Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN4

Agl, Amylo-1,6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 1,532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AglF8VPN4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.46■■■■■ 7.43
AglF8VPN4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57.33■■■■■ 6.77
AglF8VPN4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.17■■■■■ 6.58
AglF8VPN4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.83■■■■■ 6.21
AglF8VPN4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.91■■■■■ 6.06
AglF8VPN4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.92
AglF8VPN4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
AglF8VPN4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
AglF8VPN4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
AglF8VPN4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
AglF8VPN4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
AglF8VPN4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
AglF8VPN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
AglF8VPN4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.9■■■■■ 5.58
AglF8VPN4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.84■■■■■ 5.57
AglF8VPN4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
AglF8VPN4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
AglF8VPN4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
AglF8VPN4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
AglF8VPN4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
AglF8VPN4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.82■■■■■ 5.41
AglF8VPN4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
AglF8VPN4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
AglF8VPN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
AglF8VPN4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
AglF8VPN4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
AglF8VPN4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
AglF8VPN4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
AglF8VPN4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
AglF8VPN4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
AglF8VPN4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
AglF8VPN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
AglF8VPN4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
AglF8VPN4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
AglF8VPN4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
AglF8VPN4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
AglF8VPN4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
AglF8VPN4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
AglF8VPN4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
AglF8VPN4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
AglF8VPN4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
AglF8VPN4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.27■■■■■ 5
AglF8VPN4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
AglF8VPN4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
AglF8VPN4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.19■■■■■ 4.98
AglF8VPN4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
AglF8VPN4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
AglF8VPN4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
AglF8VPN4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46■■■■■ 4.95
AglF8VPN4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
AglF8VPN4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
AglF8VPN4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
AglF8VPN4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
AglF8VPN4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
AglF8VPN4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
AglF8VPN4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
AglF8VPN4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
AglF8VPN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
AglF8VPN4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
AglF8VPN4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.14■■■■■ 4.82
AglF8VPN4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
AglF8VPN4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
AglF8VPN4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
AglF8VPN4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
AglF8VPN4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
AglF8VPN4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
AglF8VPN4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
AglF8VPN4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
AglF8VPN4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
AglF8VPN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
AglF8VPN4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
AglF8VPN4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
AglF8VPN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
AglF8VPN4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
AglF8VPN4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
AglF8VPN4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
AglF8VPN4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
AglF8VPN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
AglF8VPN4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
AglF8VPN4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
AglF8VPN4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
AglF8VPN4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
AglF8VPN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
AglF8VPN4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
AglF8VPN4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
AglF8VPN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
AglF8VPN4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
AglF8VPN4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
AglF8VPN4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
AglF8VPN4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
AglF8VPN4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
AglF8VPN4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
AglF8VPN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
AglF8VPN4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms