RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375571.5

MAPRE1-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE1, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE1-201ENST00000375571 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.86■■■■□ 3.65
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MAPRE1-201ENST00000375571 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.03■■■□□ 2.72
MAPRE1-201ENST00000375571 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
MAPRE1-201ENST00000375571 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCC9O60706 1549 aa31.03■■■□□ 2.56
MAPRE1-201ENST00000375571 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.88■■■□□ 2.53
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MAPRE1-201ENST00000375571 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.25■■■□□ 2.43
MAPRE1-201ENST00000375571 NACADO15069 1562 aa30.18■■■□□ 2.42
MAPRE1-201ENST00000375571 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.89■■■□□ 2.38
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MAPRE1-201ENST00000375571 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MAPRE1-201ENST00000375571 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.67■■■□□ 2.34
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MAPRE1-201ENST00000375571 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.49■■■□□ 2.31
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MAPRE1-201ENST00000375571 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.2■■■□□ 2.27
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MAPRE1-201ENST00000375571 SMARCA4P51532 1647 aa28.97■■■□□ 2.23
MAPRE1-201ENST00000375571 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.94■■■□□ 2.22
MAPRE1-201ENST00000375571 TRIM41Q8WV44 630 aa28.86■■■□□ 2.21
MAPRE1-201ENST00000375571 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MAPRE1-201ENST00000375571 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.7■■■□□ 2.18
MAPRE1-201ENST00000375571 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.68■■■□□ 2.18
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MAPRE1-201ENST00000375571 SMARCA2P51531 1590 aa28.55■■■□□ 2.16
MAPRE1-201ENST00000375571 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.49■■■□□ 2.15
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCC8Q09428 1581 aa28.4■■■□□ 2.14
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MAPRE1-201ENST00000375571 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.35■■■□□ 2.13
MAPRE1-201ENST00000375571 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
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MAPRE1-201ENST00000375571 NCAPD3P42695 1498 aa28.02■■■□□ 2.08
MAPRE1-201ENST00000375571 SOGA1O94964 1423 aa28.01■■■□□ 2.07
MAPRE1-201ENST00000375571 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.96■■■□□ 2.07
MAPRE1-201ENST00000375571 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
MAPRE1-201ENST00000375571 HMGXB3Q12766 1538 aa27.85■■■□□ 2.05
MAPRE1-201ENST00000375571 SYNJ1O43426 1573 aa27.83■■■□□ 2.05
MAPRE1-201ENST00000375571 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.82■■■□□ 2.04
MAPRE1-201ENST00000375571 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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MAPRE1-201ENST00000375571 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.73■■■□□ 2.03
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MAPRE1-201ENST00000375571 HRCP23327 699 aa27.63■■■□□ 2.01
MAPRE1-201ENST00000375571 CFTRP13569 1480 aa27.59■■■□□ 2.01
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MAPRE1-201ENST00000375571 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
MAPRE1-201ENST00000375571 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.49■■□□□ 1.99
MAPRE1-201ENST00000375571 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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MAPRE1-201ENST00000375571 TOP2BQ02880 1626 aa27.45■■□□□ 1.99
MAPRE1-201ENST00000375571 NESP48681 1621 aa27.42■■□□□ 1.98
MAPRE1-201ENST00000375571 EEA1Q15075 1411 aa27.41■■□□□ 1.98
MAPRE1-201ENST00000375571 CEP162Q5TB80 1403 aa27.39■■□□□ 1.98
MAPRE1-201ENST00000375571 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.34■■□□□ 1.97
MAPRE1-201ENST00000375571 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.31■■□□□ 1.96
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MAPRE1-201ENST00000375571 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.22■■□□□ 1.95
MAPRE1-201ENST00000375571 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.22■■□□□ 1.95
MAPRE1-201ENST00000375571 PRDM2Q13029 1718 aa27.13■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF21BO75037 1637 aa27.11■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.11■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF27Q86VH2 1401 aa27.1■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 CUX2O14529 1486 aa27.08■■□□□ 1.93
MAPRE1-201ENST00000375571 CLIP1P30622 1438 aa27.05■■□□□ 1.92
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MAPRE1-201ENST00000375571 PRXQ9BXM0 1461 aa27.02■■□□□ 1.92
MAPRE1-201ENST00000375571 IGF1RP08069 1367 aa26.99■■□□□ 1.91
MAPRE1-201ENST00000375571 TOPBP1Q92547 1522 aa26.94■■□□□ 1.9
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MAPRE1-201ENST00000375571 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
MAPRE1-201ENST00000375571 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.81■■□□□ 1.88
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.79■■□□□ 1.88
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MAPRE1-201ENST00000375571 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.77■■□□□ 1.88
MAPRE1-201ENST00000375571 P3H3Q8IVL6 736 aa26.75■■□□□ 1.87
MAPRE1-201ENST00000375571 APLP2Q06481 763 aa26.72■■□□□ 1.87
MAPRE1-201ENST00000375571 ARAP1Q96P48 1450 aa26.72■■□□□ 1.87
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.69■■□□□ 1.86
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MAPRE1-201ENST00000375571 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.62■■□□□ 1.85
MAPRE1-201ENST00000375571 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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MAPRE1-201ENST00000375571 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MAPRE1-201ENST00000375571 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.842e-9■■■■□ 22.8
MAPRE1-201ENST00000375571 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.51■■□□□ 1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 WDR97A6NE52 1622 aa26.43■■□□□ 1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.43■■□□□ 1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.39■■□□□ 1.81
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