Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.41■■■■■ 7.42
Alpk3Q924C5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57.59■■■■■ 6.81
Alpk3Q924C5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
Alpk3Q924C5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.04■■■■■ 6.24
Alpk3Q924C5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.29■■■■■ 5.96
Alpk3Q924C5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
Alpk3Q924C5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
Alpk3Q924C5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
Alpk3Q924C5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
Alpk3Q924C5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51.08■■■■■ 5.77
Alpk3Q924C5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51■■■■■ 5.75
Alpk3Q924C5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.84■■■■■ 5.73
Alpk3Q924C5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
Alpk3Q924C5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
Alpk3Q924C5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.37■■■■■ 5.65
Alpk3Q924C5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.13■■■■■ 5.62
Alpk3Q924C5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Alpk3Q924C5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
Alpk3Q924C5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.92■■■■■ 5.42
Alpk3Q924C5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Alpk3Q924C5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
Alpk3Q924C5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.31■■■■■ 5.32
Alpk3Q924C5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
Alpk3Q924C5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
Alpk3Q924C5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Alpk3Q924C5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
Alpk3Q924C5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Alpk3Q924C5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Alpk3Q924C5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
Alpk3Q924C5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
Alpk3Q924C5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.88■■■■■ 5.1
Alpk3Q924C5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
Alpk3Q924C5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
Alpk3Q924C5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
Alpk3Q924C5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Alpk3Q924C5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Alpk3Q924C5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Alpk3Q924C5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Alpk3Q924C5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Alpk3Q924C5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Alpk3Q924C5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Alpk3Q924C5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Alpk3Q924C5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Alpk3Q924C5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.63■■■■■ 4.89
Alpk3Q924C5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.89
Alpk3Q924C5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Alpk3Q924C5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Alpk3Q924C5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Alpk3Q924C5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Alpk3Q924C5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Alpk3Q924C5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Alpk3Q924C5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Alpk3Q924C5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
Alpk3Q924C5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
Alpk3Q924C5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Alpk3Q924C5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Alpk3Q924C5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Alpk3Q924C5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Alpk3Q924C5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Alpk3Q924C5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Alpk3Q924C5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Alpk3Q924C5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Alpk3Q924C5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
Alpk3Q924C5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
Alpk3Q924C5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Alpk3Q924C5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
Alpk3Q924C5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Alpk3Q924C5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Alpk3Q924C5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Alpk3Q924C5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Alpk3Q924C5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Alpk3Q924C5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Alpk3Q924C5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Alpk3Q924C5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Alpk3Q924C5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Alpk3Q924C5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Alpk3Q924C5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Alpk3Q924C5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Alpk3Q924C5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Alpk3Q924C5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Alpk3Q924C5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Alpk3Q924C5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Alpk3Q924C5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Alpk3Q924C5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Alpk3Q924C5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Alpk3Q924C5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Alpk3Q924C5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Alpk3Q924C5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Alpk3Q924C5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Alpk3Q924C5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Alpk3Q924C5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
Alpk3Q924C5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Alpk3Q924C5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Alpk3Q924C5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Alpk3Q924C5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Alpk3Q924C5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Alpk3Q924C5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Alpk3Q924C5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
Alpk3Q924C5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Alpk3Q924C5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms