Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63.36■■■■■ 7.73
Npm2Q80W85 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58.7■■■■■ 6.99
Npm2Q80W85 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.83■■■■■ 6.85
Npm2Q80W85 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55.19■■■■■ 6.43
Npm2Q80W85 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.97■■■■■ 6.39
Npm2Q80W85 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.92■■■■■ 6.22
Npm2Q80W85 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
Npm2Q80W85 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.48■■■■■ 6.15
Npm2Q80W85 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
Npm2Q80W85 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.11
Npm2Q80W85 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.88■■■■■ 6.06
Npm2Q80W85 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
Npm2Q80W85 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
Npm2Q80W85 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.66■■■■■ 5.86
Npm2Q80W85 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
Npm2Q80W85 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51.38■■■■■ 5.82
Npm2Q80W85 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.01■■■■■ 5.76
Npm2Q80W85 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.97■■■■■ 5.75
Npm2Q80W85 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.84■■■■■ 5.73
Npm2Q80W85 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.72
Npm2Q80W85 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
Npm2Q80W85 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
Npm2Q80W85 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC50.61■■■■■ 5.69
Npm2Q80W85 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
Npm2Q80W85 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
Npm2Q80W85 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
Npm2Q80W85 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
Npm2Q80W85 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.07■■■■■ 5.61
Npm2Q80W85 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Npm2Q80W85 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.04■■■■■ 5.6
Npm2Q80W85 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
Npm2Q80W85 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
Npm2Q80W85 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC49.57■■■■■ 5.53
Npm2Q80W85 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
Npm2Q80W85 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Npm2Q80W85 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Npm2Q80W85 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
Npm2Q80W85 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC48.95■■■■■ 5.43
Npm2Q80W85 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
Npm2Q80W85 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Npm2Q80W85 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.71■■■■■ 5.39
Npm2Q80W85 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
Npm2Q80W85 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.43■■■■■ 5.34
Npm2Q80W85 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48.41■■■■■ 5.34
Npm2Q80W85 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
Npm2Q80W85 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
Npm2Q80W85 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Npm2Q80W85 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
Npm2Q80W85 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
Npm2Q80W85 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Npm2Q80W85 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Npm2Q80W85 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Npm2Q80W85 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
Npm2Q80W85 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Npm2Q80W85 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
Npm2Q80W85 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
Npm2Q80W85 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
Npm2Q80W85 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Npm2Q80W85 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Npm2Q80W85 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
Npm2Q80W85 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Npm2Q80W85 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
Npm2Q80W85 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Npm2Q80W85 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Npm2Q80W85 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Npm2Q80W85 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Npm2Q80W85 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Npm2Q80W85 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Npm2Q80W85 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
Npm2Q80W85 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
Npm2Q80W85 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Npm2Q80W85 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Npm2Q80W85 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Npm2Q80W85 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Npm2Q80W85 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Npm2Q80W85 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
Npm2Q80W85 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Npm2Q80W85 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Npm2Q80W85 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Npm2Q80W85 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.57■■■■■ 5.05
Npm2Q80W85 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
Npm2Q80W85 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Npm2Q80W85 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Npm2Q80W85 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
Npm2Q80W85 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
Npm2Q80W85 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Npm2Q80W85 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Npm2Q80W85 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Npm2Q80W85 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Npm2Q80W85 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
Npm2Q80W85 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Npm2Q80W85 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Npm2Q80W85 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
Npm2Q80W85 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Npm2Q80W85 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Npm2Q80W85 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Npm2Q80W85 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Npm2Q80W85 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Npm2Q80W85 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Npm2Q80W85 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms