RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372466.8

NUP62CL-201, Transcript of nucleoporin 62 C-terminal like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP62CL, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CL-201ENST00000372466 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
NUP62CL-201ENST00000372466 ERCC6Q03468 1493 aa21.15■□□□□ 0.98
NUP62CL-201ENST00000372466 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
NUP62CL-201ENST00000372466 IFT140Q96RY7 1462 aa21.14■□□□□ 0.98
NUP62CL-201ENST00000372466 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 ADAMTS12P58397 1594 aa21.12■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 TIAM1Q13009 1591 aa21.12■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.11■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.11■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 P3H3Q8IVL6 736 aa21.1■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 MAP3K1Q13233 1512 aa21.09■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 GRIN2BQ13224 1484 aa21.08■□□□□ 0.97
NUP62CL-201ENST00000372466 SAMD9Q5K651 1589 aa21.07■□□□□ 0.96
NUP62CL-201ENST00000372466 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.07■□□□□ 0.96
NUP62CL-201ENST00000372466 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
NUP62CL-201ENST00000372466 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NUP62CL-201ENST00000372466 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.02■□□□□ 0.96
NUP62CL-201ENST00000372466 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.99■□□□□ 0.95
NUP62CL-201ENST00000372466 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.99■□□□□ 0.95
NUP62CL-201ENST00000372466 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
NUP62CL-201ENST00000372466 FMN1Q68DA7 1419 aa20.97■□□□□ 0.95
NUP62CL-201ENST00000372466 IQGAP2Q13576 1575 aa20.96■□□□□ 0.95
NUP62CL-201ENST00000372466 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.96■□□□□ 0.95
NUP62CL-201ENST00000372466 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
NUP62CL-201ENST00000372466 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.91■□□□□ 0.94
NUP62CL-201ENST00000372466 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.9■□□□□ 0.94
NUP62CL-201ENST00000372466 GRIN2AQ12879 1464 aa20.86■□□□□ 0.93
NUP62CL-201ENST00000372466 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NUP62CL-201ENST00000372466 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.85■□□□□ 0.93
NUP62CL-201ENST00000372466 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.83■□□□□ 0.93
NUP62CL-201ENST00000372466 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.8■□□□□ 0.92
NUP62CL-201ENST00000372466 SYNJ2O15056 1496 aa20.79■□□□□ 0.92
NUP62CL-201ENST00000372466 HECW1Q76N89 1606 aa20.76■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 KIAA0556O60303 1618 aa20.76■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 CEP170Q5SW79 1584 aa20.75■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 DISP1Q96F81 1524 aa20.73■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.73■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 ITGAEP38570 1179 aa20.72■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.71■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.71■□□□□ 0.91
NUP62CL-201ENST00000372466 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.68■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 FBLN2P98095 1184 aa20.66■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 NCOA2Q15596 1464 aa20.66■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 NUP160Q12769 1436 aa20.66■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.64■□□□□ 0.9
NUP62CL-201ENST00000372466 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NUP62CL-201ENST00000372466 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
NUP62CL-201ENST00000372466 ARHGEF11O15085 1522 aa20.61■□□□□ 0.89
NUP62CL-201ENST00000372466 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.61■□□□□ 0.89
NUP62CL-201ENST00000372466 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP62CL-201ENST00000372466 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP62CL-201ENST00000372466 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP62CL-201ENST00000372466 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP62CL-201ENST00000372466 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NUP62CL-201ENST00000372466 ARID3CA6NKF2 412 aa20.54■□□□□ 0.88
NUP62CL-201ENST00000372466 CHD1O14646 1710 aa20.54■□□□□ 0.88
NUP62CL-201ENST00000372466 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.54■□□□□ 0.88
NUP62CL-201ENST00000372466 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.51■□□□□ 0.87
NUP62CL-201ENST00000372466 JPH4Q96JJ6 628 aa20.51■□□□□ 0.87
NUP62CL-201ENST00000372466 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.48■□□□□ 0.87
NUP62CL-201ENST00000372466 PTPRKQ15262 1439 aa20.46■□□□□ 0.87
NUP62CL-201ENST00000372466 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NUP62CL-201ENST00000372466 MAPKBP1O60336 1514 aa20.45■□□□□ 0.87
NUP62CL-201ENST00000372466 ABCA8O94911 1581 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP62CL-201ENST00000372466 HFM1A2PYH4 1435 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP62CL-201ENST00000372466 MIA2Q96PC5 1412 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
NUP62CL-201ENST00000372466 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 SHROOM2Q13796 1616 aa20.36■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.36■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 NAIPQ13075 1403 aa20.34■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.34■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 KIF14Q15058 1648 aa20.33■□□□□ 0.85
NUP62CL-201ENST00000372466 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.31■□□□□ 0.84
NUP62CL-201ENST00000372466 ATP10BO94823 1461 aa20.28■□□□□ 0.84
NUP62CL-201ENST00000372466 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NUP62CL-201ENST00000372466 PTPRGP23470 1445 aa20.28■□□□□ 0.84
NUP62CL-201ENST00000372466 AKNAQ7Z591 1439 aa20.26■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 UACAQ9BZF9 1416 aa20.26■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.26■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.24■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 DAPK1P53355 1430 aa20.24■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.23■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 KDM6BO15054 1643 aa20.23■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.23■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.22■□□□□ 0.83
NUP62CL-201ENST00000372466 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms