RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293261.7

TMEM143-201, Transcript of transmembrane protein 143, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM143, Length 2,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143-201ENST00000293261 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.32■■□□□ 1.16
TMEM143-201ENST00000293261 PBRM1Q86U86 1689 aa22.31■■□□□ 1.16
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TMEM143-201ENST00000293261 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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TMEM143-201ENST00000293261 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMEM143-201ENST00000293261 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMEM143-201ENST00000293261 GRIN2BQ13224 1484 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM143-201ENST00000293261 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM143-201ENST00000293261 ADAMTS12P58397 1594 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM143-201ENST00000293261 P3H3Q8IVL6 736 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM143-201ENST00000293261 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM143-201ENST00000293261 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM143-201ENST00000293261 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM143-201ENST00000293261 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM143-201ENST00000293261 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM143-201ENST00000293261 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TMEM143-201ENST00000293261 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TMEM143-201ENST00000293261 TIAM1Q13009 1591 aa21.96■■□□□ 1.11
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TMEM143-201ENST00000293261 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 SAMD9Q5K651 1589 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 GRIN2AQ12879 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 IQGAP2Q13576 1575 aa21.92■■□□□ 1.1
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TMEM143-201ENST00000293261 SYNJ2O15056 1496 aa21.91■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 MAP3K1Q13233 1512 aa21.9■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.89■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.89■■□□□ 1.1
TMEM143-201ENST00000293261 ITGAEP38570 1179 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM143-201ENST00000293261 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.83■■□□□ 1.09
TMEM143-201ENST00000293261 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.82■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.82■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 CEP170Q5SW79 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.82■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.81■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 FMN1Q68DA7 1419 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 NEUROD1Q13562 356 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 NUP160Q12769 1436 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM143-201ENST00000293261 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TMEM143-201ENST00000293261 FBLN2P98095 1184 aa21.75■■□□□ 1.07
TMEM143-201ENST00000293261 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TMEM143-201ENST00000293261 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TMEM143-201ENST00000293261 KIAA0556O60303 1618 aa21.71■■□□□ 1.07
TMEM143-201ENST00000293261 CHD1O14646 1710 aa21.71■■□□□ 1.07
TMEM143-201ENST00000293261 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TMEM143-201ENST00000293261 DISP1Q96F81 1524 aa21.7■■□□□ 1.06
TMEM143-201ENST00000293261 MYT1Q01538 1121 aa21.68■■□□□ 1.06
TMEM143-201ENST00000293261 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.68■■□□□ 1.06
TMEM143-201ENST00000293261 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.63■■□□□ 1.05
TMEM143-201ENST00000293261 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.63■■□□□ 1.05
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TMEM143-201ENST00000293261 HECW1Q76N89 1606 aa21.59■■□□□ 1.05
TMEM143-201ENST00000293261 JPH4Q96JJ6 628 aa21.56■■□□□ 1.04
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TMEM143-201ENST00000293261 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.56■■□□□ 1.04
TMEM143-201ENST00000293261 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.55■■□□□ 1.04
TMEM143-201ENST00000293261 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.54■■□□□ 1.04
TMEM143-201ENST00000293261 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.54■■□□□ 1.04
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TMEM143-201ENST00000293261 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.53■■□□□ 1.04
TMEM143-201ENST00000293261 NCOA2Q15596 1464 aa21.52■■□□□ 1.04
TMEM143-201ENST00000293261 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.5■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 SHROOM2Q13796 1616 aa21.49■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 MIER1Q8N108 512 aa21.48■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.46■■□□□ 1.03
TMEM143-201ENST00000293261 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TMEM143-201ENST00000293261 MAPKBP1O60336 1514 aa21.45■■□□□ 1.02
TMEM143-201ENST00000293261 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.45■■□□□ 1.02
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TMEM143-201ENST00000293261 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.41■■□□□ 1.02
TMEM143-201ENST00000293261 ARHGEF11O15085 1522 aa21.39■■□□□ 1.01
TMEM143-201ENST00000293261 ABCA8O94911 1581 aa21.38■■□□□ 1.01
TMEM143-201ENST00000293261 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.37■■□□□ 1.01
TMEM143-201ENST00000293261 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.35■■□□□ 1.01
TMEM143-201ENST00000293261 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.32■■□□□ 1
TMEM143-201ENST00000293261 PTPRGP23470 1445 aa21.31■■□□□ 1
TMEM143-201ENST00000293261 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.3■■□□□ 1
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TMEM143-201ENST00000293261 NAIPQ13075 1403 aa21.27■■□□□ 1
TMEM143-201ENST00000293261 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.27■□□□□ 0.99
TMEM143-201ENST00000293261 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
TMEM143-201ENST00000293261 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
TMEM143-201ENST00000293261 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
TMEM143-201ENST00000293261 ATP10BO94823 1461 aa21.22■□□□□ 0.99
TMEM143-201ENST00000293261 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.21■□□□□ 0.99
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TMEM143-201ENST00000293261 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
TMEM143-201ENST00000293261 ABCC2Q92887 1545 aa21.16■□□□□ 0.98
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