RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375571.5

MAPRE1-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE1, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE1-201ENST00000375571 ERCC6Q03468 1493 aa26.39■■□□□ 1.81
MAPRE1-201ENST00000375571 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
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MAPRE1-201ENST00000375571 CUL7Q14999 1698 aa26.3■■□□□ 1.8
MAPRE1-201ENST00000375571 ITGAEP38570 1179 aa26.29■■□□□ 1.8
MAPRE1-201ENST00000375571 WDR62O43379 1518 aa26.19■■□□□ 1.78
MAPRE1-201ENST00000375571 FBLN2P98095 1184 aa26.18■■□□□ 1.78
MAPRE1-201ENST00000375571 ARID3CA6NKF2 412 aa26.17■■□□□ 1.78
MAPRE1-201ENST00000375571 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.16■■□□□ 1.78
MAPRE1-201ENST00000375571 PBRM1Q86U86 1689 aa26.14■■□□□ 1.78
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MAPRE1-201ENST00000375571 IFT140Q96RY7 1462 aa26.14■■□□□ 1.77
MAPRE1-201ENST00000375571 GRIN2BQ13224 1484 aa26.12■■□□□ 1.77
MAPRE1-201ENST00000375571 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
MAPRE1-201ENST00000375571 TIAM1Q13009 1591 aa26.09■■□□□ 1.77
MAPRE1-201ENST00000375571 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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MAPRE1-201ENST00000375571 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.06■■□□□ 1.76
MAPRE1-201ENST00000375571 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.06■■□□□ 1.76
MAPRE1-201ENST00000375571 ADAMTS12P58397 1594 aa26.03■■□□□ 1.76
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MAPRE1-201ENST00000375571 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.01■■□□□ 1.75
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MAPRE1-201ENST00000375571 SAMD9Q5K651 1589 aa25.94■■□□□ 1.74
MAPRE1-201ENST00000375571 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.93■■□□□ 1.74
MAPRE1-201ENST00000375571 IQGAP2Q13576 1575 aa25.9■■□□□ 1.74
MAPRE1-201ENST00000375571 MAP3K1Q13233 1512 aa25.89■■□□□ 1.73
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MAPRE1-201ENST00000375571 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.87■■□□□ 1.73
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MAPRE1-201ENST00000375571 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.84■■□□□ 1.73
MAPRE1-201ENST00000375571 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.78■■□□□ 1.72
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MAPRE1-201ENST00000375571 SYNJ2O15056 1496 aa25.75■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 JPH4Q96JJ6 628 aa25.74■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.74■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 CEP170Q5SW79 1584 aa25.74■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.72■■□□□ 1.71
MAPRE1-201ENST00000375571 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.7■■□□□ 1.7
MAPRE1-201ENST00000375571 NCOA2Q15596 1464 aa25.67■■□□□ 1.7
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MAPRE1-201ENST00000375571 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.65■■□□□ 1.7
MAPRE1-201ENST00000375571 KIAA0556O60303 1618 aa25.63■■□□□ 1.69
MAPRE1-201ENST00000375571 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.62■■□□□ 1.69
MAPRE1-201ENST00000375571 PTPRKQ15262 1439 aa25.61■■□□□ 1.69
MAPRE1-201ENST00000375571 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.6■■□□□ 1.69
MAPRE1-201ENST00000375571 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.59■■□□□ 1.69
MAPRE1-201ENST00000375571 NUP160Q12769 1436 aa25.57■■□□□ 1.68
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MAPRE1-201ENST00000375571 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.55■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.53■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.52■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.51■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 NEUROD1Q13562 356 aa25.51■■□□□ 1.67
MAPRE1-201ENST00000375571 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
MAPRE1-201ENST00000375571 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
MAPRE1-201ENST00000375571 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.5■■□□□ 1.67
MAPRE1-201ENST00000375571 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
MAPRE1-201ENST00000375571 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.45■■□□□ 1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.44■■□□□ 1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 ARHGEF11O15085 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 MAPKBP1O60336 1514 aa25.41■■□□□ 1.66
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MAPRE1-201ENST00000375571 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.4■■□□□ 1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.39■■□□□ 1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 CHD1O14646 1710 aa25.39■■□□□ 1.65
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MAPRE1-201ENST00000375571 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.31■■□□□ 1.64
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MAPRE1-201ENST00000375571 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 HFM1A2PYH4 1435 aa25.28■■□□□ 1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 ATP10BO94823 1461 aa25.27■■□□□ 1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 TRIM52Q96A61 297 aa25.27■■□□□ 1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF14Q15058 1648 aa25.26■■□□□ 1.63
MAPRE1-201ENST00000375571 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
MAPRE1-201ENST00000375571 FOXD1Q16676 465 aa25.24■■□□□ 1.63
MAPRE1-201ENST00000375571 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MAPRE1-201ENST00000375571 KDM6BO15054 1643 aa25.21■■□□□ 1.63
MAPRE1-201ENST00000375571 MIA2Q96PC5 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
MAPRE1-201ENST00000375571 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCA8O94911 1581 aa25.2■■□□□ 1.62
MAPRE1-201ENST00000375571 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MAPRE1-201ENST00000375571 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCC5O15440 1437 aa25.17■■□□□ 1.62
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