RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375571.5

MAPRE1-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE1, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE1-201ENST00000375571 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.86■■■■□ 3.65
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MAPRE1-201ENST00000375571 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.03■■■□□ 2.72
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MAPRE1-201ENST00000375571 ABCC9O60706 1549 aa31.03■■■□□ 2.56
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MAPRE1-201ENST00000375571 SMARCA2P51531 1590 aa28.55■■■□□ 2.16
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MAPRE1-201ENST00000375571 NCAPD3P42695 1498 aa28.02■■■□□ 2.08
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MAPRE1-201ENST00000375571 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.96■■■□□ 2.07
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MAPRE1-201ENST00000375571 HMGXB3Q12766 1538 aa27.85■■■□□ 2.05
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MAPRE1-201ENST00000375571 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.82■■■□□ 2.04
MAPRE1-201ENST00000375571 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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MAPRE1-201ENST00000375571 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.73■■■□□ 2.03
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MAPRE1-201ENST00000375571 HRCP23327 699 aa27.63■■■□□ 2.01
MAPRE1-201ENST00000375571 CFTRP13569 1480 aa27.59■■■□□ 2.01
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MAPRE1-201ENST00000375571 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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MAPRE1-201ENST00000375571 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.31■■□□□ 1.96
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MAPRE1-201ENST00000375571 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.22■■□□□ 1.95
MAPRE1-201ENST00000375571 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.22■■□□□ 1.95
MAPRE1-201ENST00000375571 PRDM2Q13029 1718 aa27.13■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF21BO75037 1637 aa27.11■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.11■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF27Q86VH2 1401 aa27.1■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 CUX2O14529 1486 aa27.08■■□□□ 1.93
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MAPRE1-201ENST00000375571 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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MAPRE1-201ENST00000375571 APLP2Q06481 763 aa26.72■■□□□ 1.87
MAPRE1-201ENST00000375571 ARAP1Q96P48 1450 aa26.72■■□□□ 1.87
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MAPRE1-201ENST00000375571 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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MAPRE1-201ENST00000375571 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MAPRE1-201ENST00000375571 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.842e-9■■■■□ 22.8
MAPRE1-201ENST00000375571 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.51■■□□□ 1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 WDR97A6NE52 1622 aa26.43■■□□□ 1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.43■■□□□ 1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.39■■□□□ 1.81
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