RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 APLP2Q06481 763 aa28.48■■■□□ 2.15
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PDLIM4-201ENST00000253754 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.32■■■□□ 2.12
PDLIM4-201ENST00000253754 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.3■■■□□ 2.12
PDLIM4-201ENST00000253754 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PDLIM4-201ENST00000253754 ADAMTS12P58397 1594 aa28.26■■■□□ 2.12
PDLIM4-201ENST00000253754 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.25■■■□□ 2.11
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PDLIM4-201ENST00000253754 P3H3Q8IVL6 736 aa28.15■■■□□ 2.1
PDLIM4-201ENST00000253754 FBLN2P98095 1184 aa28.13■■■□□ 2.09
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PDLIM4-201ENST00000253754 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PDLIM4-201ENST00000253754 GRIN2AQ12879 1464 aa28.05■■■□□ 2.08
PDLIM4-201ENST00000253754 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.04■■■□□ 2.08
PDLIM4-201ENST00000253754 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.03■■■□□ 2.08
PDLIM4-201ENST00000253754 SYNJ2O15056 1496 aa28.03■■■□□ 2.08
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PDLIM4-201ENST00000253754 SAMD9Q5K651 1589 aa27.94■■■□□ 2.06
PDLIM4-201ENST00000253754 TIAM1Q13009 1591 aa27.92■■■□□ 2.06
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PDLIM4-201ENST00000253754 CEP170Q5SW79 1584 aa27.87■■■□□ 2.05
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PDLIM4-201ENST00000253754 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.82■■■□□ 2.04
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PDLIM4-201ENST00000253754 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.79■■■□□ 2.04
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PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
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PDLIM4-201ENST00000253754 HECW1Q76N89 1606 aa27.52■■■□□ 2
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PDLIM4-201ENST00000253754 SHROOM2Q13796 1616 aa27.4■■□□□ 1.98
PDLIM4-201ENST00000253754 MAPKBP1O60336 1514 aa27.38■■□□□ 1.97
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PDLIM4-201ENST00000253754 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.35■■□□□ 1.97
PDLIM4-201ENST00000253754 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.35■■□□□ 1.97
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PDLIM4-201ENST00000253754 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
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PDLIM4-201ENST00000253754 NEUROD1Q13562 356 aa27.29■■□□□ 1.96
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PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF11O15085 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
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PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC2Q92887 1545 aa27.03■■□□□ 1.92
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PDLIM4-201ENST00000253754 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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PDLIM4-201ENST00000253754 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27■■□□□ 1.91
PDLIM4-201ENST00000253754 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.99■■□□□ 1.91
PDLIM4-201ENST00000253754 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.97■■□□□ 1.91
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