RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 CEP170Q5SW79 1584 aa15.59■□□□□ 0.09
USP11-201ENST00000218348 GRIN2AQ12879 1464 aa15.57■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.57■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.56■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.56■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 NUP160Q12769 1436 aa15.55■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 SHROOM2Q13796 1616 aa15.53■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.53■□□□□ 0.08
USP11-201ENST00000218348 GOLGA3Q08378 1498 aa15.45■□□□□ 0.06
USP11-201ENST00000218348 CEP162Q5TB80 1403 aa15.43■□□□□ 0.06
USP11-201ENST00000218348 SAMD9Q5K651 1589 aa15.42■□□□□ 0.06
USP11-201ENST00000218348 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.4■□□□□ 0.06
USP11-201ENST00000218348 IQGAP2Q13576 1575 aa15.4■□□□□ 0.06
USP11-201ENST00000218348 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
USP11-201ENST00000218348 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-201ENST00000218348 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP11-201ENST00000218348 DISP1Q96F81 1524 aa15.35■□□□□ 0.05
USP11-201ENST00000218348 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.34■□□□□ 0.05
USP11-201ENST00000218348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.33■□□□□ 0.04
USP11-201ENST00000218348 KIAA0556O60303 1618 aa15.31■□□□□ 0.04
USP11-201ENST00000218348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP11-201ENST00000218348 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
USP11-201ENST00000218348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.27■□□□□ 0.04
USP11-201ENST00000218348 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.27■□□□□ 0.04
USP11-201ENST00000218348 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 ARAP1Q96P48 1450 aa15.23■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 APLP2Q06481 763 aa15.23■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 CLIP1P30622 1438 aa15.22■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.22■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.21■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.21■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.21■□□□□ 0.03
USP11-201ENST00000218348 ARHGEF11O15085 1522 aa15.19■□□□□ 0.02
USP11-201ENST00000218348 OSCARQ8IYS5 282 aa15.19■□□□□ 0.02
USP11-201ENST00000218348 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP11-201ENST00000218348 FBLN2P98095 1184 aa15.17■□□□□ 0.02
USP11-201ENST00000218348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP11-201ENST00000218348 ABCA8O94911 1581 aa15.15■□□□□ 0.02
USP11-201ENST00000218348 JPH4Q96JJ6 628 aa15.14■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 P3H3Q8IVL6 736 aa15.14■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.1■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.1■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP11-201ENST00000218348 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.07■□□□□ 0
USP11-201ENST00000218348 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.07■□□□□ 0
USP11-201ENST00000218348 ITGAEP38570 1179 aa15.05■□□□□ 0
USP11-201ENST00000218348 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.04■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 BCL11AQ9H165 835 aa15.04■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.04■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 ABCC2Q92887 1545 aa15.03■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.03■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.02■□□□□ -0
USP11-201ENST00000218348 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.02□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.01□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 HECW1Q76N89 1606 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 FMN1Q68DA7 1419 aa14.99□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.98□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 MAP3K1Q13233 1512 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.97□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 PTPRGP23470 1445 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 UACAQ9BZF9 1416 aa14.96□□□□□ -0.01
USP11-201ENST00000218348 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP11-201ENST00000218348 TIAM1Q13009 1591 aa14.93□□□□□ -0.02
USP11-201ENST00000218348 ATP10BO94823 1461 aa14.92□□□□□ -0.02
USP11-201ENST00000218348 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP11-201ENST00000218348 MAPKBP1O60336 1514 aa14.9□□□□□ -0.02
USP11-201ENST00000218348 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.88□□□□□ -0.03
USP11-201ENST00000218348 ARID3CA6NKF2 412 aa14.85□□□□□ -0.03
USP11-201ENST00000218348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.83□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 KIF14Q15058 1648 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 DIP2BQ9P265 1576 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 GLI2P10070 1586 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.77□□□□□ -0.04
USP11-201ENST00000218348 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 ASXL2Q76L83 1435 aa14.75□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.73□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 PREX2Q70Z35 1606 aa14.72□□□□□ -0.05
USP11-201ENST00000218348 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-201ENST00000218348 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-201ENST00000218348 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.68□□□□□ -0.06
USP11-201ENST00000218348 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms