□ 1.93
TM2D2-201ENST00000397070 PTPRGP23470 1445 aa27.08■■□□□ 1.93
TM2D2-201ENST00000397070 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.05■■□□□ 1.92
TM2D2-201ENST00000397070 ARID3CA6NKF2 412 aa27.05■■□□□ 1.92
TM2D2-201ENST00000397070 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.05■■□□□ 1.92
TM2D2-201ENST00000397070 ATP10BO94823 1461 aa27.04■■□□□ 1.92
TM2D2-201ENST00000397070 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TM2D2-201ENST00000397070 HFM1A2PYH4 1435 aa27.01■■□□□ 1.92
TM2D2-201ENST00000397070 PTPRKQ15262 1439 aa27■■□□□ 1.91
TM2D2-201ENST00000397070 AKNAQ7Z591 1439 aa26.99■■□□□ 1.91
TM2D2-201ENST00000397070 ABCC2Q92887 1545 aa26.99■■□□□ 1.91
TM2D2-201ENST00000397070 UACAQ9BZF9 1416 aa26.99■■□□□ 1.91
TM2D2-201ENST00000397070 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.97■■□□□ 1.91
TM2D2-201ENST00000397070 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.95■■□□□ 1.91
TM2D2-201ENST00000397070 MAPKBP1O60336 1514 aa26.95■■□□□ 1.9
TM2D2-201ENST00000397070 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.92■■□□□ 1.9
TM2D2-201ENST00000397070 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TM2D2-201ENST00000397070 NAIPQ13075 1403 aa26.91■■□□□ 1.9
TM2D2-201ENST00000397070 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.89■■□□□ 1.9
TM2D2-201ENST00000397070 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.88■■□□□ 1.89
TM2D2-201ENST00000397070 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.88■■□□□ 1.89
TM2D2-201ENST00000397070 DAPK1P53355 1430 aa26.87■■□□□ 1.89
TM2D2-201ENST00000397070 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms