Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62.29■■■■■ 7.56
Lrrc9Q8CDN9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58.09■■■■■ 6.89
Lrrc9Q8CDN9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.88■■■■■ 6.7
Lrrc9Q8CDN9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.55■■■■■ 6.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53.61■■■■■ 6.17
Lrrc9Q8CDN9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.68■■■■■ 6.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.45■■■■■ 5.99
Lrrc9Q8CDN9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
Lrrc9Q8CDN9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
Lrrc9Q8CDN9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
Lrrc9Q8CDN9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.81■■■■■ 5.88
Lrrc9Q8CDN9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51.04■■■■■ 5.76
Lrrc9Q8CDN9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.55■■■■■ 5.68
Lrrc9Q8CDN9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
Lrrc9Q8CDN9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
Lrrc9Q8CDN9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Lrrc9Q8CDN9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
Lrrc9Q8CDN9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.46■■■■■ 5.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
Lrrc9Q8CDN9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Lrrc9Q8CDN9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
Lrrc9Q8CDN9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
Lrrc9Q8CDN9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
Lrrc9Q8CDN9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Lrrc9Q8CDN9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Lrrc9Q8CDN9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Lrrc9Q8CDN9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Lrrc9Q8CDN9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.71■■■■■ 5.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
Lrrc9Q8CDN9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
Lrrc9Q8CDN9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
Lrrc9Q8CDN9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
Lrrc9Q8CDN9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Lrrc9Q8CDN9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
Lrrc9Q8CDN9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Lrrc9Q8CDN9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Lrrc9Q8CDN9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
Lrrc9Q8CDN9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
Lrrc9Q8CDN9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Lrrc9Q8CDN9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Lrrc9Q8CDN9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
Lrrc9Q8CDN9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
Lrrc9Q8CDN9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
Lrrc9Q8CDN9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Lrrc9Q8CDN9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
Lrrc9Q8CDN9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Lrrc9Q8CDN9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Lrrc9Q8CDN9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Lrrc9Q8CDN9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Lrrc9Q8CDN9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Lrrc9Q8CDN9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Lrrc9Q8CDN9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Lrrc9Q8CDN9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Lrrc9Q8CDN9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Lrrc9Q8CDN9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Lrrc9Q8CDN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Lrrc9Q8CDN9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Lrrc9Q8CDN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Lrrc9Q8CDN9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Lrrc9Q8CDN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Lrrc9Q8CDN9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Lrrc9Q8CDN9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
Lrrc9Q8CDN9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Lrrc9Q8CDN9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Lrrc9Q8CDN9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Lrrc9Q8CDN9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Lrrc9Q8CDN9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
Lrrc9Q8CDN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Lrrc9Q8CDN9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
Lrrc9Q8CDN9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Lrrc9Q8CDN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Lrrc9Q8CDN9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Lrrc9Q8CDN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Lrrc9Q8CDN9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Lrrc9Q8CDN9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Lrrc9Q8CDN9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Lrrc9Q8CDN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Lrrc9Q8CDN9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Lrrc9Q8CDN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Lrrc9Q8CDN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Lrrc9Q8CDN9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Lrrc9Q8CDN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
Lrrc9Q8CDN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Lrrc9Q8CDN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms