Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60.95■■■■■ 7.35
Erich3F6QRE9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.52■■■■■ 6.64
Erich3F6QRE9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
Erich3F6QRE9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53.36■■■■■ 6.13
Erich3F6QRE9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.09■■■■■ 6.09
Erich3F6QRE9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.48■■■■■ 5.99
Erich3F6QRE9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
Erich3F6QRE9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
Erich3F6QRE9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
Erich3F6QRE9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
Erich3F6QRE9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.8■■■■■ 5.72
Erich3F6QRE9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
Erich3F6QRE9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
Erich3F6QRE9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
Erich3F6QRE9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
Erich3F6QRE9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Erich3F6QRE9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
Erich3F6QRE9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.21■■■■■ 5.47
Erich3F6QRE9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Erich3F6QRE9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.95■■■■■ 5.43
Erich3F6QRE9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.86■■■■■ 5.41
Erich3F6QRE9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
Erich3F6QRE9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.57■■■■■ 5.37
Erich3F6QRE9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Erich3F6QRE9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Erich3F6QRE9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Erich3F6QRE9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Erich3F6QRE9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.38■■■■■ 5.34
Erich3F6QRE9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Erich3F6QRE9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Erich3F6QRE9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Erich3F6QRE9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
Erich3F6QRE9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Erich3F6QRE9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Erich3F6QRE9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
Erich3F6QRE9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
Erich3F6QRE9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Erich3F6QRE9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
Erich3F6QRE9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Erich3F6QRE9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Erich3F6QRE9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Erich3F6QRE9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Erich3F6QRE9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
Erich3F6QRE9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Erich3F6QRE9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Erich3F6QRE9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Erich3F6QRE9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Erich3F6QRE9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
Erich3F6QRE9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Erich3F6QRE9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Erich3F6QRE9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Erich3F6QRE9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Erich3F6QRE9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Erich3F6QRE9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
Erich3F6QRE9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Erich3F6QRE9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
Erich3F6QRE9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.82■■■■■ 4.93
Erich3F6QRE9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Erich3F6QRE9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Erich3F6QRE9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
Erich3F6QRE9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Erich3F6QRE9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Erich3F6QRE9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Erich3F6QRE9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Erich3F6QRE9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Erich3F6QRE9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
Erich3F6QRE9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
Erich3F6QRE9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Erich3F6QRE9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Erich3F6QRE9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Erich3F6QRE9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
Erich3F6QRE9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Erich3F6QRE9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Erich3F6QRE9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Erich3F6QRE9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Erich3F6QRE9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Erich3F6QRE9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Erich3F6QRE9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Erich3F6QRE9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Erich3F6QRE9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Erich3F6QRE9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Erich3F6QRE9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Erich3F6QRE9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Erich3F6QRE9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Erich3F6QRE9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Erich3F6QRE9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Erich3F6QRE9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Erich3F6QRE9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
Erich3F6QRE9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Erich3F6QRE9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Erich3F6QRE9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Erich3F6QRE9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Erich3F6QRE9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Erich3F6QRE9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Erich3F6QRE9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Erich3F6QRE9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Erich3F6QRE9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Erich3F6QRE9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Erich3F6QRE9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Erich3F6QRE9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms