RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296425.9

PGRMC2-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 2,767 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-201ENST00000296425 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.87■■■□□ 2.85
PGRMC2-201ENST00000296425 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.85■■■□□ 2.85
PGRMC2-201ENST00000296425 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.81■■■□□ 2.84
PGRMC2-201ENST00000296425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
PGRMC2-201ENST00000296425 ADAMTS12P58397 1594 aa32.77■■■□□ 2.84
PGRMC2-201ENST00000296425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
PGRMC2-201ENST00000296425 MAP3K1Q13233 1512 aa32.64■■■□□ 2.82
PGRMC2-201ENST00000296425 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.62■■■□□ 2.81
PGRMC2-201ENST00000296425 P3H3Q8IVL6 736 aa32.61■■■□□ 2.81
PGRMC2-201ENST00000296425 SAMD9Q5K651 1589 aa32.59■■■□□ 2.81
PGRMC2-201ENST00000296425 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
PGRMC2-201ENST00000296425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.59■■■□□ 2.81
PGRMC2-201ENST00000296425 FMN1Q68DA7 1419 aa32.55■■■□□ 2.8
PGRMC2-201ENST00000296425 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
PGRMC2-201ENST00000296425 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
PGRMC2-201ENST00000296425 TIAM1Q13009 1591 aa32.53■■■□□ 2.8
PGRMC2-201ENST00000296425 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.52■■■□□ 2.8
PGRMC2-201ENST00000296425 IQGAP2Q13576 1575 aa32.51■■■□□ 2.8
PGRMC2-201ENST00000296425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.51■■■□□ 2.79
PGRMC2-201ENST00000296425 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
PGRMC2-201ENST00000296425 GRIN2AQ12879 1464 aa32.47■■■□□ 2.79
PGRMC2-201ENST00000296425 SYNJ2O15056 1496 aa32.43■■■□□ 2.78
PGRMC2-201ENST00000296425 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.42■■■□□ 2.78
PGRMC2-201ENST00000296425 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.4■■■□□ 2.78
PGRMC2-201ENST00000296425 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.4■■■□□ 2.78
PGRMC2-201ENST00000296425 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.38■■■□□ 2.77
PGRMC2-201ENST00000296425 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
PGRMC2-201ENST00000296425 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
PGRMC2-201ENST00000296425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
PGRMC2-201ENST00000296425 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
PGRMC2-201ENST00000296425 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
PGRMC2-201ENST00000296425 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
PGRMC2-201ENST00000296425 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.23■■■□□ 2.75
PGRMC2-201ENST00000296425 NUP160Q12769 1436 aa32.22■■■□□ 2.75
PGRMC2-201ENST00000296425 CEP170Q5SW79 1584 aa32.21■■■□□ 2.75
PGRMC2-201ENST00000296425 FBLN2P98095 1184 aa32.21■■■□□ 2.75
PGRMC2-201ENST00000296425 DISP1Q96F81 1524 aa32.18■■■□□ 2.74
PGRMC2-201ENST00000296425 KIAA0556O60303 1618 aa32.16■■■□□ 2.74
PGRMC2-201ENST00000296425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.13■■■□□ 2.73
PGRMC2-201ENST00000296425 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.12■■■□□ 2.73
PGRMC2-201ENST00000296425 HECW1Q76N89 1606 aa32.12■■■□□ 2.73
PGRMC2-201ENST00000296425 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.1■■■□□ 2.73
PGRMC2-201ENST00000296425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.09■■■□□ 2.73
PGRMC2-201ENST00000296425 JPH4Q96JJ6 628 aa32.03■■■□□ 2.72
PGRMC2-201ENST00000296425 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.02■■■□□ 2.72
PGRMC2-201ENST00000296425 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
PGRMC2-201ENST00000296425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.01■■■□□ 2.71
PGRMC2-201ENST00000296425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.717e-10■□□□□ 8.6
PGRMC2-201ENST00000296425 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
PGRMC2-201ENST00000296425 NCOA2Q15596 1464 aa31.91■■■□□ 2.7
PGRMC2-201ENST00000296425 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.9■■■□□ 2.7
PGRMC2-201ENST00000296425 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.88■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.88■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 CHD1O14646 1710 aa31.86■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 ARHGEF11O15085 1522 aa31.85■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 ITGAEP38570 1179 aa31.85■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.84■■■□□ 2.69
PGRMC2-201ENST00000296425 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
PGRMC2-201ENST00000296425 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.76■■■□□ 2.67
PGRMC2-201ENST00000296425 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
PGRMC2-201ENST00000296425 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.74■■■□□ 2.67
PGRMC2-201ENST00000296425 ARID3CA6NKF2 412 aa31.73■■■□□ 2.67
PGRMC2-201ENST00000296425 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
PGRMC2-201ENST00000296425 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.69■■■□□ 2.66
PGRMC2-201ENST00000296425 SHROOM2Q13796 1616 aa31.68■■■□□ 2.66
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCA8O94911 1581 aa31.68■■■□□ 2.66
PGRMC2-201ENST00000296425 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.66■■■□□ 2.66
PGRMC2-201ENST00000296425 MIA2Q96PC5 1412 aa31.65■■■□□ 2.66
PGRMC2-201ENST00000296425 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.64■■■□□ 2.66
PGRMC2-201ENST00000296425 PTPRGP23470 1445 aa31.63■■■□□ 2.65
PGRMC2-201ENST00000296425 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
PGRMC2-201ENST00000296425 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
PGRMC2-201ENST00000296425 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.55■■■□□ 2.64
PGRMC2-201ENST00000296425 ATP10BO94823 1461 aa31.51■■■□□ 2.63
PGRMC2-201ENST00000296425 PTPRKQ15262 1439 aa31.51■■■□□ 2.63
PGRMC2-201ENST00000296425 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.48■■■□□ 2.63
PGRMC2-201ENST00000296425 HFM1A2PYH4 1435 aa31.48■■■□□ 2.63
PGRMC2-201ENST00000296425 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.47■■■□□ 2.63
PGRMC2-201ENST00000296425 UACAQ9BZF9 1416 aa31.46■■■□□ 2.63
PGRMC2-201ENST00000296425 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.4■■■□□ 2.62
PGRMC2-201ENST00000296425 NAIPQ13075 1403 aa31.37■■■□□ 2.61
PGRMC2-201ENST00000296425 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.37■■■□□ 2.61
PGRMC2-201ENST00000296425 KIF14Q15058 1648 aa31.37■■■□□ 2.61
PGRMC2-201ENST00000296425 AKNAQ7Z591 1439 aa31.37■■■□□ 2.61
PGRMC2-201ENST00000296425 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
PGRMC2-201ENST00000296425 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
PGRMC2-201ENST00000296425 MAPKBP1O60336 1514 aa31.32■■■□□ 2.6
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC2Q92887 1545 aa31.32■■■□□ 2.6
PGRMC2-201ENST00000296425 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.29■■■□□ 2.6
PGRMC2-201ENST00000296425 DAPK1P53355 1430 aa31.28■■■□□ 2.6
PGRMC2-201ENST00000296425 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
PGRMC2-201ENST00000296425 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PGRMC2-201ENST00000296425 ROCK1Q13464 1354 aa31.25■■■□□ 2.59
PGRMC2-201ENST00000296425 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.25■■■□□ 2.59
PGRMC2-201ENST00000296425 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.24■■■□□ 2.59
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC5O15440 1437 aa31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms