RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.31■■■□□ 2.12
SRSF1-201ENST00000258962 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.3■■■□□ 2.12
SRSF1-201ENST00000258962 JPH4Q96JJ6 628 aa28.25■■■□□ 2.11
SRSF1-201ENST00000258962 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
SRSF1-201ENST00000258962 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.22■■■□□ 2.11
SRSF1-201ENST00000258962 ARAP1Q96P48 1450 aa28.21■■■□□ 2.11
SRSF1-201ENST00000258962 KIF21BO75037 1637 aa28.21■■■□□ 2.11
SRSF1-201ENST00000258962 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.2■■■□□ 2.11
SRSF1-201ENST00000258962 SHROOM2Q13796 1616 aa28.16■■■□□ 2.1
SRSF1-201ENST00000258962 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SRSF1-201ENST00000258962 GOLGA3Q08378 1498 aa28.13■■■□□ 2.09
SRSF1-201ENST00000258962 PRXQ9BXM0 1461 aa28.11■■■□□ 2.09
SRSF1-201ENST00000258962 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.09■■■□□ 2.09
SRSF1-201ENST00000258962 IQGAP2Q13576 1575 aa28.02■■■□□ 2.08
SRSF1-201ENST00000258962 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.01■■■□□ 2.07
SRSF1-201ENST00000258962 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
SRSF1-201ENST00000258962 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SRSF1-201ENST00000258962 CEP162Q5TB80 1403 aa27.88■■■□□ 2.05
SRSF1-201ENST00000258962 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.87■■■□□ 2.05
SRSF1-201ENST00000258962 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SRSF1-201ENST00000258962 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.86■■■□□ 2.05
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRGP23470 1445 aa27.85■■■□□ 2.05
SRSF1-201ENST00000258962 DISP1Q96F81 1524 aa27.81■■■□□ 2.04
SRSF1-201ENST00000258962 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SRSF1-201ENST00000258962 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
SRSF1-201ENST00000258962 KIAA0556O60303 1618 aa27.72■■■□□ 2.03
SRSF1-201ENST00000258962 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
SRSF1-201ENST00000258962 P3H3Q8IVL6 736 aa27.66■■■□□ 2.02
SRSF1-201ENST00000258962 CLIP1P30622 1438 aa27.65■■■□□ 2.02
SRSF1-201ENST00000258962 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.63■■■□□ 2.01
SRSF1-201ENST00000258962 UACAQ9BZF9 1416 aa27.63■■■□□ 2.01
SRSF1-201ENST00000258962 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.56■■■□□ 2
SRSF1-201ENST00000258962 ABCC2Q92887 1545 aa27.53■■■□□ 2
SRSF1-201ENST00000258962 SAMD9Q5K651 1589 aa27.53■■■□□ 2
SRSF1-201ENST00000258962 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
SRSF1-201ENST00000258962 MAPKBP1O60336 1514 aa27.48■■□□□ 1.99
SRSF1-201ENST00000258962 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.46■■□□□ 1.99
SRSF1-201ENST00000258962 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.44■■□□□ 1.98
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.43■■□□□ 1.98
SRSF1-201ENST00000258962 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.42■■□□□ 1.98
SRSF1-201ENST00000258962 ABCA8O94911 1581 aa27.42■■□□□ 1.98
SRSF1-201ENST00000258962 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.42■■□□□ 1.98
SRSF1-201ENST00000258962 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.41■■□□□ 1.98
SRSF1-201ENST00000258962 ASXL2Q76L83 1435 aa27.38■■□□□ 1.97
SRSF1-201ENST00000258962 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.38■■□□□ 1.97
SRSF1-201ENST00000258962 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SRSF1-201ENST00000258962 ARID3CA6NKF2 412 aa27.33■■□□□ 1.97
SRSF1-201ENST00000258962 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.3■■□□□ 1.96
SRSF1-201ENST00000258962 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SRSF1-201ENST00000258962 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SRSF1-201ENST00000258962 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.28■■□□□ 1.96
SRSF1-201ENST00000258962 DIP2BQ9P265 1576 aa27.28■■□□□ 1.96
SRSF1-201ENST00000258962 FMN1Q68DA7 1419 aa27.27■■□□□ 1.96
SRSF1-201ENST00000258962 ATP10BO94823 1461 aa27.25■■□□□ 1.95
SRSF1-201ENST00000258962 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SRSF1-201ENST00000258962 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.22■■□□□ 1.95
SRSF1-201ENST00000258962 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SRSF1-201ENST00000258962 KCNH8Q96L42 1107 aa27.21■■□□□ 1.95
SRSF1-201ENST00000258962 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SRSF1-201ENST00000258962 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SRSF1-201ENST00000258962 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.16■■□□□ 1.94
SRSF1-201ENST00000258962 GLI2P10070 1586 aa27.16■■□□□ 1.94
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.13■■□□□ 1.93
SRSF1-201ENST00000258962 TSPOAP1O95153 1857 aa27.09■■□□□ 1.93
SRSF1-201ENST00000258962 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SRSF1-201ENST00000258962 HECW1Q76N89 1606 aa27.07■■□□□ 1.92
SRSF1-201ENST00000258962 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SRSF1-201ENST00000258962 CD109Q6YHK3 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
SRSF1-201ENST00000258962 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.02■■□□□ 1.92
SRSF1-201ENST00000258962 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SRSF1-201ENST00000258962 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.01■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 APLP2Q06481 763 aa27■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.99■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.98■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.96■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 TIAM1Q13009 1591 aa26.96■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 MAP3K1Q13233 1512 aa26.96■■□□□ 1.91
SRSF1-201ENST00000258962 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.91■■□□□ 1.9
SRSF1-201ENST00000258962 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.91■■□□□ 1.9
SRSF1-201ENST00000258962 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.9■■□□□ 1.9
SRSF1-201ENST00000258962 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.9■■□□□ 1.9
SRSF1-201ENST00000258962 KDM6BO15054 1643 aa26.88■■□□□ 1.89
SRSF1-201ENST00000258962 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SRSF1-201ENST00000258962 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SRSF1-201ENST00000258962 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.884e-20■□□□□ 9.3
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.8■■□□□ 1.88
SRSF1-201ENST00000258962 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.78■■□□□ 1.88
SRSF1-201ENST00000258962 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SRSF1-201ENST00000258962 KIF14Q15058 1648 aa26.74■■□□□ 1.87
SRSF1-201ENST00000258962 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.74■■□□□ 1.87
SRSF1-201ENST00000258962 NEO1Q92859 1461 aa26.73■■□□□ 1.87
SRSF1-201ENST00000258962 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.71■■□□□ 1.87
SRSF1-201ENST00000258962 PLCH2O75038 1416 aa26.7■■□□□ 1.86
SRSF1-201ENST00000258962 FANCAO15360 1455 aa26.69■■□□□ 1.86
SRSF1-201ENST00000258962 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.68■■□□□ 1.86
SRSF1-201ENST00000258962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.68■■□□□ 1.86
SRSF1-201ENST00000258962 AKNAQ7Z591 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
SRSF1-201ENST00000258962 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
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