RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371748.9

LHX3-202, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,365 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-202ENST00000371748 PBRM1Q86U86 1689 aa30.04■■■□□ 2.4
LHX3-202ENST00000371748 WDR62O43379 1518 aa30.02■■■□□ 2.4
LHX3-202ENST00000371748 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.4
LHX3-202ENST00000371748 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.01■■■□□ 2.39
LHX3-202ENST00000371748 EFCAB5A4FU69 1503 aa30■■■□□ 2.39
LHX3-202ENST00000371748 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.98■■■□□ 2.39
LHX3-202ENST00000371748 TIAM1Q13009 1591 aa29.97■■■□□ 2.39
LHX3-202ENST00000371748 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
LHX3-202ENST00000371748 ERCC6Q03468 1493 aa29.95■■■□□ 2.39
LHX3-202ENST00000371748 MAP3K1Q13233 1512 aa29.92■■■□□ 2.38
LHX3-202ENST00000371748 IFT140Q96RY7 1462 aa29.92■■■□□ 2.38
LHX3-202ENST00000371748 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
LHX3-202ENST00000371748 ADAMTS12P58397 1594 aa29.88■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 GRIN2BQ13224 1484 aa29.87■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.86■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 SAMD9Q5K651 1589 aa29.84■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.83■■■□□ 2.37
LHX3-202ENST00000371748 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.82■■■□□ 2.36
LHX3-202ENST00000371748 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.8■■■□□ 2.36
LHX3-202ENST00000371748 FMN1Q68DA7 1419 aa29.78■■■□□ 2.36
LHX3-202ENST00000371748 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.76■■■□□ 2.36
LHX3-202ENST00000371748 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
LHX3-202ENST00000371748 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.73■■■□□ 2.35
LHX3-202ENST00000371748 IQGAP2Q13576 1575 aa29.7■■■□□ 2.34
LHX3-202ENST00000371748 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.66■■■□□ 2.34
LHX3-202ENST00000371748 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.63■■■□□ 2.33
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LHX3-202ENST00000371748 GRIN2AQ12879 1464 aa29.55■■■□□ 2.32
LHX3-202ENST00000371748 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.51■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.49■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.49■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
LHX3-202ENST00000371748 SYNJ2O15056 1496 aa29.43■■■□□ 2.3
LHX3-202ENST00000371748 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
LHX3-202ENST00000371748 HECW1Q76N89 1606 aa29.42■■■□□ 2.3
LHX3-202ENST00000371748 KIAA0556O60303 1618 aa29.4■■■□□ 2.3
LHX3-202ENST00000371748 FBLN2P98095 1184 aa29.39■■■□□ 2.3
LHX3-202ENST00000371748 DISP1Q96F81 1524 aa29.39■■■□□ 2.3
LHX3-202ENST00000371748 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.38■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 CEP170Q5SW79 1584 aa29.38■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.37■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.36■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 NCOA2Q15596 1464 aa29.35■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.35■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.35■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.33■■■□□ 2.29
LHX3-202ENST00000371748 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
LHX3-202ENST00000371748 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
LHX3-202ENST00000371748 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.3■■■□□ 2.28
LHX3-202ENST00000371748 ARID3CA6NKF2 412 aa29.28■■■□□ 2.28
LHX3-202ENST00000371748 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.26■■■□□ 2.27
LHX3-202ENST00000371748 NUP160Q12769 1436 aa29.25■■■□□ 2.27
LHX3-202ENST00000371748 ARHGEF11O15085 1522 aa29.23■■■□□ 2.27
LHX3-202ENST00000371748 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.19■■■□□ 2.26
LHX3-202ENST00000371748 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
LHX3-202ENST00000371748 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
LHX3-202ENST00000371748 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.15■■■□□ 2.26
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LHX3-202ENST00000371748 MAPKBP1O60336 1514 aa29.11■■■□□ 2.25
LHX3-202ENST00000371748 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.1■■■□□ 2.25
LHX3-202ENST00000371748 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.07■■■□□ 2.24
LHX3-202ENST00000371748 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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LHX3-202ENST00000371748 CHD1O14646 1710 aa29.02■■■□□ 2.24
LHX3-202ENST00000371748 NEUROD1Q13562 356 aa29■■■□□ 2.23
LHX3-202ENST00000371748 HFM1A2PYH4 1435 aa29■■■□□ 2.23
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LHX3-202ENST00000371748 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.83■■■□□ 2.21
LHX3-202ENST00000371748 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.81■■■□□ 2.2
LHX3-202ENST00000371748 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
LHX3-202ENST00000371748 PTPRGP23470 1445 aa28.78■■■□□ 2.2
LHX3-202ENST00000371748 ATP10BO94823 1461 aa28.78■■■□□ 2.2
LHX3-202ENST00000371748 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
LHX3-202ENST00000371748 DAPK1P53355 1430 aa28.76■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.76■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 AKNAQ7Z591 1439 aa28.76■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 SHROOM2Q13796 1616 aa28.76■■■□□ 2.19
LHX3-202ENST00000371748 KDM6BO15054 1643 aa28.74■■■□□ 2.19
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