Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63.32■■■■■ 7.73
Setbp1Q9Z180 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.17■■■■■ 7.06
Setbp1Q9Z180 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.91■■■■■ 6.86
Setbp1Q9Z180 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC55.58■■■■■ 6.49
Setbp1Q9Z180 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.25■■■■■ 6.28
Setbp1Q9Z180 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
Setbp1Q9Z180 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
Setbp1Q9Z180 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.29■■■■■ 6.12
Setbp1Q9Z180 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.06■■■■■ 6.08
Setbp1Q9Z180 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
Setbp1Q9Z180 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.65■■■■■ 6.02
Setbp1Q9Z180 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.08■■■■■ 5.93
Setbp1Q9Z180 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
Setbp1Q9Z180 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.6■■■■■ 5.85
Setbp1Q9Z180 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.5■■■■■ 5.84
Setbp1Q9Z180 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
Setbp1Q9Z180 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
Setbp1Q9Z180 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Setbp1Q9Z180 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
Setbp1Q9Z180 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.34■■■■■ 5.65
Setbp1Q9Z180 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
Setbp1Q9Z180 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.11■■■■■ 5.61
Setbp1Q9Z180 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
Setbp1Q9Z180 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
Setbp1Q9Z180 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Setbp1Q9Z180 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.1■■■■■ 5.45
Setbp1Q9Z180 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.64■■■■■ 5.38
Setbp1Q9Z180 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
Setbp1Q9Z180 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
Setbp1Q9Z180 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.33■■■■■ 5.33
Setbp1Q9Z180 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
Setbp1Q9Z180 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
Setbp1Q9Z180 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Setbp1Q9Z180 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
Setbp1Q9Z180 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Setbp1Q9Z180 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Setbp1Q9Z180 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
Setbp1Q9Z180 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Setbp1Q9Z180 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Setbp1Q9Z180 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
Setbp1Q9Z180 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Setbp1Q9Z180 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Setbp1Q9Z180 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Setbp1Q9Z180 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
Setbp1Q9Z180 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
Setbp1Q9Z180 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Setbp1Q9Z180 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
Setbp1Q9Z180 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Setbp1Q9Z180 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Setbp1Q9Z180 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
Setbp1Q9Z180 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
Setbp1Q9Z180 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
Setbp1Q9Z180 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Setbp1Q9Z180 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Setbp1Q9Z180 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Setbp1Q9Z180 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
Setbp1Q9Z180 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Setbp1Q9Z180 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Setbp1Q9Z180 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
Setbp1Q9Z180 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.41■■■■■ 5.02
Setbp1Q9Z180 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Setbp1Q9Z180 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Setbp1Q9Z180 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Setbp1Q9Z180 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Setbp1Q9Z180 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Setbp1Q9Z180 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Setbp1Q9Z180 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46■■■■■ 4.95
Setbp1Q9Z180 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Setbp1Q9Z180 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Setbp1Q9Z180 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Setbp1Q9Z180 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Setbp1Q9Z180 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Setbp1Q9Z180 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Setbp1Q9Z180 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Setbp1Q9Z180 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Setbp1Q9Z180 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Setbp1Q9Z180 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Setbp1Q9Z180 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
Setbp1Q9Z180 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Setbp1Q9Z180 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Setbp1Q9Z180 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Setbp1Q9Z180 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Setbp1Q9Z180 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Setbp1Q9Z180 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
Setbp1Q9Z180 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Setbp1Q9Z180 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Setbp1Q9Z180 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Setbp1Q9Z180 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Setbp1Q9Z180 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Setbp1Q9Z180 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Setbp1Q9Z180 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
Setbp1Q9Z180 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Setbp1Q9Z180 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Setbp1Q9Z180 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Setbp1Q9Z180 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Setbp1Q9Z180 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Setbp1Q9Z180 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Setbp1Q9Z180 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Setbp1Q9Z180 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Setbp1Q9Z180 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms