RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 ARAP1Q96P48 1450 aa37■■■■□ 3.51
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TTLL1-201ENST00000266254 KIF21BO75037 1637 aa36.88■■■■□ 3.49
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TTLL1-201ENST00000266254 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.78■■■■□ 3.48
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TTLL1-201ENST00000266254 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.28■■■■□ 3.4
TTLL1-201ENST00000266254 PTPRGP23470 1445 aa36.27■■■■□ 3.4
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TTLL1-201ENST00000266254 CLIP1P30622 1438 aa36.12■■■■□ 3.37
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TTLL1-201ENST00000266254 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.82■■■■□ 3.33
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TTLL1-201ENST00000266254 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.76■■■■□ 3.32
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TTLL1-201ENST00000266254 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.53■■■■□ 3.28
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TTLL1-201ENST00000266254 ATP10BO94823 1461 aa35.47■■■■□ 3.27
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TTLL1-201ENST00000266254 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.37■■■■□ 3.25
TTLL1-201ENST00000266254 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.32■■■■□ 3.25
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TTLL1-201ENST00000266254 CD109Q6YHK3 1445 aa35.24■■■■□ 3.23
TTLL1-201ENST00000266254 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.24■■■■□ 3.23
TTLL1-201ENST00000266254 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.23■■■■□ 3.23
TTLL1-201ENST00000266254 HECW1Q76N89 1606 aa35.23■■■■□ 3.23
TTLL1-201ENST00000266254 TIAM1Q13009 1591 aa35.22■■■■□ 3.23
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TTLL1-201ENST00000266254 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
TTLL1-201ENST00000266254 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.17■■■■□ 3.22
TTLL1-201ENST00000266254 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.14■■■■□ 3.22
TTLL1-201ENST00000266254 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.1■■■■□ 3.21
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.1■■■■□ 3.21
TTLL1-201ENST00000266254 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TTLL1-201ENST00000266254 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
TTLL1-201ENST00000266254 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.02■■■■□ 3.2
TTLL1-201ENST00000266254 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
TTLL1-201ENST00000266254 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
TTLL1-201ENST00000266254 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.94■■■■□ 3.18
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TTLL1-201ENST00000266254 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.87■■■■□ 3.17
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TTLL1-201ENST00000266254 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.86■■■■□ 3.17
TTLL1-201ENST00000266254 NEO1Q92859 1461 aa34.86■■■■□ 3.17
TTLL1-201ENST00000266254 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.83■■■■□ 3.17
TTLL1-201ENST00000266254 KIF14Q15058 1648 aa34.83■■■■□ 3.17
TTLL1-201ENST00000266254 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.81■■■■□ 3.16
TTLL1-201ENST00000266254 FANCAO15360 1455 aa34.79■■■■□ 3.16
TTLL1-201ENST00000266254 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
TTLL1-201ENST00000266254 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.74■■■■□ 3.15
TTLL1-201ENST00000266254 PLCH2O75038 1416 aa34.74■■■■□ 3.15
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