RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297661.8

UBAP1-201, Transcript of ubiquitin associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBAP1, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UBAP1-201ENST00000297661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.03■■□□□ 1.28
UBAP1-201ENST00000297661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UBAP1-201ENST00000297661 FBLN2P98095 1184 aa23.02■■□□□ 1.28
UBAP1-201ENST00000297661 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.99■■□□□ 1.27
UBAP1-201ENST00000297661 WDR97A6NE52 1622 aa22.99■■□□□ 1.27
UBAP1-201ENST00000297661 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UBAP1-201ENST00000297661 MIER1Q8N108 512 aa22.95■■□□□ 1.26
UBAP1-201ENST00000297661 PRXQ9BXM0 1461 aa22.95■■□□□ 1.26
UBAP1-201ENST00000297661 KIF27Q86VH2 1401 aa22.93■■□□□ 1.26
UBAP1-201ENST00000297661 ARAP1Q96P48 1450 aa22.92■■□□□ 1.26
UBAP1-201ENST00000297661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.9■■□□□ 1.26
UBAP1-201ENST00000297661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.89■■□□□ 1.25
UBAP1-201ENST00000297661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.86■■□□□ 1.25
UBAP1-201ENST00000297661 IGF1RP08069 1367 aa22.86■■□□□ 1.25
UBAP1-201ENST00000297661 GRIN2BQ13224 1484 aa22.86■■□□□ 1.25
UBAP1-201ENST00000297661 PBRM1Q86U86 1689 aa22.85■■□□□ 1.25
UBAP1-201ENST00000297661 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
UBAP1-201ENST00000297661 ITGAEP38570 1179 aa22.8■■□□□ 1.24
UBAP1-201ENST00000297661 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.74■■□□□ 1.23
UBAP1-201ENST00000297661 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.72■■□□□ 1.23
UBAP1-201ENST00000297661 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UBAP1-201ENST00000297661 CHD1O14646 1710 aa22.69■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 ADAMTS12P58397 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 SYNJ2O15056 1496 aa22.66■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.66■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.65■■□□□ 1.22
UBAP1-201ENST00000297661 BCL11AQ9H165 835 aa22.63■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 P3H3Q8IVL6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.62■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 OSCARQ8IYS5 282 aa22.62■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 GRIN2AQ12879 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.6■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
UBAP1-201ENST00000297661 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.57■■□□□ 1.2
UBAP1-201ENST00000297661 CUL7Q14999 1698 aa22.57■■□□□ 1.2
UBAP1-201ENST00000297661 CEP170Q5SW79 1584 aa22.52■■□□□ 1.2
UBAP1-201ENST00000297661 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
UBAP1-201ENST00000297661 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.45■■□□□ 1.18
UBAP1-201ENST00000297661 TIAM1Q13009 1591 aa22.42■■□□□ 1.18
UBAP1-201ENST00000297661 NUP160Q12769 1436 aa22.42■■□□□ 1.18
UBAP1-201ENST00000297661 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.41■■□□□ 1.18
UBAP1-201ENST00000297661 JPH4Q96JJ6 628 aa22.39■■□□□ 1.18
UBAP1-201ENST00000297661 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.37■■□□□ 1.17
UBAP1-201ENST00000297661 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.37■■□□□ 1.17
UBAP1-201ENST00000297661 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.33■■□□□ 1.17
UBAP1-201ENST00000297661 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.33■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.32■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.32■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 MAPKBP1O60336 1514 aa22.3■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.3■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 IQGAP2Q13576 1575 aa22.29■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.28■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.28■■□□□ 1.16
UBAP1-201ENST00000297661 MAP3K1Q13233 1512 aa22.25■■□□□ 1.15
UBAP1-201ENST00000297661 KCNH8Q96L42 1107 aa22.24■■□□□ 1.15
UBAP1-201ENST00000297661 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.23■■□□□ 1.15
UBAP1-201ENST00000297661 ARHGEF11O15085 1522 aa22.2■■□□□ 1.15
UBAP1-201ENST00000297661 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 ARID3CA6NKF2 412 aa22.18■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.17■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 DISP1Q96F81 1524 aa22.15■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.15■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.15■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.15■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 BCANQ96GW7 911 aa22.15■■□□□ 1.14
UBAP1-201ENST00000297661 SHROOM2Q13796 1616 aa22.14■■□□□ 1.13
UBAP1-201ENST00000297661 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBAP1-201ENST00000297661 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.12■■□□□ 1.13
UBAP1-201ENST00000297661 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.12■■□□□ 1.13
UBAP1-201ENST00000297661 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.1■■□□□ 1.13
UBAP1-201ENST00000297661 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
UBAP1-201ENST00000297661 KIAA0556O60303 1618 aa22.07■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.07■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 PTPRGP23470 1445 aa22.05■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 FKBP8Q14318 412 aa22.04■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 FMN1Q68DA7 1419 aa22.02■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.02■■□□□ 1.12
UBAP1-201ENST00000297661 PTPRKQ15262 1439 aa22.01■■□□□ 1.11
UBAP1-201ENST00000297661 SAMD9Q5K651 1589 aa22■■□□□ 1.11
UBAP1-201ENST00000297661 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.99■■□□□ 1.11
UBAP1-201ENST00000297661 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UBAP1-201ENST00000297661 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.93■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.93■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.93■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 NCOA2Q15596 1464 aa21.92■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 TONSLQ96HA7 1378 aa21.91■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.9■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
UBAP1-201ENST00000297661 NEFLP07196 543 aa21.86■■□□□ 1.09
UBAP1-201ENST00000297661 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.86■■□□□ 1.09
UBAP1-201ENST00000297661 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.86■■□□□ 1.09
UBAP1-201ENST00000297661 HFM1A2PYH4 1435 aa21.85■■□□□ 1.09
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