RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229195.7

CNOT2-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT2, Length 3,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-201ENST00000229195 CUL7Q14999 1698 aa16.65■□□□□ 0.26
CNOT2-201ENST00000229195 FBLN2P98095 1184 aa16.64■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 PBRM1Q86U86 1689 aa16.63■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 GRIN2BQ13224 1484 aa16.61■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 APLP2Q06481 763 aa16.61■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.59■□□□□ 0.25
CNOT2-201ENST00000229195 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.56■□□□□ 0.24
CNOT2-201ENST00000229195 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.56■□□□□ 0.24
CNOT2-201ENST00000229195 ADAMTS12P58397 1594 aa16.55■□□□□ 0.24
CNOT2-201ENST00000229195 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CNOT2-201ENST00000229195 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CNOT2-201ENST00000229195 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.52■□□□□ 0.23
CNOT2-201ENST00000229195 ARID3CA6NKF2 412 aa16.45■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 GRIN2AQ12879 1464 aa16.44■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 MYT1Q01538 1121 aa16.42■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 SYNJ2O15056 1496 aa16.4■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 IQGAP2Q13576 1575 aa16.4■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.22
CNOT2-201ENST00000229195 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.38■□□□□ 0.21
CNOT2-201ENST00000229195 CEP170Q5SW79 1584 aa16.35■□□□□ 0.21
CNOT2-201ENST00000229195 SAMD9Q5K651 1589 aa16.34■□□□□ 0.21
CNOT2-201ENST00000229195 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CNOT2-201ENST00000229195 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.33■□□□□ 0.21
CNOT2-201ENST00000229195 FMN1Q68DA7 1419 aa16.31■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 JPH4Q96JJ6 628 aa16.3■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 ITGAEP38570 1179 aa16.3■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 TIAM1Q13009 1591 aa16.3■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.29■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 DISP1Q96F81 1524 aa16.27■□□□□ 0.2
CNOT2-201ENST00000229195 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.27■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 NUP160Q12769 1436 aa16.26■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.26■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 NEUROD1Q13562 356 aa16.26■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.26■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 CHD1O14646 1710 aa16.25■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 KIAA0556O60303 1618 aa16.23■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.22■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.22■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.21■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
CNOT2-201ENST00000229195 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.19■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.18■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.17■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 MAP3K1Q13233 1512 aa16.16■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.16■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.15■□□□□ 0.18
CNOT2-201ENST00000229195 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.13■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 HECW1Q76N89 1606 aa16.11■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.1■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CNOT2-201ENST00000229195 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.07■□□□□ 0.16
CNOT2-201ENST00000229195 NCOA2Q15596 1464 aa16.07■□□□□ 0.16
CNOT2-201ENST00000229195 PTPRGP23470 1445 aa16.06■□□□□ 0.16
CNOT2-201ENST00000229195 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.06■□□□□ 0.16
CNOT2-201ENST00000229195 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CNOT2-201ENST00000229195 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.02■□□□□ 0.16
CNOT2-201ENST00000229195 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.01■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.98■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.97■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.97■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 SHROOM2Q13796 1616 aa15.96■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 ABCA8O94911 1581 aa15.96■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 ATP10BO94823 1461 aa15.96■□□□□ 0.15
CNOT2-201ENST00000229195 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 OSCARQ8IYS5 282 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 PTPRKQ15262 1439 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 UACAQ9BZF9 1416 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.92■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 KIF14Q15058 1648 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 ARHGEF11O15085 1522 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 KCNH8Q96L42 1107 aa15.91■□□□□ 0.14
CNOT2-201ENST00000229195 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.89■□□□□ 0.13
CNOT2-201ENST00000229195 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.89■□□□□ 0.13
CNOT2-201ENST00000229195 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNOT2-201ENST00000229195 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CNOT2-201ENST00000229195 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.86■□□□□ 0.13
CNOT2-201ENST00000229195 ABCC2Q92887 1545 aa15.82■□□□□ 0.12
CNOT2-201ENST00000229195 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CNOT2-201ENST00000229195 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 12.8
CNOT2-201ENST00000229195 MIA2Q96PC5 1412 aa15.79■□□□□ 0.12
CNOT2-201ENST00000229195 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CNOT2-201ENST00000229195 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.111e-8■■■■□ 24.2
CNOT2-201ENST00000229195 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms