RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295987.12

SYN1-201, Transcript of synapsin I, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SYN1, Length 3,299 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1-201ENST00000295987 EEA1Q15075 1411 aa22.97■■□□□ 1.27
SYN1-201ENST00000295987 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYN1-201ENST00000295987 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.93■■□□□ 1.26
SYN1-201ENST00000295987 P3H3Q8IVL6 736 aa22.89■■□□□ 1.26
SYN1-201ENST00000295987 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.89■■□□□ 1.25
SYN1-201ENST00000295987 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SYN1-201ENST00000295987 CUL7Q14999 1698 aa22.83■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.81■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 GRIN2BQ13224 1484 aa22.8■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.8■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 ADAMTS12P58397 1594 aa22.78■■□□□ 1.24
SYN1-201ENST00000295987 KIF27Q86VH2 1401 aa22.73■■□□□ 1.23
SYN1-201ENST00000295987 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SYN1-201ENST00000295987 CHD1O14646 1710 aa22.71■■□□□ 1.23
SYN1-201ENST00000295987 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SYN1-201ENST00000295987 KIF21BO75037 1637 aa22.66■■□□□ 1.22
SYN1-201ENST00000295987 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SYN1-201ENST00000295987 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.64■■□□□ 1.22
SYN1-201ENST00000295987 SYNJ2O15056 1496 aa22.64■■□□□ 1.21
SYN1-201ENST00000295987 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYN1-201ENST00000295987 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
SYN1-201ENST00000295987 IGF1RP08069 1367 aa22.57■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 ARAP1Q96P48 1450 aa22.53■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 PRXQ9BXM0 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 KCNH8Q96L42 1107 aa22.53■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.52■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 GRIN2AQ12879 1464 aa22.52■■□□□ 1.2
SYN1-201ENST00000295987 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.51■■□□□ 1.19
SYN1-201ENST00000295987 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.48■■□□□ 1.19
SYN1-201ENST00000295987 NUP160Q12769 1436 aa22.48■■□□□ 1.19
SYN1-201ENST00000295987 SHROOM2Q13796 1616 aa22.47■■□□□ 1.19
SYN1-201ENST00000295987 CEP170Q5SW79 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
SYN1-201ENST00000295987 BCANQ96GW7 911 aa22.45■■□□□ 1.18
SYN1-201ENST00000295987 ARID3CA6NKF2 412 aa22.41■■□□□ 1.18
SYN1-201ENST00000295987 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYN1-201ENST00000295987 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.39■■□□□ 1.17
SYN1-201ENST00000295987 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.39■■□□□ 1.17
SYN1-201ENST00000295987 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.31■■□□□ 1.16
SYN1-201ENST00000295987 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.31■■□□□ 1.16
SYN1-201ENST00000295987 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.29■■□□□ 1.16
SYN1-201ENST00000295987 IQGAP2Q13576 1575 aa22.27■■□□□ 1.15
SYN1-201ENST00000295987 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.23■■□□□ 1.15
SYN1-201ENST00000295987 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYN1-201ENST00000295987 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SYN1-201ENST00000295987 TRIM52Q96A61 297 aa22.2■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 OSCARQ8IYS5 282 aa22.19■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.19■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.18■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 SAMD9Q5K651 1589 aa22.18■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.17■■□□□ 1.14
SYN1-201ENST00000295987 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.13■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.12■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.12■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.12■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.09■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 KIAA0556O60303 1618 aa22.09■■□□□ 1.13
SYN1-201ENST00000295987 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.08■■□□□ 1.12
SYN1-201ENST00000295987 FKBP8Q14318 412 aa22.07■■□□□ 1.12
SYN1-201ENST00000295987 ARHGEF11O15085 1522 aa22.07■■□□□ 1.12
SYN1-201ENST00000295987 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.06■■□□□ 1.12
SYN1-201ENST00000295987 DISP1Q96F81 1524 aa22.06■■□□□ 1.12
SYN1-201ENST00000295987 FBLN2P98095 1184 aa22■■□□□ 1.11
SYN1-201ENST00000295987 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.99■■□□□ 1.11
SYN1-201ENST00000295987 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.99■■□□□ 1.11
SYN1-201ENST00000295987 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.98■■□□□ 1.11
SYN1-201ENST00000295987 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.97■■□□□ 1.11
SYN1-201ENST00000295987 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYN1-201ENST00000295987 FOXD1Q16676 465 aa21.95■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 ANP32CO43423 234 aa21.95■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.94■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 TONSLQ96HA7 1378 aa21.93■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 TIAM1Q13009 1591 aa21.92■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 MAPKBP1O60336 1514 aa21.92■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.91■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 JPH4Q96JJ6 628 aa21.91■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.9■■□□□ 1.1
SYN1-201ENST00000295987 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.87■■□□□ 1.09
SYN1-201ENST00000295987 NEFLP07196 543 aa21.86■■□□□ 1.09
SYN1-201ENST00000295987 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.86■■□□□ 1.09
SYN1-201ENST00000295987 ABCA8O94911 1581 aa21.85■■□□□ 1.09
SYN1-201ENST00000295987 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYN1-201ENST00000295987 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.81■■□□□ 1.08
SYN1-201ENST00000295987 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
SYN1-201ENST00000295987 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SYN1-201ENST00000295987 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.77■■□□□ 1.08
SYN1-201ENST00000295987 ABCC2Q92887 1545 aa21.77■■□□□ 1.08
SYN1-201ENST00000295987 PTPRKQ15262 1439 aa21.74■■□□□ 1.07
SYN1-201ENST00000295987 MYT1Q01538 1121 aa21.74■■□□□ 1.07
SYN1-201ENST00000295987 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.72■■□□□ 1.07
SYN1-201ENST00000295987 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SYN1-201ENST00000295987 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.7■■□□□ 1.06
SYN1-201ENST00000295987 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.7■■□□□ 1.06
SYN1-201ENST00000295987 HECW1Q76N89 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms