RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308388.6

GMPPB-202, Transcript of GDP-mannose pyrophosphorylase B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GMPPB, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPB-202ENST00000308388 JPH4Q96JJ6 628 aa38.06■■■■□ 3.68
GMPPB-202ENST00000308388 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.06■■■■□ 3.68
GMPPB-202ENST00000308388 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.04■■■■□ 3.68
GMPPB-202ENST00000308388 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.04■■■■□ 3.68
GMPPB-202ENST00000308388 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.96■■■■□ 3.67
GMPPB-202ENST00000308388 PRXQ9BXM0 1461 aa37.95■■■■□ 3.67
GMPPB-202ENST00000308388 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
GMPPB-202ENST00000308388 EEA1Q15075 1411 aa37.9■■■■□ 3.66
GMPPB-202ENST00000308388 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
GMPPB-202ENST00000308388 IQGAP2Q13576 1575 aa37.79■■■■□ 3.64
GMPPB-202ENST00000308388 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.63■■■■□ 3.61
GMPPB-202ENST00000308388 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.61■■■■□ 3.61
GMPPB-202ENST00000308388 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.6■■■■□ 3.61
GMPPB-202ENST00000308388 DISP1Q96F81 1524 aa37.58■■■■□ 3.61
GMPPB-202ENST00000308388 KIF21BO75037 1637 aa37.51■■■■□ 3.6
GMPPB-202ENST00000308388 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.51■■■■□ 3.6
GMPPB-202ENST00000308388 PTPRGP23470 1445 aa37.5■■■■□ 3.59
GMPPB-202ENST00000308388 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
GMPPB-202ENST00000308388 KIAA0556O60303 1618 aa37.44■■■■□ 3.58
GMPPB-202ENST00000308388 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.41■■■■□ 3.58
GMPPB-202ENST00000308388 GOLGA3Q08378 1498 aa37.36■■■■□ 3.57
GMPPB-202ENST00000308388 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.35■■■■□ 3.57
GMPPB-202ENST00000308388 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
GMPPB-202ENST00000308388 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
GMPPB-202ENST00000308388 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
GMPPB-202ENST00000308388 P3H3Q8IVL6 736 aa37.25■■■■□ 3.55
GMPPB-202ENST00000308388 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.24■■■■□ 3.55
GMPPB-202ENST00000308388 UACAQ9BZF9 1416 aa37.24■■■■□ 3.55
GMPPB-202ENST00000308388 SAMD9Q5K651 1589 aa37.2■■■■□ 3.55
GMPPB-202ENST00000308388 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.18■■■■□ 3.54
GMPPB-202ENST00000308388 ABCC2Q92887 1545 aa37.14■■■■□ 3.54
GMPPB-202ENST00000308388 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.13■■■■□ 3.53
GMPPB-202ENST00000308388 MAPKBP1O60336 1514 aa37.08■■■■□ 3.53
GMPPB-202ENST00000308388 ABCA8O94911 1581 aa37.05■■■■□ 3.52
GMPPB-202ENST00000308388 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.03■■■■□ 3.52
GMPPB-202ENST00000308388 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.02■■■■□ 3.52
GMPPB-202ENST00000308388 EFCAB5A4FU69 1503 aa37■■■■□ 3.51
GMPPB-202ENST00000308388 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.94■■■■□ 3.5
GMPPB-202ENST00000308388 ASXL2Q76L83 1435 aa36.92■■■■□ 3.5
GMPPB-202ENST00000308388 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
GMPPB-202ENST00000308388 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.91■■■■□ 3.5
GMPPB-202ENST00000308388 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.91■■■■□ 3.5
GMPPB-202ENST00000308388 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.9■■■■□ 3.5
GMPPB-202ENST00000308388 DIP2BQ9P265 1576 aa36.86■■■■□ 3.49
GMPPB-202ENST00000308388 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.83■■■■□ 3.49
GMPPB-202ENST00000308388 ARID3CA6NKF2 412 aa36.83■■■■□ 3.49
GMPPB-202ENST00000308388 ATP10BO94823 1461 aa36.79■■■■□ 3.48
GMPPB-202ENST00000308388 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
GMPPB-202ENST00000308388 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.73■■■■□ 3.47
GMPPB-202ENST00000308388 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.71■■■■□ 3.47
GMPPB-202ENST00000308388 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
GMPPB-202ENST00000308388 FMN1Q68DA7 1419 aa36.69■■■■□ 3.46
GMPPB-202ENST00000308388 CLIP1P30622 1438 aa36.67■■■■□ 3.46
GMPPB-202ENST00000308388 GLI2P10070 1586 aa36.65■■■■□ 3.46
GMPPB-202ENST00000308388 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
GMPPB-202ENST00000308388 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
GMPPB-202ENST00000308388 KCNH8Q96L42 1107 aa36.61■■■■□ 3.45
GMPPB-202ENST00000308388 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
GMPPB-202ENST00000308388 TSPOAP1O95153 1857 aa36.54■■■■□ 3.44
GMPPB-202ENST00000308388 CEP162Q5TB80 1403 aa36.51■■■■□ 3.44
GMPPB-202ENST00000308388 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
GMPPB-202ENST00000308388 HECW1Q76N89 1606 aa36.48■■■■□ 3.43
GMPPB-202ENST00000308388 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.48■■■■□ 3.43
GMPPB-202ENST00000308388 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.46■■■■□ 3.43
GMPPB-202ENST00000308388 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
GMPPB-202ENST00000308388 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.43■■■■□ 3.42
GMPPB-202ENST00000308388 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
GMPPB-202ENST00000308388 CD109Q6YHK3 1445 aa36.4■■■■□ 3.42
GMPPB-202ENST00000308388 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.36■■■■□ 3.41
GMPPB-202ENST00000308388 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.35■■■■□ 3.41
GMPPB-202ENST00000308388 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.31■■■■□ 3.4
GMPPB-202ENST00000308388 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.31■■■■□ 3.4
GMPPB-202ENST00000308388 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.3■■■■□ 3.4
GMPPB-202ENST00000308388 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.29■■■■□ 3.4
GMPPB-202ENST00000308388 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
GMPPB-202ENST00000308388 KDM6BO15054 1643 aa36.24■■■■□ 3.39
GMPPB-202ENST00000308388 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.23■■■■□ 3.39
GMPPB-202ENST00000308388 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.39
GMPPB-202ENST00000308388 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
GMPPB-202ENST00000308388 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
GMPPB-202ENST00000308388 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.13■■■■□ 3.38
GMPPB-202ENST00000308388 KIF14Q15058 1648 aa36.09■■■■□ 3.37
GMPPB-202ENST00000308388 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.06■■■■□ 3.36
GMPPB-202ENST00000308388 NEO1Q92859 1461 aa36.02■■■■□ 3.36
GMPPB-202ENST00000308388 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36■■■■□ 3.35
GMPPB-202ENST00000308388 PLCH2O75038 1416 aa36■■■■□ 3.35
GMPPB-202ENST00000308388 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.99■■■■□ 3.35
GMPPB-202ENST00000308388 FANCAO15360 1455 aa35.97■■■■□ 3.35
GMPPB-202ENST00000308388 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.92■■■■□ 3.34
GMPPB-202ENST00000308388 AKNAQ7Z591 1439 aa35.92■■■■□ 3.34
GMPPB-202ENST00000308388 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.89■■■■□ 3.34
GMPPB-202ENST00000308388 RAPGEF3O95398 923 aa35.89■■■■□ 3.34
GMPPB-202ENST00000308388 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.86■■■■□ 3.33
GMPPB-202ENST00000308388 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.85■■■■□ 3.33
GMPPB-202ENST00000308388 TIAM1Q13009 1591 aa35.83■■■■□ 3.33
GMPPB-202ENST00000308388 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.8■■■■□ 3.32
GMPPB-202ENST00000308388 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.8■■■■□ 3.32
GMPPB-202ENST00000308388 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.79■■■■□ 3.32
GMPPB-202ENST00000308388 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
GMPPB-202ENST00000308388 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.77■■■■□ 3.32
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