Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60.16■■■■■ 7.22
Lmod2Q3UHZ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.75■■■■■ 6.52
Lmod2Q3UHZ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.33■■■■■ 5.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.24■■■■■ 5.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51.21■■■■■ 5.79
Lmod2Q3UHZ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
Lmod2Q3UHZ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.73
Lmod2Q3UHZ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
Lmod2Q3UHZ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.12■■■■■ 5.61
Lmod2Q3UHZ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
Lmod2Q3UHZ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
Lmod2Q3UHZ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
Lmod2Q3UHZ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Lmod2Q3UHZ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
Lmod2Q3UHZ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.32■■■■■ 5.33
Lmod2Q3UHZ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Lmod2Q3UHZ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
Lmod2Q3UHZ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.12■■■■■ 5.29
Lmod2Q3UHZ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
Lmod2Q3UHZ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Lmod2Q3UHZ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
Lmod2Q3UHZ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
Lmod2Q3UHZ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Lmod2Q3UHZ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Lmod2Q3UHZ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Lmod2Q3UHZ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
Lmod2Q3UHZ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
Lmod2Q3UHZ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Lmod2Q3UHZ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Lmod2Q3UHZ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Lmod2Q3UHZ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Lmod2Q3UHZ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Lmod2Q3UHZ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Lmod2Q3UHZ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
Lmod2Q3UHZ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
Lmod2Q3UHZ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Lmod2Q3UHZ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Lmod2Q3UHZ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
Lmod2Q3UHZ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Lmod2Q3UHZ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Lmod2Q3UHZ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Lmod2Q3UHZ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Lmod2Q3UHZ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Lmod2Q3UHZ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
Lmod2Q3UHZ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Lmod2Q3UHZ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Lmod2Q3UHZ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Lmod2Q3UHZ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Lmod2Q3UHZ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Lmod2Q3UHZ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
Lmod2Q3UHZ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Lmod2Q3UHZ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Lmod2Q3UHZ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Lmod2Q3UHZ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Lmod2Q3UHZ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Lmod2Q3UHZ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Lmod2Q3UHZ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
Lmod2Q3UHZ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Lmod2Q3UHZ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Lmod2Q3UHZ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Lmod2Q3UHZ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Lmod2Q3UHZ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Lmod2Q3UHZ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Lmod2Q3UHZ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Lmod2Q3UHZ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Lmod2Q3UHZ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Lmod2Q3UHZ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Lmod2Q3UHZ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Lmod2Q3UHZ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Lmod2Q3UHZ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lmod2Q3UHZ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Lmod2Q3UHZ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Lmod2Q3UHZ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Lmod2Q3UHZ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Lmod2Q3UHZ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Lmod2Q3UHZ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Lmod2Q3UHZ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Lmod2Q3UHZ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Lmod2Q3UHZ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms