RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295925.5

CCNL1-201, Transcript of cyclin L1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNL1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1-201ENST00000295925 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.31■■□□□ 1.96
CCNL1-201ENST00000295925 PRXQ9BXM0 1461 aa27.31■■□□□ 1.96
CCNL1-201ENST00000295925 SHROOM2Q13796 1616 aa27.3■■□□□ 1.96
CCNL1-201ENST00000295925 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.27■■□□□ 1.96
CCNL1-201ENST00000295925 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.26■■□□□ 1.96
CCNL1-201ENST00000295925 ARAP1Q96P48 1450 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNL1-201ENST00000295925 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.21■■□□□ 1.95
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CCNL1-201ENST00000295925 JPH4Q96JJ6 628 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNL1-201ENST00000295925 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CCNL1-201ENST00000295925 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.15■■□□□ 1.94
CCNL1-201ENST00000295925 KIF21BO75037 1637 aa27.14■■□□□ 1.94
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CCNL1-201ENST00000295925 GOLGA3Q08378 1498 aa26.98■■□□□ 1.91
CCNL1-201ENST00000295925 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.98■■□□□ 1.91
CCNL1-201ENST00000295925 DISP1Q96F81 1524 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNL1-201ENST00000295925 KIAA0556O60303 1618 aa26.95■■□□□ 1.91
CCNL1-201ENST00000295925 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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CCNL1-201ENST00000295925 PTPRGP23470 1445 aa26.86■■□□□ 1.89
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CCNL1-201ENST00000295925 P3H3Q8IVL6 736 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNL1-201ENST00000295925 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNL1-201ENST00000295925 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.7■■□□□ 1.87
CCNL1-201ENST00000295925 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.68■■□□□ 1.86
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CCNL1-201ENST00000295925 ABCC2Q92887 1545 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNL1-201ENST00000295925 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNL1-201ENST00000295925 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.62■■□□□ 1.85
CCNL1-201ENST00000295925 ABCA8O94911 1581 aa26.62■■□□□ 1.85
CCNL1-201ENST00000295925 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
CCNL1-201ENST00000295925 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNL1-201ENST00000295925 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNL1-201ENST00000295925 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CCNL1-201ENST00000295925 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CCNL1-201ENST00000295925 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNL1-201ENST00000295925 MAPKBP1O60336 1514 aa26.53■■□□□ 1.84
CCNL1-201ENST00000295925 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.51■■□□□ 1.83
CCNL1-201ENST00000295925 CLIP1P30622 1438 aa26.51■■□□□ 1.83
CCNL1-201ENST00000295925 ARID3CA6NKF2 412 aa26.5■■□□□ 1.83
CCNL1-201ENST00000295925 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNL1-201ENST00000295925 ASXL2Q76L83 1435 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNL1-201ENST00000295925 CEP162Q5TB80 1403 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNL1-201ENST00000295925 FMN1Q68DA7 1419 aa26.42■■□□□ 1.82
CCNL1-201ENST00000295925 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CCNL1-201ENST00000295925 DIP2BQ9P265 1576 aa26.4■■□□□ 1.82
CCNL1-201ENST00000295925 ATP10BO94823 1461 aa26.38■■□□□ 1.81
CCNL1-201ENST00000295925 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.38■■□□□ 1.81
CCNL1-201ENST00000295925 HECW1Q76N89 1606 aa26.36■■□□□ 1.81
CCNL1-201ENST00000295925 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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CCNL1-201ENST00000295925 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.33■■□□□ 1.81
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CCNL1-201ENST00000295925 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.25■■□□□ 1.79
CCNL1-201ENST00000295925 KCNH8Q96L42 1107 aa26.23■■□□□ 1.79
CCNL1-201ENST00000295925 GLI2P10070 1586 aa26.23■■□□□ 1.79
CCNL1-201ENST00000295925 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNL1-201ENST00000295925 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.17■■□□□ 1.78
CCNL1-201ENST00000295925 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNL1-201ENST00000295925 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNL1-201ENST00000295925 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CCNL1-201ENST00000295925 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.12■■□□□ 1.77
CCNL1-201ENST00000295925 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.08■■□□□ 1.77
CCNL1-201ENST00000295925 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.08■■□□□ 1.77
CCNL1-201ENST00000295925 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CCNL1-201ENST00000295925 CD109Q6YHK3 1445 aa26.05■■□□□ 1.76
CCNL1-201ENST00000295925 KIF14Q15058 1648 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNL1-201ENST00000295925 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNL1-201ENST00000295925 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNL1-201ENST00000295925 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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CCNL1-201ENST00000295925 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNL1-201ENST00000295925 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNL1-201ENST00000295925 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.88■■□□□ 1.73
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CCNL1-201ENST00000295925 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.82■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 PLCH2O75038 1416 aa25.81■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.81■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 NEO1Q92859 1461 aa25.8■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 PREX2Q70Z35 1606 aa25.8■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 MAP3K1Q13233 1512 aa25.78■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.78■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 APLP2Q06481 763 aa25.77■■□□□ 1.72
CCNL1-201ENST00000295925 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.76■■□□□ 1.71
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