Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.84■■■■■ 7.49
Cul7Q8VE73 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57.72■■■■■ 6.83
Cul7Q8VE73 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
Cul7Q8VE73 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.19■■■■■ 6.27
Cul7Q8VE73 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53.46■■■■■ 6.15
Cul7Q8VE73 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.5■■■■■ 5.99
Cul7Q8VE73 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
Cul7Q8VE73 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
Cul7Q8VE73 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
Cul7Q8VE73 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.81■■■■■ 5.88
Cul7Q8VE73 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.43■■■■■ 5.82
Cul7Q8VE73 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
Cul7Q8VE73 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.08■■■■■ 5.61
Cul7Q8VE73 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
Cul7Q8VE73 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
Cul7Q8VE73 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
Cul7Q8VE73 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
Cul7Q8VE73 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Cul7Q8VE73 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
Cul7Q8VE73 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Cul7Q8VE73 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.06■■■■■ 5.44
Cul7Q8VE73 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
Cul7Q8VE73 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.94■■■■■ 5.42
Cul7Q8VE73 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Cul7Q8VE73 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Cul7Q8VE73 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
Cul7Q8VE73 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Cul7Q8VE73 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Cul7Q8VE73 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
Cul7Q8VE73 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Cul7Q8VE73 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Cul7Q8VE73 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Cul7Q8VE73 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
Cul7Q8VE73 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
Cul7Q8VE73 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Cul7Q8VE73 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
Cul7Q8VE73 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
Cul7Q8VE73 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
Cul7Q8VE73 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47■■■■■ 5.11
Cul7Q8VE73 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Cul7Q8VE73 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
Cul7Q8VE73 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
Cul7Q8VE73 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Cul7Q8VE73 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
Cul7Q8VE73 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Cul7Q8VE73 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
Cul7Q8VE73 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Cul7Q8VE73 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
Cul7Q8VE73 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Cul7Q8VE73 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.16■■■■■ 4.98
Cul7Q8VE73 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
Cul7Q8VE73 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Cul7Q8VE73 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Cul7Q8VE73 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
Cul7Q8VE73 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Cul7Q8VE73 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
Cul7Q8VE73 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Cul7Q8VE73 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Cul7Q8VE73 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Cul7Q8VE73 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Cul7Q8VE73 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Cul7Q8VE73 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Cul7Q8VE73 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Cul7Q8VE73 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Cul7Q8VE73 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Cul7Q8VE73 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Cul7Q8VE73 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Cul7Q8VE73 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Cul7Q8VE73 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Cul7Q8VE73 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Cul7Q8VE73 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Cul7Q8VE73 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Cul7Q8VE73 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Cul7Q8VE73 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
Cul7Q8VE73 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Cul7Q8VE73 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Cul7Q8VE73 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Cul7Q8VE73 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Cul7Q8VE73 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Cul7Q8VE73 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Cul7Q8VE73 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Cul7Q8VE73 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Cul7Q8VE73 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Cul7Q8VE73 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Cul7Q8VE73 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Cul7Q8VE73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Cul7Q8VE73 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Cul7Q8VE73 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Cul7Q8VE73 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Cul7Q8VE73 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Cul7Q8VE73 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Cul7Q8VE73 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Cul7Q8VE73 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Cul7Q8VE73 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Cul7Q8VE73 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Cul7Q8VE73 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Cul7Q8VE73 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Cul7Q8VE73 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Cul7Q8VE73 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Cul7Q8VE73 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms