RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 FBLN2P98095 1184 aa28.72■■■□□ 2.19
CBX1-201ENST00000225603 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.67■■■□□ 2.18
CBX1-201ENST00000225603 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
CBX1-201ENST00000225603 CEP170Q5SW79 1584 aa28.57■■■□□ 2.16
CBX1-201ENST00000225603 NUP160Q12769 1436 aa28.54■■■□□ 2.16
CBX1-201ENST00000225603 ARAP1Q96P48 1450 aa28.53■■■□□ 2.16
CBX1-201ENST00000225603 CHD1O14646 1710 aa28.53■■■□□ 2.16
CBX1-201ENST00000225603 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.52■■■□□ 2.16
CBX1-201ENST00000225603 IQGAP2Q13576 1575 aa28.51■■■□□ 2.15
CBX1-201ENST00000225603 P3H3Q8IVL6 736 aa28.49■■■□□ 2.15
CBX1-201ENST00000225603 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.43■■■□□ 2.14
CBX1-201ENST00000225603 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.42■■■□□ 2.14
CBX1-201ENST00000225603 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.4■■■□□ 2.14
CBX1-201ENST00000225603 SAMD9Q5K651 1589 aa28.39■■■□□ 2.14
CBX1-201ENST00000225603 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.38■■■□□ 2.13
CBX1-201ENST00000225603 JPH4Q96JJ6 628 aa28.34■■■□□ 2.13
CBX1-201ENST00000225603 DISP1Q96F81 1524 aa28.3■■■□□ 2.12
CBX1-201ENST00000225603 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CBX1-201ENST00000225603 KIAA0556O60303 1618 aa28.24■■■□□ 2.11
CBX1-201ENST00000225603 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.22■■■□□ 2.11
CBX1-201ENST00000225603 FMN1Q68DA7 1419 aa28.18■■■□□ 2.1
CBX1-201ENST00000225603 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CBX1-201ENST00000225603 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CBX1-201ENST00000225603 SHROOM2Q13796 1616 aa28.15■■■□□ 2.1
CBX1-201ENST00000225603 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CBX1-201ENST00000225603 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.15■■■□□ 2.1
CBX1-201ENST00000225603 OSCARQ8IYS5 282 aa28.13■■■□□ 2.09
CBX1-201ENST00000225603 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.12■■■□□ 2.09
CBX1-201ENST00000225603 APLP2Q06481 763 aa28.11■■■□□ 2.09
CBX1-201ENST00000225603 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CBX1-201ENST00000225603 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.07■■■□□ 2.08
CBX1-201ENST00000225603 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.07■■■□□ 2.08
CBX1-201ENST00000225603 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.05■■■□□ 2.08
CBX1-201ENST00000225603 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CBX1-201ENST00000225603 TIAM1Q13009 1591 aa27.96■■■□□ 2.07
CBX1-201ENST00000225603 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.96■■■□□ 2.07
CBX1-201ENST00000225603 PTPRGP23470 1445 aa27.95■■■□□ 2.07
CBX1-201ENST00000225603 MAP3K1Q13233 1512 aa27.95■■■□□ 2.06
CBX1-201ENST00000225603 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.94■■■□□ 2.06
CBX1-201ENST00000225603 ARID3CA6NKF2 412 aa27.92■■■□□ 2.06
CBX1-201ENST00000225603 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.91■■■□□ 2.06
CBX1-201ENST00000225603 HECW1Q76N89 1606 aa27.9■■■□□ 2.06
CBX1-201ENST00000225603 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.89■■■□□ 2.06
CBX1-201ENST00000225603 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 ABCA8O94911 1581 aa27.87■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.86■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 HRCP23327 699 aa27.83■■■□□ 2.05
CBX1-201ENST00000225603 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.82■■■□□ 2.04
CBX1-201ENST00000225603 UACAQ9BZF9 1416 aa27.78■■■□□ 2.04
CBX1-201ENST00000225603 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.75■■■□□ 2.03
CBX1-201ENST00000225603 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.74■■■□□ 2.03
CBX1-201ENST00000225603 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CBX1-201ENST00000225603 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CBX1-201ENST00000225603 ATP10BO94823 1461 aa27.71■■■□□ 2.03
CBX1-201ENST00000225603 ABCC2Q92887 1545 aa27.68■■■□□ 2.02
CBX1-201ENST00000225603 ARHGEF11O15085 1522 aa27.65■■■□□ 2.02
CBX1-201ENST00000225603 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.65■■■□□ 2.02
CBX1-201ENST00000225603 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.64■■■□□ 2.01
CBX1-201ENST00000225603 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.62■■■□□ 2.01
CBX1-201ENST00000225603 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CBX1-201ENST00000225603 NCOA2Q15596 1464 aa27.59■■■□□ 2.01
CBX1-201ENST00000225603 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.57■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.55■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.53■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.53■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.53■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.53■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CBX1-201ENST00000225603 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CBX1-201ENST00000225603 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.47■■□□□ 1.99
CBX1-201ENST00000225603 KIF14Q15058 1648 aa27.46■■□□□ 1.99
CBX1-201ENST00000225603 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.46■■□□□ 1.99
CBX1-201ENST00000225603 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.44■■□□□ 1.98
CBX1-201ENST00000225603 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.41■■□□□ 1.98
CBX1-201ENST00000225603 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CBX1-201ENST00000225603 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.36■■□□□ 1.97
CBX1-201ENST00000225603 KCNH8Q96L42 1107 aa27.36■■□□□ 1.97
CBX1-201ENST00000225603 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 ITGAEP38570 1179 aa27.3■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 ASXL2Q76L83 1435 aa27.29■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.29■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 MIA2Q96PC5 1412 aa27.28■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.28■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
CBX1-201ENST00000225603 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.961e-6■□□□□ 10.3
CBX1-201ENST00000225603 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CBX1-201ENST00000225603 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CBX1-201ENST00000225603 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.24■■□□□ 1.95
CBX1-201ENST00000225603 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CBX1-201ENST00000225603 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.23■■□□□ 1.95
CBX1-201ENST00000225603 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.21■■□□□ 1.95
CBX1-201ENST00000225603 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CBX1-201ENST00000225603 PTPRKQ15262 1439 aa27.15■■□□□ 1.94
CBX1-201ENST00000225603 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms