RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222271.6

COMP-201, Transcript of cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COMP, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMP-201ENST00000222271 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
COMP-201ENST00000222271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
COMP-201ENST00000222271 IGF1RP08069 1367 aa22.47■■□□□ 1.19
COMP-201ENST00000222271 IFT140Q96RY7 1462 aa22.45■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 PRXQ9BXM0 1461 aa22.43■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 APLP2Q06481 763 aa22.43■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.42■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.4■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.37■■□□□ 1.17
COMP-201ENST00000222271 MIER1Q8N108 512 aa22.36■■□□□ 1.17
COMP-201ENST00000222271 ARAP1Q96P48 1450 aa22.34■■□□□ 1.17
COMP-201ENST00000222271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COMP-201ENST00000222271 PBRM1Q86U86 1689 aa22.3■■□□□ 1.16
COMP-201ENST00000222271 GRIN2BQ13224 1484 aa22.26■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 FBLN2P98095 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 CUL7Q14999 1698 aa22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.14■■□□□ 1.14
COMP-201ENST00000222271 ADAMTS12P58397 1594 aa22.14■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.14■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 BCL11AQ9H165 835 aa22.11■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.09■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 P3H3Q8IVL6 736 aa22.03■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 SYNJ2O15056 1496 aa22.02■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 GRIN2AQ12879 1464 aa22.01■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.99■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.99■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.96■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CHD1O14646 1710 aa21.91■■□□□ 1.1
COMP-201ENST00000222271 TIAM1Q13009 1591 aa21.91■■□□□ 1.1
COMP-201ENST00000222271 CEP170Q5SW79 1584 aa21.9■■□□□ 1.1
COMP-201ENST00000222271 ITGAEP38570 1179 aa21.89■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 IQGAP2Q13576 1575 aa21.86■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 MAP3K1Q13233 1512 aa21.85■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.84■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.82■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 NUP160Q12769 1436 aa21.81■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.77■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 JPH4Q96JJ6 628 aa21.77■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.76■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.76■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 SAMD9Q5K651 1589 aa21.71■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 MAPKBP1O60336 1514 aa21.71■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.69■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 DISP1Q96F81 1524 aa21.67■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.67■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 ARID3CA6NKF2 412 aa21.65■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 KIAA0556O60303 1618 aa21.64■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.63■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 OSCARQ8IYS5 282 aa21.61■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.61■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 FMN1Q68DA7 1419 aa21.59■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 BCANQ96GW7 911 aa21.59■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.59■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.57■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.57■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.54■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 KCNH8Q96L42 1107 aa21.53■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 SHROOM2Q13796 1616 aa21.51■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.49■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 FKBP8Q14318 412 aa21.47■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 PTPRGP23470 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.45■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.42■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.4■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 HECW1Q76N89 1606 aa21.39■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 PTPRKQ15262 1439 aa21.38■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 NCOA2Q15596 1464 aa21.35■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.34■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.34■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 MSH5O43196 834 aa21.32■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 ABCA8O94911 1581 aa21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 HFM1A2PYH4 1435 aa21.3■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 UACAQ9BZF9 1416 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms