Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.15■■■■■ 7.86
Abcc1O35379 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.88■■■■■ 7.18
Abcc1O35379 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.66■■■■■ 6.98
Abcc1O35379 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.19■■■■■ 6.59
Abcc1O35379 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55.12■■■■■ 6.41
Abcc1O35379 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
Abcc1O35379 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.24
Abcc1O35379 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.89■■■■■ 6.22
Abcc1O35379 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
Abcc1O35379 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
Abcc1O35379 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.38■■■■■ 6.14
Abcc1O35379 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
Abcc1O35379 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
Abcc1O35379 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.15■■■■■ 5.94
Abcc1O35379 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.09■■■■■ 5.93
Abcc1O35379 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
Abcc1O35379 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
Abcc1O35379 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
Abcc1O35379 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.97■■■■■ 5.75
Abcc1O35379 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.95■■■■■ 5.75
Abcc1O35379 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
Abcc1O35379 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.91■■■■■ 5.74
Abcc1O35379 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
Abcc1O35379 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
Abcc1O35379 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
Abcc1O35379 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
Abcc1O35379 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
Abcc1O35379 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
Abcc1O35379 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
Abcc1O35379 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
Abcc1O35379 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
Abcc1O35379 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.02■■■■■ 5.44
Abcc1O35379 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Abcc1O35379 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
Abcc1O35379 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.58■■■■■ 5.37
Abcc1O35379 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.53■■■■■ 5.36
Abcc1O35379 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
Abcc1O35379 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
Abcc1O35379 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
Abcc1O35379 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Abcc1O35379 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
Abcc1O35379 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.37■■■■■ 5.33
Abcc1O35379 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Abcc1O35379 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Abcc1O35379 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
Abcc1O35379 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
Abcc1O35379 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
Abcc1O35379 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
Abcc1O35379 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc1O35379 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Abcc1O35379 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
Abcc1O35379 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Abcc1O35379 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
Abcc1O35379 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Abcc1O35379 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Abcc1O35379 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Abcc1O35379 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Abcc1O35379 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Abcc1O35379 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Abcc1O35379 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Abcc1O35379 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Abcc1O35379 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Abcc1O35379 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Abcc1O35379 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Abcc1O35379 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Abcc1O35379 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Abcc1O35379 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Abcc1O35379 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
Abcc1O35379 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
Abcc1O35379 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc1O35379 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Abcc1O35379 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
Abcc1O35379 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Abcc1O35379 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Abcc1O35379 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc1O35379 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Abcc1O35379 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Abcc1O35379 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc1O35379 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc1O35379 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc1O35379 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Abcc1O35379 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc1O35379 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc1O35379 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc1O35379 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
Abcc1O35379 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc1O35379 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc1O35379 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Abcc1O35379 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Abcc1O35379 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
Abcc1O35379 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Abcc1O35379 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms