Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.65■■■■■ 7.46
Fndc1E9Q043 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57.65■■■■■ 6.82
Fndc1E9Q043 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.42■■■■■ 6.62
Fndc1E9Q043 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54.08■■■■■ 6.25
Fndc1E9Q043 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.8■■■■■ 6.04
Fndc1E9Q043 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
Fndc1E9Q043 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
Fndc1E9Q043 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
Fndc1E9Q043 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
Fndc1E9Q043 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
Fndc1E9Q043 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.27■■■■■ 5.8
Fndc1E9Q043 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.79■■■■■ 5.72
Fndc1E9Q043 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
Fndc1E9Q043 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.3■■■■■ 5.64
Fndc1E9Q043 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
Fndc1E9Q043 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50.17■■■■■ 5.62
Fndc1E9Q043 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
Fndc1E9Q043 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
Fndc1E9Q043 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
Fndc1E9Q043 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49.03■■■■■ 5.44
Fndc1E9Q043 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
Fndc1E9Q043 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.78■■■■■ 5.4
Fndc1E9Q043 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Fndc1E9Q043 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
Fndc1E9Q043 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Fndc1E9Q043 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Fndc1E9Q043 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
Fndc1E9Q043 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
Fndc1E9Q043 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Fndc1E9Q043 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Fndc1E9Q043 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Fndc1E9Q043 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Fndc1E9Q043 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
Fndc1E9Q043 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Fndc1E9Q043 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Fndc1E9Q043 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
Fndc1E9Q043 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
Fndc1E9Q043 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Fndc1E9Q043 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
Fndc1E9Q043 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Fndc1E9Q043 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Fndc1E9Q043 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Fndc1E9Q043 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Fndc1E9Q043 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
Fndc1E9Q043 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Fndc1E9Q043 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Fndc1E9Q043 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Fndc1E9Q043 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Fndc1E9Q043 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
Fndc1E9Q043 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Fndc1E9Q043 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
Fndc1E9Q043 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Fndc1E9Q043 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Fndc1E9Q043 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
Fndc1E9Q043 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Fndc1E9Q043 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Fndc1E9Q043 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Fndc1E9Q043 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Fndc1E9Q043 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
Fndc1E9Q043 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Fndc1E9Q043 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Fndc1E9Q043 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Fndc1E9Q043 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
Fndc1E9Q043 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Fndc1E9Q043 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Fndc1E9Q043 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Fndc1E9Q043 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Fndc1E9Q043 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
Fndc1E9Q043 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Fndc1E9Q043 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Fndc1E9Q043 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Fndc1E9Q043 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Fndc1E9Q043 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Fndc1E9Q043 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Fndc1E9Q043 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Fndc1E9Q043 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Fndc1E9Q043 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Fndc1E9Q043 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
Fndc1E9Q043 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Fndc1E9Q043 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Fndc1E9Q043 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Fndc1E9Q043 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Fndc1E9Q043 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Fndc1E9Q043 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
Fndc1E9Q043 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Fndc1E9Q043 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Fndc1E9Q043 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fndc1E9Q043 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Fndc1E9Q043 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Fndc1E9Q043 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Fndc1E9Q043 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Fndc1E9Q043 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
Fndc1E9Q043 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Fndc1E9Q043 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Fndc1E9Q043 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Fndc1E9Q043 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Fndc1E9Q043 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Fndc1E9Q043 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Fndc1E9Q043 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Fndc1E9Q043 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms