Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60.95■■■■■ 7.35
Prex2Q3LAC4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.71■■■■■ 6.67
Prex2Q3LAC4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.49■■■■■ 6.47
Prex2Q3LAC4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.22■■■■■ 6.11
Prex2Q3LAC4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.83■■■■■ 6.05
Prex2Q3LAC4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
Prex2Q3LAC4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
Prex2Q3LAC4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
Prex2Q3LAC4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
Prex2Q3LAC4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
Prex2Q3LAC4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.73■■■■■ 5.71
Prex2Q3LAC4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
Prex2Q3LAC4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
Prex2Q3LAC4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.28■■■■■ 5.48
Prex2Q3LAC4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
Prex2Q3LAC4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
Prex2Q3LAC4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
Prex2Q3LAC4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
Prex2Q3LAC4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.59■■■■■ 5.37
Prex2Q3LAC4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Prex2Q3LAC4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
Prex2Q3LAC4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Prex2Q3LAC4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.26■■■■■ 5.32
Prex2Q3LAC4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Prex2Q3LAC4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
Prex2Q3LAC4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
Prex2Q3LAC4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Prex2Q3LAC4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.69■■■■■ 5.23
Prex2Q3LAC4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Prex2Q3LAC4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
Prex2Q3LAC4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
Prex2Q3LAC4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Prex2Q3LAC4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Prex2Q3LAC4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Prex2Q3LAC4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
Prex2Q3LAC4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
Prex2Q3LAC4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.72■■■■■ 5.07
Prex2Q3LAC4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Prex2Q3LAC4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Prex2Q3LAC4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Prex2Q3LAC4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46.26■■■■■ 5
Prex2Q3LAC4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.16■■■■■ 4.98
Prex2Q3LAC4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Prex2Q3LAC4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Prex2Q3LAC4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
Prex2Q3LAC4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Prex2Q3LAC4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Prex2Q3LAC4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Prex2Q3LAC4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
Prex2Q3LAC4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
Prex2Q3LAC4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Prex2Q3LAC4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
Prex2Q3LAC4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Prex2Q3LAC4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
Prex2Q3LAC4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
Prex2Q3LAC4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Prex2Q3LAC4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Prex2Q3LAC4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Prex2Q3LAC4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
Prex2Q3LAC4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Prex2Q3LAC4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Prex2Q3LAC4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Prex2Q3LAC4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Prex2Q3LAC4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Prex2Q3LAC4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Prex2Q3LAC4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Prex2Q3LAC4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Prex2Q3LAC4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Prex2Q3LAC4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Prex2Q3LAC4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Prex2Q3LAC4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Prex2Q3LAC4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Prex2Q3LAC4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Prex2Q3LAC4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Prex2Q3LAC4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Prex2Q3LAC4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Prex2Q3LAC4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Prex2Q3LAC4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Prex2Q3LAC4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Prex2Q3LAC4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Prex2Q3LAC4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
Prex2Q3LAC4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Prex2Q3LAC4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Prex2Q3LAC4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Prex2Q3LAC4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Prex2Q3LAC4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Prex2Q3LAC4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Prex2Q3LAC4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Prex2Q3LAC4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Prex2Q3LAC4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Prex2Q3LAC4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Prex2Q3LAC4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Prex2Q3LAC4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.78■■■■■ 4.6
Prex2Q3LAC4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Prex2Q3LAC4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Prex2Q3LAC4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Prex2Q3LAC4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Prex2Q3LAC4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Prex2Q3LAC4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Prex2Q3LAC4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms