Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC62■■■■■ 7.52
HrcG5E8J6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.2■■■■■ 6.75
HrcG5E8J6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.92■■■■■ 6.7
HrcG5E8J6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.25■■■■■ 6.6
HrcG5E8J6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.81■■■■■ 6.52
HrcG5E8J6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.38■■■■■ 6.46
HrcG5E8J6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.89■■■■■ 6.38
HrcG5E8J6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.94■■■■■ 6.23
HrcG5E8J6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.48■■■■■ 6.15
HrcG5E8J6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
HrcG5E8J6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC53.13■■■■■ 6.1
HrcG5E8J6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
HrcG5E8J6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52.55■■■■■ 6
HrcG5E8J6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
HrcG5E8J6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
HrcG5E8J6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
HrcG5E8J6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51.84■■■■■ 5.89
HrcG5E8J6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
HrcG5E8J6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
HrcG5E8J6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
HrcG5E8J6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
HrcG5E8J6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
HrcG5E8J6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
HrcG5E8J6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
HrcG5E8J6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
HrcG5E8J6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
HrcG5E8J6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
HrcG5E8J6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
HrcG5E8J6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
HrcG5E8J6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
HrcG5E8J6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC50.62■■■■■ 5.69
HrcG5E8J6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.59■■■■■ 5.69
HrcG5E8J6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
HrcG5E8J6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
HrcG5E8J6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
HrcG5E8J6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
HrcG5E8J6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
HrcG5E8J6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
HrcG5E8J6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
HrcG5E8J6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
HrcG5E8J6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
HrcG5E8J6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.32■■■■■ 5.49
HrcG5E8J6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
HrcG5E8J6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
HrcG5E8J6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
HrcG5E8J6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
HrcG5E8J6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
HrcG5E8J6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC48.98■■■■■ 5.43
HrcG5E8J6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
HrcG5E8J6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
HrcG5E8J6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
HrcG5E8J6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
HrcG5E8J6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
HrcG5E8J6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
HrcG5E8J6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
HrcG5E8J6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
HrcG5E8J6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
HrcG5E8J6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.53■■■■■ 5.36
HrcG5E8J6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
HrcG5E8J6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.35■■■■■ 5.33
HrcG5E8J6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.32
HrcG5E8J6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
HrcG5E8J6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
HrcG5E8J6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC48.12■■■■■ 5.29
HrcG5E8J6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
HrcG5E8J6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.08■■■■■ 5.29
HrcG5E8J6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
HrcG5E8J6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
HrcG5E8J6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
HrcG5E8J6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
HrcG5E8J6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
HrcG5E8J6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
HrcG5E8J6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
HrcG5E8J6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
HrcG5E8J6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
HrcG5E8J6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
HrcG5E8J6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.18
HrcG5E8J6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
HrcG5E8J6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
HrcG5E8J6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
HrcG5E8J6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
HrcG5E8J6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
HrcG5E8J6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
HrcG5E8J6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
HrcG5E8J6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
HrcG5E8J6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
HrcG5E8J6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
HrcG5E8J6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
HrcG5E8J6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
HrcG5E8J6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
HrcG5E8J6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
HrcG5E8J6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
HrcG5E8J6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
HrcG5E8J6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
HrcG5E8J6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
HrcG5E8J6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
HrcG5E8J6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
HrcG5E8J6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
HrcG5E8J6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46.63■■■■■ 5.06
HrcG5E8J6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms