Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.83■■■■■ 7.49
Ccdc141E9Q8Q6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57.5■■■■■ 6.79
Ccdc141E9Q8Q6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.37■■■■■ 6.61
Ccdc141E9Q8Q6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.95■■■■■ 6.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53.58■■■■■ 6.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.44■■■■■ 5.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
Ccdc141E9Q8Q6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
Ccdc141E9Q8Q6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.52■■■■■ 5.84
Ccdc141E9Q8Q6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
Ccdc141E9Q8Q6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
Ccdc141E9Q8Q6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
Ccdc141E9Q8Q6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Ccdc141E9Q8Q6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Ccdc141E9Q8Q6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Ccdc141E9Q8Q6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
Ccdc141E9Q8Q6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
Ccdc141E9Q8Q6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.94■■■■■ 5.43
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Ccdc141E9Q8Q6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
Ccdc141E9Q8Q6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Ccdc141E9Q8Q6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
Ccdc141E9Q8Q6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
Ccdc141E9Q8Q6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
Ccdc141E9Q8Q6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
Ccdc141E9Q8Q6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Ccdc141E9Q8Q6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
Ccdc141E9Q8Q6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.41■■■■■ 5.18
Ccdc141E9Q8Q6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
Ccdc141E9Q8Q6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Ccdc141E9Q8Q6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
Ccdc141E9Q8Q6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Ccdc141E9Q8Q6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Ccdc141E9Q8Q6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Ccdc141E9Q8Q6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Ccdc141E9Q8Q6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.3■■■■■ 5
Ccdc141E9Q8Q6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 5
Ccdc141E9Q8Q6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
Ccdc141E9Q8Q6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
Ccdc141E9Q8Q6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
Ccdc141E9Q8Q6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Ccdc141E9Q8Q6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Ccdc141E9Q8Q6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Ccdc141E9Q8Q6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Ccdc141E9Q8Q6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Ccdc141E9Q8Q6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
Ccdc141E9Q8Q6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Ccdc141E9Q8Q6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Ccdc141E9Q8Q6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Ccdc141E9Q8Q6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Ccdc141E9Q8Q6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Ccdc141E9Q8Q6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Ccdc141E9Q8Q6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Ccdc141E9Q8Q6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Ccdc141E9Q8Q6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Ccdc141E9Q8Q6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Ccdc141E9Q8Q6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Ccdc141E9Q8Q6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Ccdc141E9Q8Q6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Ccdc141E9Q8Q6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
Ccdc141E9Q8Q6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Ccdc141E9Q8Q6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Ccdc141E9Q8Q6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Ccdc141E9Q8Q6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Ccdc141E9Q8Q6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Ccdc141E9Q8Q6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Ccdc141E9Q8Q6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Ccdc141E9Q8Q6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Ccdc141E9Q8Q6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Ccdc141E9Q8Q6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Ccdc141E9Q8Q6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ccdc141E9Q8Q6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Ccdc141E9Q8Q6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Ccdc141E9Q8Q6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Ccdc141E9Q8Q6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
Ccdc141E9Q8Q6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Ccdc141E9Q8Q6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms