Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.03■■■■■ 7.84
PtprtQ99M80 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.9■■■■■ 7.18
PtprtQ99M80 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.71■■■■■ 6.99
PtprtQ99M80 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.22■■■■■ 6.59
PtprtQ99M80 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.68■■■■■ 6.34
PtprtQ99M80 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.27
PtprtQ99M80 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
PtprtQ99M80 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.23
PtprtQ99M80 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.45■■■■■ 6.15
PtprtQ99M80 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
PtprtQ99M80 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.23■■■■■ 6.11
PtprtQ99M80 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.88■■■■■ 6.06
PtprtQ99M80 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
PtprtQ99M80 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
PtprtQ99M80 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.42■■■■■ 5.98
PtprtQ99M80 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.2■■■■■ 5.95
PtprtQ99M80 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
PtprtQ99M80 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
PtprtQ99M80 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
PtprtQ99M80 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
PtprtQ99M80 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
PtprtQ99M80 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.6■■■■■ 5.69
PtprtQ99M80 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.97■■■■■ 5.59
PtprtQ99M80 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
PtprtQ99M80 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
PtprtQ99M80 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.43■■■■■ 5.5
PtprtQ99M80 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.14■■■■■ 5.46
PtprtQ99M80 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
PtprtQ99M80 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
PtprtQ99M80 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.97■■■■■ 5.43
PtprtQ99M80 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
PtprtQ99M80 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
PtprtQ99M80 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.77■■■■■ 5.4
PtprtQ99M80 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
PtprtQ99M80 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.63■■■■■ 5.37
PtprtQ99M80 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
PtprtQ99M80 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
PtprtQ99M80 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
PtprtQ99M80 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
PtprtQ99M80 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
PtprtQ99M80 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.26■■■■■ 5.32
PtprtQ99M80 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
PtprtQ99M80 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PtprtQ99M80 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
PtprtQ99M80 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.98■■■■■ 5.27
PtprtQ99M80 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
PtprtQ99M80 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
PtprtQ99M80 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
PtprtQ99M80 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
PtprtQ99M80 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
PtprtQ99M80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
PtprtQ99M80 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
PtprtQ99M80 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
PtprtQ99M80 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
PtprtQ99M80 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
PtprtQ99M80 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
PtprtQ99M80 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.15■■■■■ 5.14
PtprtQ99M80 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
PtprtQ99M80 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
PtprtQ99M80 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.88■■■■■ 5.09
PtprtQ99M80 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
PtprtQ99M80 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
PtprtQ99M80 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
PtprtQ99M80 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
PtprtQ99M80 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
PtprtQ99M80 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
PtprtQ99M80 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
PtprtQ99M80 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
PtprtQ99M80 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
PtprtQ99M80 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
PtprtQ99M80 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
PtprtQ99M80 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
PtprtQ99M80 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
PtprtQ99M80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
PtprtQ99M80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
PtprtQ99M80 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
PtprtQ99M80 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
PtprtQ99M80 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
PtprtQ99M80 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
PtprtQ99M80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
PtprtQ99M80 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
PtprtQ99M80 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
PtprtQ99M80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
PtprtQ99M80 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
PtprtQ99M80 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
PtprtQ99M80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
PtprtQ99M80 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
PtprtQ99M80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
PtprtQ99M80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
PtprtQ99M80 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
PtprtQ99M80 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
PtprtQ99M80 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
PtprtQ99M80 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
PtprtQ99M80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
PtprtQ99M80 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PtprtQ99M80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
PtprtQ99M80 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
PtprtQ99M80 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
PtprtQ99M80 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
PtprtQ99M80 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.82
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