RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.5■■■□□ 2.47
IFRD1-201ENST00000005558 ARAP1Q96P48 1450 aa30.46■■■□□ 2.47
IFRD1-201ENST00000005558 CEP170Q5SW79 1584 aa30.44■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 CHD1O14646 1710 aa30.4■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 NUP160Q12769 1436 aa30.4■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 IQGAP2Q13576 1575 aa30.37■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 FBLN2P98095 1184 aa30.37■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.37■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 SAMD9Q5K651 1589 aa30.33■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.31■■■□□ 2.44
IFRD1-201ENST00000005558 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.3■■■□□ 2.44
IFRD1-201ENST00000005558 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.27■■■□□ 2.44
IFRD1-201ENST00000005558 P3H3Q8IVL6 736 aa30.23■■■□□ 2.43
IFRD1-201ENST00000005558 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.22■■■□□ 2.43
IFRD1-201ENST00000005558 DISP1Q96F81 1524 aa30.18■■■□□ 2.42
IFRD1-201ENST00000005558 KIAA0556O60303 1618 aa30.1■■■□□ 2.41
IFRD1-201ENST00000005558 JPH4Q96JJ6 628 aa30.1■■■□□ 2.41
IFRD1-201ENST00000005558 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.08■■■□□ 2.41
IFRD1-201ENST00000005558 SHROOM2Q13796 1616 aa30.06■■■□□ 2.4
IFRD1-201ENST00000005558 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
IFRD1-201ENST00000005558 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
IFRD1-201ENST00000005558 FMN1Q68DA7 1419 aa29.99■■■□□ 2.39
IFRD1-201ENST00000005558 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.97■■■□□ 2.39
IFRD1-201ENST00000005558 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
IFRD1-201ENST00000005558 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.92■■■□□ 2.38
IFRD1-201ENST00000005558 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.92■■■□□ 2.38
IFRD1-201ENST00000005558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.91■■■□□ 2.38
IFRD1-201ENST00000005558 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.89■■■□□ 2.37
IFRD1-201ENST00000005558 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
IFRD1-201ENST00000005558 MAP3K1Q13233 1512 aa29.86■■■□□ 2.37
IFRD1-201ENST00000005558 TIAM1Q13009 1591 aa29.85■■■□□ 2.37
IFRD1-201ENST00000005558 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.82■■■□□ 2.36
IFRD1-201ENST00000005558 OSCARQ8IYS5 282 aa29.8■■■□□ 2.36
IFRD1-201ENST00000005558 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
IFRD1-201ENST00000005558 APLP2Q06481 763 aa29.78■■■□□ 2.36
IFRD1-201ENST00000005558 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.75■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.75■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 HECW1Q76N89 1606 aa29.73■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 ABCA8O94911 1581 aa29.73■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.71■■■□□ 2.35
IFRD1-201ENST00000005558 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 PTPRGP23470 1445 aa29.69■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.64■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.64■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.62■■■□□ 2.33
IFRD1-201ENST00000005558 ARID3CA6NKF2 412 aa29.57■■■□□ 2.32
IFRD1-201ENST00000005558 UACAQ9BZF9 1416 aa29.54■■■□□ 2.32
IFRD1-201ENST00000005558 ATP10BO94823 1461 aa29.51■■■□□ 2.32
IFRD1-201ENST00000005558 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.47■■■□□ 2.31
IFRD1-201ENST00000005558 ABCC2Q92887 1545 aa29.47■■■□□ 2.31
IFRD1-201ENST00000005558 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.46■■■□□ 2.31
IFRD1-201ENST00000005558 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.46■■■□□ 2.31
IFRD1-201ENST00000005558 ARHGEF11O15085 1522 aa29.44■■■□□ 2.3
IFRD1-201ENST00000005558 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.43■■■□□ 2.3
IFRD1-201ENST00000005558 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
IFRD1-201ENST00000005558 NCOA2Q15596 1464 aa29.39■■■□□ 2.3
IFRD1-201ENST00000005558 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
IFRD1-201ENST00000005558 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.38■■■□□ 2.29
IFRD1-201ENST00000005558 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
IFRD1-201ENST00000005558 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.33■■■□□ 2.29
IFRD1-201ENST00000005558 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 KIF14Q15058 1648 aa29.29■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.28■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.28■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.28■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.26■■■□□ 2.27
IFRD1-201ENST00000005558 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.23■■■□□ 2.27
IFRD1-201ENST00000005558 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.22■■■□□ 2.27
IFRD1-201ENST00000005558 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.22■■■□□ 2.27
IFRD1-201ENST00000005558 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.19■■■□□ 2.26
IFRD1-201ENST00000005558 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
IFRD1-201ENST00000005558 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
IFRD1-201ENST00000005558 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.1■■■□□ 2.25
IFRD1-201ENST00000005558 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.09■■■□□ 2.25
IFRD1-201ENST00000005558 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
IFRD1-201ENST00000005558 MIA2Q96PC5 1412 aa29.08■■■□□ 2.25
IFRD1-201ENST00000005558 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
IFRD1-201ENST00000005558 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.05■■■□□ 2.24
IFRD1-201ENST00000005558 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.04■■■□□ 2.24
IFRD1-201ENST00000005558 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
IFRD1-201ENST00000005558 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.02■■■□□ 2.24
IFRD1-201ENST00000005558 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.01■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 ASXL2Q76L83 1435 aa29■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 PTPRKQ15262 1439 aa28.99■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.98■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 KCNH8Q96L42 1107 aa28.97■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 ITGAEP38570 1179 aa28.95■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 PREX2Q70Z35 1606 aa28.95■■■□□ 2.22
IFRD1-201ENST00000005558 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
IFRD1-201ENST00000005558 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.9■■■□□ 2.22
IFRD1-201ENST00000005558 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms