RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 NischQ80TM9 1593 aa41.01■■■■■ 4.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41■■■■■ 4.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc9P70170 1546 aa39.85■■■■□ 3.97
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc8B2RUS7 1588 aa39.29■■■■□ 3.88
Msx1-201ENSMUST00000063116 ScribQ80U72 1612 aa37.19■■■■□ 3.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rhox8Q6VSS7 320 aa36.68■■■■□ 3.46
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dcaf1Q80TR8 1506 aa36.48■■■■□ 3.43
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kdm5dQ62240 1548 aa36.2■■■■□ 3.39
Msx1-201ENSMUST00000063116 NacadQ5SWP3 1504 aa36.02■■■■□ 3.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa35.87■■■■□ 3.33
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc180J3QNE4 1664 aa35.57■■■■□ 3.29
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rtl1Q7M732 1744 aa35.55■■■■□ 3.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Baz1aO88379 1555 aa35.43■■■■□ 3.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35.3■■■■□ 3.24
Msx1-201ENSMUST00000063116 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.01■■■■□ 3.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 BicraF8VPZ9 1578 aa34.69■■■■□ 3.14
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
Msx1-201ENSMUST00000063116 Smarca2Q6DIC0 1577 aa34.58■■■■□ 3.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa34.17■■■■□ 3.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa33.97■■■■□ 3.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim41Q5NCC3 630 aa33.57■■■□□ 2.96
Msx1-201ENSMUST00000063116 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
Msx1-201ENSMUST00000063116 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
Msx1-201ENSMUST00000063116 Synj1Q8CHC4 1574 aa33.5■■■□□ 2.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 CftrP26361 1476 aa33.37■■■□□ 2.93
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa33.29■■■□□ 2.92
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
Msx1-201ENSMUST00000063116 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33.2■■■□□ 2.91
Msx1-201ENSMUST00000063116 HrcG5E8J6 738 aa33.06■■■□□ 2.88
Msx1-201ENSMUST00000063116 Golga3P55937 1487 aa32.93■■■□□ 2.86
Msx1-201ENSMUST00000063116 Top2bQ64511 1612 aa32.81■■■□□ 2.84
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cngb1E1AZ71 1325 aa32.75■■■□□ 2.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32.7■■■□□ 2.83
Msx1-201ENSMUST00000063116 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32.68■■■□□ 2.82
Msx1-201ENSMUST00000063116 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ercc6F8VPZ5 1481 aa32.58■■■□□ 2.81
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa32.5■■■□□ 2.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep164Q5DU05 1446 aa32.49■■■□□ 2.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa32.49■■■□□ 2.79
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chic1Q8CBW7 227 aa32.43■■■□□ 2.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32.43■■■□□ 2.78
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fmn1Q05860 1466 aa32.26■■■□□ 2.75
Msx1-201ENSMUST00000063116 TnnQ80Z71 1560 aa32.16■■■□□ 2.74
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32.08■■■□□ 2.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam135aQ6NS59 1506 aa32.08■■■□□ 2.73
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
Msx1-201ENSMUST00000063116 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif15Q6P9L6 1387 aa31.89■■■□□ 2.7
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gab3Q8BSM5 595 aa31.82■■■□□ 2.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.79■■■□□ 2.68
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ubl4bQ9CQ84 188 aa31.72■■■□□ 2.67
Msx1-201ENSMUST00000063116 Camsap1A2AHC3 1581 aa31.67■■■□□ 2.66
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa31.58■■■□□ 2.65
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cux2P70298 1426 aa31.58■■■□□ 2.65
Msx1-201ENSMUST00000063116 Baz1bQ9Z277 1479 aa31.51■■■□□ 2.64
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc18Q640L5 1455 aa31.48■■■□□ 2.63
Msx1-201ENSMUST00000063116 Il27Q8K3I6 234 aa31.43■■■□□ 2.62
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtprkP35822 1457 aa31.35■■■□□ 2.61
Msx1-201ENSMUST00000063116 Grin2bQ01097 1482 aa31.35■■■□□ 2.61
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
Msx1-201ENSMUST00000063116 NrkQ9R0G8 1455 aa31.31■■■□□ 2.6
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep162Q6ZQ06 1403 aa31.3■■■□□ 2.6
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mrc2Q64449 1479 aa31.3■■■□□ 2.6
Msx1-201ENSMUST00000063116 Shroom4Q1W617 1475 aa31.25■■■□□ 2.59
Msx1-201ENSMUST00000063116 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
Msx1-201ENSMUST00000063116 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
Msx1-201ENSMUST00000063116 Npm2Q80W85 207 aa31.14■■■□□ 2.57
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif21aQ9QXL2 1672 aa31.13■■■□□ 2.57
Msx1-201ENSMUST00000063116 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgap35Q91YM2 1499 aa31.09■■■□□ 2.57
Msx1-201ENSMUST00000063116 Duox2A2AQ99 1517 aa31.03■■■□□ 2.56
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Msx1-201ENSMUST00000063116 Efcab5A0JP43 1406 aa31.01■■■□□ 2.55
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k1P53349 1493 aa30.92■■■□□ 2.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myt1lP97500 1187 aa30.92■■■□□ 2.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa30.91■■■□□ 2.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Crocc2F6XLV1 1638 aa30.91■■■□□ 2.54
Msx1-201ENSMUST00000063116 Samd9lQ69Z37 1561 aa30.88■■■□□ 2.53
Msx1-201ENSMUST00000063116 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa30.72■■■□□ 2.51
Msx1-201ENSMUST00000063116 SynmQ70IV5 1561 aa30.69■■■□□ 2.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Clip1Q922J3 1391 aa30.68■■■□□ 2.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Plb1Q3TTY0 1478 aa30.68■■■□□ 2.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zeb1Q64318 1117 aa30.67■■■□□ 2.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rad54l2Q99NG0 1466 aa30.63■■■□□ 2.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30.62■■■□□ 2.49
Msx1-201ENSMUST00000063116 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Carmil1Q6EDY6 1374 aa30.57■■■□□ 2.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ankrd26Q811D2 1581 aa30.52■■■□□ 2.48
Msx1-201ENSMUST00000063116 Setd1bQ8CFT2 1985 aa30.51■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Magi3Q9EQJ9 1476 aa30.5■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eea1Q8BL66 1411 aa30.5■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Disp1Q3TDN0 1521 aa30.5■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Erich3F6QRE9 1637 aa30.49■■■□□ 2.47
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arap1Q4LDD4 1452 aa30.49■■■□□ 2.47
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