RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pla2r1Q62028 1487 aa30.47■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cux1P53564 1515 aa30.46■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Setd5Q5XJV7 1441 aa30.42■■■□□ 2.46
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ift140E9PY46 1464 aa30.4■■■□□ 2.46
Msx1-201ENSMUST00000063116 Grin2aP35436 1464 aa30.4■■■□□ 2.46
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa30.36■■■□□ 2.45
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gpatch8A2A6A1 1505 aa30.33■■■□□ 2.45
Msx1-201ENSMUST00000063116 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
Msx1-201ENSMUST00000063116 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pcf11G3X9Z4 1553 aa30.28■■■□□ 2.44
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fyco1Q8VDC1 1437 aa30.23■■■□□ 2.43
Msx1-201ENSMUST00000063116 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa30.22■■■□□ 2.43
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa30.22■■■□□ 2.43
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rpap1Q80TE0 1409 aa30.21■■■□□ 2.43
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adamts12Q811B3 1600 aa30.19■■■□□ 2.42
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tiam1Q60610 1591 aa30.19■■■□□ 2.42
Msx1-201ENSMUST00000063116 WizO88286 1684 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca5Q8K448 1642 aa30.14■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 CadpsQ80TJ1 1355 aa30.13■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Naip1Q9QWK5 1403 aa30.11■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 UbtfP25976 765 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca16E9PWJ7 1678 aa30.1■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slx4Q6P1D7 1565 aa30.09■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa30.09■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa30.08■■■□□ 2.41
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rusc2Q80U22 1514 aa30.06■■■□□ 2.4
Msx1-201ENSMUST00000063116 PxdnQ3UQ28 1475 aa30.05■■■□□ 2.4
Msx1-201ENSMUST00000063116 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa30.04■■■□□ 2.4
Msx1-201ENSMUST00000063116 CntlnA2AM05 1397 aa30.01■■■□□ 2.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mier1Q5UAK0 511 aa30■■■□□ 2.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 Peg3Q3URU2 1571 aa30■■■□□ 2.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 BlmO88700 1416 aa29.99■■■□□ 2.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aebp1Q640N1 1128 aa29.98■■■□□ 2.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 Soga1E1U8D0 1418 aa29.97■■■□□ 2.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc2Q8VI47 1543 aa29.94■■■□□ 2.38
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa29.84■■■□□ 2.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa29.84■■■□□ 2.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmod2Q3UHZ5 550 aa29.75■■■□□ 2.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Shroom2A2ALU4 1481 aa29.75■■■□□ 2.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgap27A2AB59 869 aa29.75■■■□□ 2.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 WrnO09053 1401 aa29.73■■■□□ 2.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k4O08648 1597 aa29.72■■■□□ 2.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif27Q7M6Z4 1394 aa29.7■■■□□ 2.34
Msx1-201ENSMUST00000063116 BC005561E9Q5E2 1589 aa29.65■■■□□ 2.34
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa29.59■■■□□ 2.33
Msx1-201ENSMUST00000063116 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa29.57■■■□□ 2.32
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa29.55■■■□□ 2.32
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fgd6Q69ZL1 1399 aa29.54■■■□□ 2.32
Msx1-201ENSMUST00000063116 Neo1P97798 1493 aa29.51■■■□□ 2.31
Msx1-201ENSMUST00000063116 NexmifQ5DTT1 1515 aa29.49■■■□□ 2.31
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kdm5bQ80Y84 1544 aa29.48■■■□□ 2.31
Msx1-201ENSMUST00000063116 NefmP08553 848 aa29.47■■■□□ 2.31
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgef11Q68FM7 1552 aa29.47■■■□□ 2.31
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gcc2Q8CHG3 1679 aa29.46■■■□□ 2.31
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ncoa3O09000 1398 aa29.45■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mug1P28665 1476 aa29.44■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa29.44■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccnb3Q810T2 1396 aa29.42■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 AknaQ80VW7 1404 aa29.42■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa29.4■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mroh2aD3Z750 1679 aa29.39■■■□□ 2.3
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa29.36■■■□□ 2.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Jph4Q80WT0 628 aa29.35■■■□□ 2.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa29.34■■■□□ 2.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ncoa2Q61026 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chd1P40201 1711 aa29.31■■■□□ 2.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 A2mQ6GQT1 1474 aa29.31■■■□□ 2.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc1O35379 1528 aa29.28■■■□□ 2.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Magi1Q6RHR9 1471 aa29.27■■■□□ 2.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Naip2Q9QUK4 1447 aa29.25■■■□□ 2.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm14025A2AP89 1413 aa29.24■■■□□ 2.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prex2Q3LAC4 1598 aa29.21■■■□□ 2.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa29.21■■■□□ 2.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa29.17■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam163aQ8CAA5 168 aa29.17■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adcy10Q8C0T9 1614 aa29.16■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cul7Q8VE73 1689 aa29.15■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fhad1A6PWD2 1420 aa29.14■■■□□ 2.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa29.13■■■□□ 2.25
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mia2Q91ZV0 1396 aa29.12■■■□□ 2.25
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fancd2Q80V62 1450 aa29.1■■■□□ 2.25
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vps8Q0P5W1 1427 aa29.09■■■□□ 2.25
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
Msx1-201ENSMUST00000063116 NhsB1AV60 1647 aa29.03■■■□□ 2.24
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa29.03■■■□□ 2.24
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc5Q9R1X5 1436 aa29.03■■■□□ 2.24
Msx1-201ENSMUST00000063116 UacaQ8CGB3 1411 aa29■■■□□ 2.23
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chic2Q9D9G3 165 aa28.99■■■□□ 2.23
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa28.97■■■□□ 2.23
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