RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TVP23C-201ENST00000225576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
TVP23C-201ENST00000225576 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
TVP23C-201ENST00000225576 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.19■■□□□ 1.78
TVP23C-201ENST00000225576 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.18■■□□□ 1.78
TVP23C-201ENST00000225576 SYNJ2O15056 1496 aa26.16■■□□□ 1.78
TVP23C-201ENST00000225576 GRIN2AQ12879 1464 aa26.15■■□□□ 1.78
TVP23C-201ENST00000225576 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TVP23C-201ENST00000225576 APLP2Q06481 763 aa26.11■■□□□ 1.77
TVP23C-201ENST00000225576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.07■■□□□ 1.76
TVP23C-201ENST00000225576 IQGAP2Q13576 1575 aa26.06■■□□□ 1.76
TVP23C-201ENST00000225576 SAMD9Q5K651 1589 aa26.04■■□□□ 1.76
TVP23C-201ENST00000225576 P3H3Q8IVL6 736 aa26.04■■□□□ 1.76
TVP23C-201ENST00000225576 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.02■■□□□ 1.76
TVP23C-201ENST00000225576 NUP160Q12769 1436 aa25.99■■□□□ 1.75
TVP23C-201ENST00000225576 FBLN2P98095 1184 aa25.98■■□□□ 1.75
TVP23C-201ENST00000225576 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.98■■□□□ 1.75
TVP23C-201ENST00000225576 FMN1Q68DA7 1419 aa25.97■■□□□ 1.75
TVP23C-201ENST00000225576 CEP170Q5SW79 1584 aa25.94■■□□□ 1.74
TVP23C-201ENST00000225576 MAP3K1Q13233 1512 aa25.93■■□□□ 1.74
TVP23C-201ENST00000225576 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.91■■□□□ 1.74
TVP23C-201ENST00000225576 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TVP23C-201ENST00000225576 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.89■■□□□ 1.73
TVP23C-201ENST00000225576 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TVP23C-201ENST00000225576 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TVP23C-201ENST00000225576 DISP1Q96F81 1524 aa25.83■■□□□ 1.73
TVP23C-201ENST00000225576 TIAM1Q13009 1591 aa25.82■■□□□ 1.72
TVP23C-201ENST00000225576 JPH4Q96JJ6 628 aa25.8■■□□□ 1.72
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA0556O60303 1618 aa25.79■■□□□ 1.72
TVP23C-201ENST00000225576 CHD1O14646 1710 aa25.76■■□□□ 1.71
TVP23C-201ENST00000225576 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TVP23C-201ENST00000225576 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.74■■□□□ 1.71
TVP23C-201ENST00000225576 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.73■■□□□ 1.71
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.73■■□□□ 1.71
TVP23C-201ENST00000225576 HECW1Q76N89 1606 aa25.64■■□□□ 1.7
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.63■■□□□ 1.69
TVP23C-201ENST00000225576 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
TVP23C-201ENST00000225576 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TVP23C-201ENST00000225576 SHROOM2Q13796 1616 aa25.58■■□□□ 1.69
TVP23C-201ENST00000225576 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TVP23C-201ENST00000225576 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.57■■□□□ 1.68
TVP23C-201ENST00000225576 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.55■■□□□ 1.68
TVP23C-201ENST00000225576 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.54■■□□□ 1.68
TVP23C-201ENST00000225576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.54■■□□□ 1.68
TVP23C-201ENST00000225576 OSCARQ8IYS5 282 aa25.53■■□□□ 1.68
TVP23C-201ENST00000225576 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.49■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.49■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.49■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.48■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 HRCP23327 699 aa25.47■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 PTPRGP23470 1445 aa25.47■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TVP23C-201ENST00000225576 ABCA8O94911 1581 aa25.44■■□□□ 1.66
TVP23C-201ENST00000225576 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.43■■□□□ 1.66
TVP23C-201ENST00000225576 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TVP23C-201ENST00000225576 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TVP23C-201ENST00000225576 NCOA2Q15596 1464 aa25.4■■□□□ 1.66
TVP23C-201ENST00000225576 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 ARID3CA6NKF2 412 aa25.37■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF11O15085 1522 aa25.37■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.35■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 UACAQ9BZF9 1416 aa25.33■■□□□ 1.65
TVP23C-201ENST00000225576 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.32■■□□□ 1.64
TVP23C-201ENST00000225576 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.31■■□□□ 1.64
TVP23C-201ENST00000225576 ATP10BO94823 1461 aa25.3■■□□□ 1.64
TVP23C-201ENST00000225576 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TVP23C-201ENST00000225576 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TVP23C-201ENST00000225576 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.22■■□□□ 1.63
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC2Q92887 1545 aa25.22■■□□□ 1.63
TVP23C-201ENST00000225576 MIA2Q96PC5 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
TVP23C-201ENST00000225576 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.2■■□□□ 1.62
TVP23C-201ENST00000225576 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TVP23C-201ENST00000225576 ITGAEP38570 1179 aa25.17■■□□□ 1.62
TVP23C-201ENST00000225576 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TVP23C-201ENST00000225576 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.16■■□□□ 1.62
TVP23C-201ENST00000225576 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.14■■□□□ 1.61
TVP23C-201ENST00000225576 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.08■■□□□ 1.61
TVP23C-201ENST00000225576 KIF14Q15058 1648 aa25.08■■□□□ 1.61
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.06■■□□□ 1.6
TVP23C-201ENST00000225576 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TVP23C-201ENST00000225576 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.04■■□□□ 1.6
TVP23C-201ENST00000225576 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.02■■□□□ 1.6
TVP23C-201ENST00000225576 PTPRKQ15262 1439 aa25.02■■□□□ 1.6
TVP23C-201ENST00000225576 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TVP23C-201ENST00000225576 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TVP23C-201ENST00000225576 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.99■■□□□ 1.59
TVP23C-201ENST00000225576 HFM1A2PYH4 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TVP23C-201ENST00000225576 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TVP23C-201ENST00000225576 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.92■■□□□ 1.58
TVP23C-201ENST00000225576 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.92■■□□□ 1.58
TVP23C-201ENST00000225576 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.91■■□□□ 1.58
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