Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.32■■■■■ 7.89
Gpatch8A2A6A1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.86■■■■■ 7.17
Gpatch8A2A6A1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.52■■■■■ 6.96
Gpatch8A2A6A1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.33■■■■■ 6.61
Gpatch8A2A6A1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55.76■■■■■ 6.52
Gpatch8A2A6A1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC54.71■■■■■ 6.35
Gpatch8A2A6A1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
Gpatch8A2A6A1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.97■■■■■ 6.23
Gpatch8A2A6A1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
Gpatch8A2A6A1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
Gpatch8A2A6A1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.57■■■■■ 6.17
Gpatch8A2A6A1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.34■■■■■ 5.97
Gpatch8A2A6A1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.95■■■■■ 5.91
Gpatch8A2A6A1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
Gpatch8A2A6A1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.81■■■■■ 5.88
Gpatch8A2A6A1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.81■■■■■ 5.88
Gpatch8A2A6A1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
Gpatch8A2A6A1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
Gpatch8A2A6A1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC51.21■■■■■ 5.79
Gpatch8A2A6A1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
Gpatch8A2A6A1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
Gpatch8A2A6A1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Gpatch8A2A6A1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.91■■■■■ 5.74
Gpatch8A2A6A1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.89■■■■■ 5.74
Gpatch8A2A6A1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
Gpatch8A2A6A1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
Gpatch8A2A6A1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
Gpatch8A2A6A1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.89■■■■■ 5.58
Gpatch8A2A6A1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.81■■■■■ 5.56
Gpatch8A2A6A1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
Gpatch8A2A6A1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
Gpatch8A2A6A1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
Gpatch8A2A6A1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
Gpatch8A2A6A1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
Gpatch8A2A6A1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
Gpatch8A2A6A1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC49.38■■■■■ 5.5
Gpatch8A2A6A1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.34■■■■■ 5.49
Gpatch8A2A6A1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Gpatch8A2A6A1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
Gpatch8A2A6A1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
Gpatch8A2A6A1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.7■■■■■ 5.39
Gpatch8A2A6A1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
Gpatch8A2A6A1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
Gpatch8A2A6A1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Gpatch8A2A6A1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Gpatch8A2A6A1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
Gpatch8A2A6A1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
Gpatch8A2A6A1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC48.21■■■■■ 5.31
Gpatch8A2A6A1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
Gpatch8A2A6A1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
Gpatch8A2A6A1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
Gpatch8A2A6A1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
Gpatch8A2A6A1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
Gpatch8A2A6A1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Gpatch8A2A6A1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Gpatch8A2A6A1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Gpatch8A2A6A1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Gpatch8A2A6A1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
Gpatch8A2A6A1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
Gpatch8A2A6A1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
Gpatch8A2A6A1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Gpatch8A2A6A1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Gpatch8A2A6A1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
Gpatch8A2A6A1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Gpatch8A2A6A1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Gpatch8A2A6A1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Gpatch8A2A6A1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Gpatch8A2A6A1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
Gpatch8A2A6A1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Gpatch8A2A6A1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Gpatch8A2A6A1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Gpatch8A2A6A1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Gpatch8A2A6A1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Gpatch8A2A6A1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
Gpatch8A2A6A1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Gpatch8A2A6A1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Gpatch8A2A6A1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Gpatch8A2A6A1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Gpatch8A2A6A1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
Gpatch8A2A6A1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Gpatch8A2A6A1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Gpatch8A2A6A1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Gpatch8A2A6A1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Gpatch8A2A6A1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
Gpatch8A2A6A1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Gpatch8A2A6A1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
Gpatch8A2A6A1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Gpatch8A2A6A1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Gpatch8A2A6A1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Gpatch8A2A6A1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Gpatch8A2A6A1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
Gpatch8A2A6A1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Gpatch8A2A6A1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
Gpatch8A2A6A1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
Gpatch8A2A6A1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Gpatch8A2A6A1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Gpatch8A2A6A1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
Gpatch8A2A6A1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Gpatch8A2A6A1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Gpatch8A2A6A1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms