RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.13■■■■□ 3.37
LHX3-201ENST00000371746 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
LHX3-201ENST00000371746 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.1■■■■□ 3.37
LHX3-201ENST00000371746 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
LHX3-201ENST00000371746 IFT140Q96RY7 1462 aa36.09■■■■□ 3.37
LHX3-201ENST00000371746 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
LHX3-201ENST00000371746 PBRM1Q86U86 1689 aa36.06■■■■□ 3.36
LHX3-201ENST00000371746 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.04■■■■□ 3.36
LHX3-201ENST00000371746 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.03■■■■□ 3.36
LHX3-201ENST00000371746 GRIN2BQ13224 1484 aa36■■■■□ 3.35
LHX3-201ENST00000371746 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
LHX3-201ENST00000371746 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
LHX3-201ENST00000371746 ADAMTS12P58397 1594 aa35.95■■■■□ 3.35
LHX3-201ENST00000371746 TIAM1Q13009 1591 aa35.95■■■■□ 3.35
LHX3-201ENST00000371746 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
LHX3-201ENST00000371746 MAP3K1Q13233 1512 aa35.9■■■■□ 3.34
LHX3-201ENST00000371746 SAMD9Q5K651 1589 aa35.84■■■■□ 3.33
LHX3-201ENST00000371746 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
LHX3-201ENST00000371746 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.82■■■■□ 3.33
LHX3-201ENST00000371746 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.82■■■■□ 3.33
LHX3-201ENST00000371746 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.82■■■■□ 3.32
LHX3-201ENST00000371746 FMN1Q68DA7 1419 aa35.81■■■■□ 3.32
LHX3-201ENST00000371746 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
LHX3-201ENST00000371746 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.79■■■■□ 3.32
LHX3-201ENST00000371746 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.74■■■■□ 3.31
LHX3-201ENST00000371746 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.73■■■■□ 3.31
LHX3-201ENST00000371746 IQGAP2Q13576 1575 aa35.71■■■■□ 3.31
LHX3-201ENST00000371746 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.64■■■■□ 3.3
LHX3-201ENST00000371746 GRIN2AQ12879 1464 aa35.61■■■■□ 3.29
LHX3-201ENST00000371746 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
LHX3-201ENST00000371746 ITGAEP38570 1179 aa35.57■■■■□ 3.28
LHX3-201ENST00000371746 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.54■■■■□ 3.28
LHX3-201ENST00000371746 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
LHX3-201ENST00000371746 FBLN2P98095 1184 aa35.51■■■■□ 3.28
LHX3-201ENST00000371746 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.5■■■■□ 3.27
LHX3-201ENST00000371746 SYNJ2O15056 1496 aa35.5■■■■□ 3.27
LHX3-201ENST00000371746 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.48■■■■□ 3.27
LHX3-201ENST00000371746 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.46■■■■□ 3.27
LHX3-201ENST00000371746 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
LHX3-201ENST00000371746 DISP1Q96F81 1524 aa35.39■■■■□ 3.26
LHX3-201ENST00000371746 CEP170Q5SW79 1584 aa35.38■■■■□ 3.25
LHX3-201ENST00000371746 KIAA0556O60303 1618 aa35.34■■■■□ 3.25
LHX3-201ENST00000371746 HECW1Q76N89 1606 aa35.32■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 ARID3CA6NKF2 412 aa35.31■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.3■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.28■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 NUP160Q12769 1436 aa35.27■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 NCOA2Q15596 1464 aa35.26■■■■□ 3.24
LHX3-201ENST00000371746 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.25■■■■□ 3.23
LHX3-201ENST00000371746 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.25■■■■□ 3.23
LHX3-201ENST00000371746 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
LHX3-201ENST00000371746 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.2■■■■□ 3.23
LHX3-201ENST00000371746 JPH4Q96JJ6 628 aa35.17■■■■□ 3.22
LHX3-201ENST00000371746 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
LHX3-201ENST00000371746 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.17■■■■□ 3.22
LHX3-201ENST00000371746 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.15■■■■□ 3.22
LHX3-201ENST00000371746 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.13■■■■□ 3.21
LHX3-201ENST00000371746 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.12■■■■□ 3.21
LHX3-201ENST00000371746 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
LHX3-201ENST00000371746 ARHGEF11O15085 1522 aa35.1■■■■□ 3.21
LHX3-201ENST00000371746 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.07■■■■□ 3.2
LHX3-201ENST00000371746 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.07■■■■□ 3.2
LHX3-201ENST00000371746 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.03■■■■□ 3.2
LHX3-201ENST00000371746 PTPRKQ15262 1439 aa34.99■■■■□ 3.19
LHX3-201ENST00000371746 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.95■■■■□ 3.18
LHX3-201ENST00000371746 CHD1O14646 1710 aa34.9■■■■□ 3.18
LHX3-201ENST00000371746 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
LHX3-201ENST00000371746 MAPKBP1O60336 1514 aa34.87■■■■□ 3.17
LHX3-201ENST00000371746 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
LHX3-201ENST00000371746 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
LHX3-201ENST00000371746 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
LHX3-201ENST00000371746 HFM1A2PYH4 1435 aa34.82■■■■□ 3.16
LHX3-201ENST00000371746 MIA2Q96PC5 1412 aa34.81■■■■□ 3.16
LHX3-201ENST00000371746 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
LHX3-201ENST00000371746 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
LHX3-201ENST00000371746 ABCA8O94911 1581 aa34.76■■■■□ 3.16
LHX3-201ENST00000371746 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.75■■■■□ 3.15
LHX3-201ENST00000371746 NAIPQ13075 1403 aa34.75■■■■□ 3.15
LHX3-201ENST00000371746 PTPRGP23470 1445 aa34.72■■■■□ 3.15
LHX3-201ENST00000371746 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.69■■■■□ 3.14
LHX3-201ENST00000371746 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
LHX3-201ENST00000371746 ATP10BO94823 1461 aa34.66■■■■□ 3.14
LHX3-201ENST00000371746 KIF14Q15058 1648 aa34.64■■■■□ 3.14
LHX3-201ENST00000371746 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.63■■■■□ 3.13
LHX3-201ENST00000371746 SHROOM2Q13796 1616 aa34.62■■■■□ 3.13
LHX3-201ENST00000371746 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.6■■■■□ 3.13
LHX3-201ENST00000371746 NEUROD1Q13562 356 aa34.59■■■■□ 3.13
LHX3-201ENST00000371746 UACAQ9BZF9 1416 aa34.58■■■■□ 3.13
LHX3-201ENST00000371746 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.57■■■■□ 3.13
LHX3-201ENST00000371746 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
LHX3-201ENST00000371746 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
LHX3-201ENST00000371746 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.55■■■■□ 3.12
LHX3-201ENST00000371746 DAPK1P53355 1430 aa34.55■■■■□ 3.12
LHX3-201ENST00000371746 ABCC5O15440 1437 aa34.52■■■■□ 3.12
LHX3-201ENST00000371746 AKNAQ7Z591 1439 aa34.52■■■■□ 3.12
LHX3-201ENST00000371746 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
LHX3-201ENST00000371746 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.49■■■■□ 3.11
LHX3-201ENST00000371746 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.49■■■■□ 3.11
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