RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000199827.1

Gm43170-201, mousemouse

BASIC

Gene Gm43170, Length 612 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Shroom4Q1W617 1475 aa23.79■■□□□ 1.4
Gm43170-201ENSMUST00000199827 AknaQ80VW7 1404 aa23.77■■□□□ 1.4
Gm43170-201ENSMUST00000199827 SynmQ70IV5 1561 aa23.76■■□□□ 1.39
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23.75■■□□□ 1.39
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Abcc1O35379 1528 aa23.74■■□□□ 1.39
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Gpatch8A2A6A1 1505 aa23.73■■□□□ 1.39
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Chd1P40201 1711 aa23.72■■□□□ 1.39
Gm43170-201ENSMUST00000199827 PtprtQ99M80 1454 aa23.71■■□□□ 1.39
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Zeb1Q64318 1117 aa23.63■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 CadpsQ80TJ1 1355 aa23.63■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Abca16E9PWJ7 1678 aa23.6■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arhgap27A2AB59 869 aa23.6■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Abcc2Q8VI47 1543 aa23.59■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 WizO88286 1684 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa23.56■■□□□ 1.36
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Pprc1Q6NZN1 1644 aa23.56■■□□□ 1.36
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Soga1E1U8D0 1418 aa23.54■■□□□ 1.36
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Neo1P97798 1493 aa23.53■■□□□ 1.36
Gm43170-201ENSMUST00000199827 PxdnQ3UQ28 1475 aa23.53■■□□□ 1.36
Gm43170-201ENSMUST00000199827 BC005561E9Q5E2 1589 aa23.52■■□□□ 1.36
Gm43170-201ENSMUST00000199827 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa23.51■■□□□ 1.35
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Map3k4O08648 1597 aa23.49■■□□□ 1.35
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Adamts12Q811B3 1600 aa23.49■■□□□ 1.35
Gm43170-201ENSMUST00000199827 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa23.48■■□□□ 1.35
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Gm14025A2AP89 1413 aa23.44■■□□□ 1.34
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Setbp1Q9Z180 1582 aa23.43■■□□□ 1.34
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Npm2Q80W85 207 aa23.42■■□□□ 1.34
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ak9G3UYQ4 1894 aa23.41■■□□□ 1.34
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Slx4Q6P1D7 1565 aa23.37■■□□□ 1.33
Gm43170-201ENSMUST00000199827 AI481877A2ALV5 1481 aa23.33■■□□□ 1.33
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa23.33■■□□□ 1.33
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Rpap1Q80TE0 1409 aa23.32■■□□□ 1.32
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa23.3■■□□□ 1.32
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Jph4Q80WT0 628 aa23.29■■□□□ 1.32
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Carmil1Q6EDY6 1374 aa23.28■■□□□ 1.32
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa23.26■■□□□ 1.31
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Map3k1P53349 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.22■■□□□ 1.31
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Abca5Q8K448 1642 aa23.18■■□□□ 1.3
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Gab3Q8BSM5 595 aa23.16■■□□□ 1.3
Gm43170-201ENSMUST00000199827 WrnO09053 1401 aa23.13■■□□□ 1.29
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arid3cA6PWV5 409 aa23.1■■□□□ 1.29
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ttc37F8VPK0 1563 aa23.06■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Cux1P53564 1515 aa23.06■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Igf1rQ60751 1373 aa23.04■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa23.04■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 AdgbG3UZ78 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Znf608Q56A10 1511 aa23.02■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Kdm5bQ80Y84 1544 aa23.02■■□□□ 1.28
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Clip1Q922J3 1391 aa23.01■■□□□ 1.27
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa23.01■■□□□ 1.27
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Depdc5P61460 1591 aa22.99■■□□□ 1.27
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.95■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Cul7Q8VE73 1689 aa22.94■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Fyco1Q8VDC1 1437 aa22.92■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Myt1lP97500 1187 aa22.91■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Zfyve16Q80U44 1528 aa22.91■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Wdr7Q920I9 1489 aa22.91■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa22.91■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 NhsB1AV60 1647 aa22.9■■□□□ 1.26
Gm43170-201ENSMUST00000199827 HrcG5E8J6 738 aa22.88■■□□□ 1.25
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.87■■□□□ 1.25
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Fndc1E9Q043 1732 aa22.84■■□□□ 1.25
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arhgef11Q68FM7 1552 aa22.84■■□□□ 1.25
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa22.83■■□□□ 1.25
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Atp10dQ8K2X1 1416 aa22.81■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Mroh2aD3Z750 1679 aa22.79■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Gcc2Q8CHG3 1679 aa22.79■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.79■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Dnajc5gQ8C632 165 aa22.78■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ankrd26Q811D2 1581 aa22.77■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Alpk3Q924C5 1678 aa22.77■■□□□ 1.24
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Aebp1Q640N1 1128 aa22.72■■□□□ 1.23
Gm43170-201ENSMUST00000199827 AglF8VPN4 1532 aa22.72■■□□□ 1.23
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa22.71■■□□□ 1.23
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa22.67■■□□□ 1.22
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Abca8bQ8K440 1620 aa22.66■■□□□ 1.22
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ncoa2Q61026 1462 aa22.65■■□□□ 1.22
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Fancd2Q80V62 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
Gm43170-201ENSMUST00000199827 BlmO88700 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.64■■□□□ 1.22
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Arap1Q4LDD4 1452 aa22.59■■□□□ 1.21
Gm43170-201ENSMUST00000199827 A2mQ6GQT1 1474 aa22.58■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Magi1Q6RHR9 1471 aa22.58■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Prex2Q3LAC4 1598 aa22.55■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Rnf17Q99MV7 1640 aa22.55■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Setd5Q5XJV7 1441 aa22.55■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.54■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 Erich3F6QRE9 1637 aa22.53■■□□□ 1.2
Gm43170-201ENSMUST00000199827 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.3 ms