Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60.85■■■■■ 7.33
Ap3b1Q9Z1T1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.39■■■■■ 6.62
Ap3b1Q9Z1T1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.96■■■■■ 6.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.82■■■■■ 6.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51.83■■■■■ 5.89
Ap3b1Q9Z1T1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
Ap3b1Q9Z1T1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.68■■■■■ 5.7
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.94■■■■■ 5.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Ap3b1Q9Z1T1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
Ap3b1Q9Z1T1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
Ap3b1Q9Z1T1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.88■■■■■ 5.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
Ap3b1Q9Z1T1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.14■■■■■ 5.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Ap3b1Q9Z1T1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Ap3b1Q9Z1T1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
Ap3b1Q9Z1T1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Ap3b1Q9Z1T1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
Ap3b1Q9Z1T1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Ap3b1Q9Z1T1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Ap3b1Q9Z1T1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Ap3b1Q9Z1T1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.38■■■■■ 5.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Ap3b1Q9Z1T1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Ap3b1Q9Z1T1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Ap3b1Q9Z1T1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Ap3b1Q9Z1T1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
Ap3b1Q9Z1T1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Ap3b1Q9Z1T1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Ap3b1Q9Z1T1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Ap3b1Q9Z1T1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Ap3b1Q9Z1T1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Ap3b1Q9Z1T1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Ap3b1Q9Z1T1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Ap3b1Q9Z1T1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Ap3b1Q9Z1T1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
Ap3b1Q9Z1T1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Ap3b1Q9Z1T1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Ap3b1Q9Z1T1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Ap3b1Q9Z1T1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Ap3b1Q9Z1T1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Ap3b1Q9Z1T1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ap3b1Q9Z1T1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Ap3b1Q9Z1T1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Ap3b1Q9Z1T1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Ap3b1Q9Z1T1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Ap3b1Q9Z1T1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
Ap3b1Q9Z1T1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms