RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SERF1A-202ENST00000354833 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
SERF1A-202ENST00000354833 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.59■■■■□ 3.61
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SERF1A-202ENST00000354833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
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SERF1A-202ENST00000354833 P3H3Q8IVL6 736 aa37.41■■■■□ 3.58
SERF1A-202ENST00000354833 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.41■■■■□ 3.58
SERF1A-202ENST00000354833 SAMD9Q5K651 1589 aa37.39■■■■□ 3.58
SERF1A-202ENST00000354833 GRIN2AQ12879 1464 aa37.34■■■■□ 3.57
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SERF1A-202ENST00000354833 MAP3K1Q13233 1512 aa37.31■■■■□ 3.56
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SERF1A-202ENST00000354833 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
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SERF1A-202ENST00000354833 FMN1Q68DA7 1419 aa37.27■■■■□ 3.56
SERF1A-202ENST00000354833 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.23■■■■□ 3.55
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SERF1A-202ENST00000354833 TIAM1Q13009 1591 aa37.22■■■■□ 3.55
SERF1A-202ENST00000354833 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.22■■■■□ 3.55
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SERF1A-202ENST00000354833 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.11■■■■□ 3.53
SERF1A-202ENST00000354833 CEP170Q5SW79 1584 aa37.08■■■■□ 3.53
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.07■■■■□ 3.52
SERF1A-202ENST00000354833 FBLN2P98095 1184 aa37.06■■■■□ 3.52
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SERF1A-202ENST00000354833 JPH4Q96JJ6 628 aa36.79■■■■□ 3.48
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.79■■■■□ 3.48
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SERF1A-202ENST00000354833 CHD1O14646 1710 aa36.75■■■■□ 3.47
SERF1A-202ENST00000354833 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.74■■■■□ 3.47
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SERF1A-202ENST00000354833 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.62■■■■□ 3.45
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SERF1A-202ENST00000354833 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
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SERF1A-202ENST00000354833 ITGAEP38570 1179 aa36.39■■■■□ 3.42
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SERF1A-202ENST00000354833 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.78■■■■□ 3.32
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