Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62.7■■■■■ 7.63
Abca5Q8K448 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC58.33■■■■■ 6.93
Abca5Q8K448 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
Abca5Q8K448 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.8■■■■■ 6.36
Abca5Q8K448 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.42■■■■■ 6.3
Abca5Q8K448 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.39■■■■■ 6.14
Abca5Q8K448 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
Abca5Q8K448 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.73■■■■■ 6.03
Abca5Q8K448 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
Abca5Q8K448 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
Abca5Q8K448 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.22■■■■■ 5.95
Abca5Q8K448 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
Abca5Q8K448 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51.06■■■■■ 5.76
Abca5Q8K448 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.63■■■■■ 5.7
Abca5Q8K448 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
Abca5Q8K448 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
Abca5Q8K448 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
Abca5Q8K448 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
Abca5Q8K448 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.6
Abca5Q8K448 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50■■■■■ 5.59
Abca5Q8K448 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Abca5Q8K448 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
Abca5Q8K448 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
Abca5Q8K448 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.58■■■■■ 5.53
Abca5Q8K448 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.54■■■■■ 5.52
Abca5Q8K448 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
Abca5Q8K448 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
Abca5Q8K448 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Abca5Q8K448 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
Abca5Q8K448 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
Abca5Q8K448 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
Abca5Q8K448 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
Abca5Q8K448 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
Abca5Q8K448 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
Abca5Q8K448 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.44■■■■■ 5.35
Abca5Q8K448 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
Abca5Q8K448 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Abca5Q8K448 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.97■■■■■ 5.27
Abca5Q8K448 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abca5Q8K448 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
Abca5Q8K448 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Abca5Q8K448 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
Abca5Q8K448 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.54■■■■■ 5.2
Abca5Q8K448 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Abca5Q8K448 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
Abca5Q8K448 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
Abca5Q8K448 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Abca5Q8K448 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Abca5Q8K448 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
Abca5Q8K448 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
Abca5Q8K448 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.11
Abca5Q8K448 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Abca5Q8K448 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
Abca5Q8K448 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
Abca5Q8K448 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
Abca5Q8K448 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Abca5Q8K448 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
Abca5Q8K448 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Abca5Q8K448 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
Abca5Q8K448 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Abca5Q8K448 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Abca5Q8K448 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Abca5Q8K448 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
Abca5Q8K448 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Abca5Q8K448 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Abca5Q8K448 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Abca5Q8K448 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abca5Q8K448 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Abca5Q8K448 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
Abca5Q8K448 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
Abca5Q8K448 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abca5Q8K448 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abca5Q8K448 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abca5Q8K448 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abca5Q8K448 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Abca5Q8K448 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Abca5Q8K448 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
Abca5Q8K448 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abca5Q8K448 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abca5Q8K448 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Abca5Q8K448 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
Abca5Q8K448 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Abca5Q8K448 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Abca5Q8K448 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
Abca5Q8K448 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Abca5Q8K448 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Abca5Q8K448 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Abca5Q8K448 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Abca5Q8K448 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abca5Q8K448 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abca5Q8K448 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abca5Q8K448 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Abca5Q8K448 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Abca5Q8K448 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
Abca5Q8K448 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Abca5Q8K448 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
Abca5Q8K448 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Abca5Q8K448 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abca5Q8K448 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Abca5Q8K448 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms