RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371725.7

SDCCAG3-204, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		43.72	■■■■■ 4.59
SDCCAG3-204	ENST00000371725	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.71	■■■■■ 4.59
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.69	■■■■■ 4.58
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.68	■■■■■ 4.58
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.64	■■■■■ 4.58
SDCCAG3-204	ENST00000371725	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.62	■■■■■ 4.57
SDCCAG3-204	ENST00000371725	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.49	■■■■■ 4.55
SDCCAG3-204	ENST00000371725	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.39	■■■■■ 4.54
SDCCAG3-204	ENST00000371725	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.34	■■■■■ 4.53
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.34	■■■■■ 4.53
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FBLN2	P98095	1184 aa		43.3	■■■■■ 4.52
SDCCAG3-204	ENST00000371725	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.29	■■■■■ 4.52
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.28	■■■■■ 4.52
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
SDCCAG3-204	ENST00000371725	APLP2	Q06481	763 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SDCCAG3-204	ENST00000371725	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.24	■■■■■ 4.51
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.22	■■■■■ 4.51
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
SDCCAG3-204	ENST00000371725	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SDCCAG3-204	ENST00000371725	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43	■■■■■ 4.47
SDCCAG3-204	ENST00000371725	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SDCCAG3-204	ENST00000371725	NUP160	Q12769	1436 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CHD1	O14646	1710 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SDCCAG3-204	ENST00000371725	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SDCCAG3-204	ENST00000371725	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
SDCCAG3-204	ENST00000371725	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
SDCCAG3-204	ENST00000371725	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SDCCAG3-204	ENST00000371725	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SDCCAG3-204	ENST00000371725	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SDCCAG3-204	ENST00000371725	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SDCCAG3-204	ENST00000371725	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SDCCAG3-204	ENST00000371725	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SDCCAG3-204	ENST00000371725	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.39
SDCCAG3-204	ENST00000371725	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.38	■■■■■ 4.37
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SDCCAG3-204	ENST00000371725	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.29	■■■■■ 4.36
SDCCAG3-204	ENST00000371725	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SDCCAG3-204	ENST00000371725	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
SDCCAG3-204	ENST00000371725	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ABCA8	O94911	1581 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PTPRG	P23470	1445 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ITGAE	P38570	1179 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SDCCAG3-204	ENST00000371725	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.01	■■■■■ 4.32
SDCCAG3-204	ENST00000371725	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.98	■■■■■ 4.31
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ATP10B	O94823	1461 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
SDCCAG3-204	ENST00000371725	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SDCCAG3-204	ENST00000371725	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.9	■■■■■ 4.3
SDCCAG3-204	ENST00000371725	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
SDCCAG3-204	ENST00000371725	NEUROD1	Q13562	356 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SDCCAG3-204	ENST00000371725	KIF14	Q15058	1648 aa		41.83	■■■■■ 4.29
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	41.83	■■■■■ 4.29
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SDCCAG3-204	ENST00000371725	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.77	■■■■■ 4.28
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SDCCAG3-204	ENST00000371725	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.68	■■■■■ 4.26
SDCCAG3-204	ENST00000371725	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
SDCCAG3-204	ENST00000371725	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	41.59	■■■■■ 4.25
SDCCAG3-204	ENST00000371725	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.58	■■■■■ 4.25
SDCCAG3-204	ENST00000371725	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		41.57	■■■■■ 4.25
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.56	■■■■■ 4.24
SDCCAG3-204	ENST00000371725	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.56	■■■■■ 4.24
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.54	■■■■■ 4.24
SDCCAG3-204	ENST00000371725	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SDCCAG3-204	ENST00000371725	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.51	■■■■■ 4.24
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.51	■■■■■ 4.23
SDCCAG3-204	ENST00000371725	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.49	■■■■■ 4.23
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
SDCCAG3-204	ENST00000371725	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		41.47	■■■■■ 4.23

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