RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 ADAMTS12P58397 1594 aa43.54■■■■■ 4.56
CCZ1-201ENST00000325974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
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CCZ1-201ENST00000325974 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.35■■■■■ 4.53
CCZ1-201ENST00000325974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.32■■■■■ 4.53
CCZ1-201ENST00000325974 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CCZ1-201ENST00000325974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
CCZ1-201ENST00000325974 SAMD9Q5K651 1589 aa43.16■■■■■ 4.5
CCZ1-201ENST00000325974 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.13■■■■■ 4.5
CCZ1-201ENST00000325974 P3H3Q8IVL6 736 aa43.13■■■■■ 4.49
CCZ1-201ENST00000325974 GRIN2AQ12879 1464 aa43.11■■■■■ 4.49
CCZ1-201ENST00000325974 IQGAP2Q13576 1575 aa43.11■■■■■ 4.49
CCZ1-201ENST00000325974 SYNJ2O15056 1496 aa43.07■■■■■ 4.49
CCZ1-201ENST00000325974 MAP3K1Q13233 1512 aa43■■■■■ 4.47
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CCZ1-201ENST00000325974 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.97■■■■■ 4.47
CCZ1-201ENST00000325974 FMN1Q68DA7 1419 aa42.96■■■■■ 4.47
CCZ1-201ENST00000325974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
CCZ1-201ENST00000325974 HRCP23327 699 aa42.94■■■■■ 4.46
CCZ1-201ENST00000325974 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
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CCZ1-201ENST00000325974 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.91■■■■■ 4.46
CCZ1-201ENST00000325974 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.9■■■■■ 4.46
CCZ1-201ENST00000325974 CEP170Q5SW79 1584 aa42.84■■■■■ 4.45
CCZ1-201ENST00000325974 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.83■■■■■ 4.45
CCZ1-201ENST00000325974 FBLN2P98095 1184 aa42.8■■■■■ 4.44
CCZ1-201ENST00000325974 NUP160Q12769 1436 aa42.78■■■■■ 4.44
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CCZ1-201ENST00000325974 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
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CCZ1-201ENST00000325974 DISP1Q96F81 1524 aa42.66■■■■■ 4.42
CCZ1-201ENST00000325974 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.58■■■■■ 4.41
CCZ1-201ENST00000325974 CHD1O14646 1710 aa42.56■■■■■ 4.4
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CCZ1-201ENST00000325974 JPH4Q96JJ6 628 aa42.48■■■■■ 4.39
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.43■■■■■ 4.38
CCZ1-201ENST00000325974 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.41■■■■■ 4.38
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CCZ1-201ENST00000325974 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.37■■■■■ 4.37
CCZ1-201ENST00000325974 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.34■■■■■ 4.37
CCZ1-201ENST00000325974 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.34■■■■■ 4.37
CCZ1-201ENST00000325974 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
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CCZ1-201ENST00000325974 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.29■■■■■ 4.36
CCZ1-201ENST00000325974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.27■■■■■ 4.36
CCZ1-201ENST00000325974 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
CCZ1-201ENST00000325974 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CCZ1-201ENST00000325974 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.19■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 SHROOM2Q13796 1616 aa42.18■■■■■ 4.34
CCZ1-201ENST00000325974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
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CCZ1-201ENST00000325974 NCOA2Q15596 1464 aa42.12■■■■■ 4.33
CCZ1-201ENST00000325974 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.11■■■■■ 4.33
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CCZ1-201ENST00000325974 ARID3CA6NKF2 412 aa42.03■■■■■ 4.32
CCZ1-201ENST00000325974 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
CCZ1-201ENST00000325974 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.02■■■■■ 4.32
CCZ1-201ENST00000325974 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1-201ENST00000325974 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CCZ1-201ENST00000325974 PTPRGP23470 1445 aa41.95■■■■■ 4.31
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CCZ1-201ENST00000325974 ATP10BO94823 1461 aa41.77■■■■■ 4.28
CCZ1-201ENST00000325974 MIA2Q96PC5 1412 aa41.73■■■■■ 4.27
CCZ1-201ENST00000325974 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
CCZ1-201ENST00000325974 UACAQ9BZF9 1416 aa41.72■■■■■ 4.27
CCZ1-201ENST00000325974 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.71■■■■■ 4.27
CCZ1-201ENST00000325974 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.65■■■■■ 4.26
CCZ1-201ENST00000325974 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.62■■■■■ 4.25
CCZ1-201ENST00000325974 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.61■■■■■ 4.25
CCZ1-201ENST00000325974 KIF14Q15058 1648 aa41.6■■■■■ 4.25
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CCZ1-201ENST00000325974 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.53■■■■■ 4.24
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CCZ1-201ENST00000325974 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CCZ1-201ENST00000325974 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.46■■■■■ 4.23
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CCZ1-201ENST00000325974 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
CCZ1-201ENST00000325974 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
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CCZ1-201ENST00000325974 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 AKNAQ7Z591 1439 aa41.29■■■■■ 4.2
CCZ1-201ENST00000325974 DAPK1P53355 1430 aa41.29■■■■■ 4.2
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